Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 OR1L6-202ENST00000373684 1044 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 RNA5SP105-201ENST00000391123 113 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 DEFB113-201ENST00000398718 249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 MTCO1P56-201ENST00000401674 224 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 NPM1P38-201ENST00000403835 865 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 RPL31-206ENST00000409650 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 AL008987.1-201ENST00000415528 237 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 MORF4L1P6-201ENST00000418771 268 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 MTCYBP12-201ENST00000440559 1134 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 AC003001.1-201ENST00000443247 1135 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 LINC01828-201ENST00000445514 531 ntTSL 4 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 NOP56P2-201ENST00000447491 769 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 AL512658.1-201ENST00000449072 533 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 LINC00709-201ENST00000458168 494 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 C1orf185-202ENST00000467127 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 AC079910.1-201ENST00000477099 749 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 MTND2P14-201ENST00000482139 351 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 BET1P1-201ENST00000482276 359 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 AC083982.1-201ENST00000485679 344 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 DUBR-205ENST00000495228 411 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 RPS26P24-201ENST00000497656 331 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 FXN-205ENST00000498653 856 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 AC093909.2-201ENST00000505178 437 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 MGST2-204ENST00000506797 634 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 AC108120.2-201ENST00000512973 294 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 UBE2Q2P10-201ENST00000514854 900 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 SNORA3.4-201ENST00000515969 96 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 RNU6-1308P-201ENST00000516817 103 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 ZFAND1-217ENST00000521895 885 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 AP001646.3-201ENST00000526305 446 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 OR5AZ1P-201ENST00000527448 943 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 AP003557.1-202ENST00000528978 562 ntTSL 4 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 AC130404.1-201ENST00000539362 739 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 AC006518.2-201ENST00000542513 940 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 AP002383.3-201ENST00000545958 593 ntTSL 4 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 LINC02290-201ENST00000554187 608 ntTSL 4 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 AC126323.3-201ENST00000565136 564 ntTSL 4 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 AC109446.2-201ENST00000567872 497 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 AC107926.1-201ENST00000581673 621 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 MIR4691-201ENST00000583764 85 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 AC011487.3-201ENST00000593607 453 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 AC011626.1-201ENST00000604710 562 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 AL451086.1-201ENST00000605596 223 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 AC012557.2-201ENST00000605919 418 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 AL589740.1-208ENST00000606913 812 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 AC011374.2-201ENST00000607135 526 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 AC009318.3-201ENST00000616916 503 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 AC013470.2-206ENST00000636804 771 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 THAP6-202ENST00000380837 3423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 DNAH14-208ENST00000430092 13763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 AL450345.1-202ENST00000605741 3881 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 IREB2-201ENST00000258886 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 PLCH1-201ENST00000334686 6128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 FILIP1-201ENST00000237172 4580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 STIL-204ENST00000396221 4558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 TMEM99-201ENST00000301665 2058 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 INTS6P1-201ENST00000504674 2530 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 MECOM-217ENST00000494292 3939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 ZNF284-201ENST00000421176 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 CDC42BPA-204ENST00000366767 9320 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 NPIPB9-201ENST00000357796 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 RBMX-203ENST00000431446 2004 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 GPR18-201ENST00000340807 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 OR5AU1-203ENST00000641697 7755 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 ALMS1-IT1-201ENST00000441587 2107 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 AHNAK-202ENST00000378024 18787 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 AL359538.1-201ENST00000453498 1710 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 TDO2-208ENST00000536354 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 AC011604.2-201ENST00000381541 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 RAET1L-202ENST00000367341 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 RNU1-74P-201ENST00000384108 171 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 SNORD116-1-201ENST00000384335 95 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 SNORA48.4-201ENST00000391089 134 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 FCF1P5-201ENST00000406490 482 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 MTERF4-204ENST00000406593 802 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 HMGB3P31-201ENST00000413333 595 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 LINC01347-201ENST00000417964 355 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 ELOCP9-201ENST00000418624 239 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 AC090960.1-201ENST00000421072 306 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 AC093084.1-201ENST00000424233 687 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 C1DP1-201ENST00000426049 402 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 AC104837.2-201ENST00000427236 424 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 AL122010.1-201ENST00000429293 720 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 STXBP5-AS1-204ENST00000431143 644 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 AL589935.1-218ENST00000434683 529 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 AC093716.1-201ENST00000435923 377 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 AL354863.1-204ENST00000436430 556 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 AL050303.1-201ENST00000444356 458 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 HMGB3P6-201ENST00000444896 598 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 Z80107.2-201ENST00000445127 392 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 AF127577.5-201ENST00000449746 446 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 MRPL35P4-201ENST00000453682 566 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 AC093157.1-204ENST00000454721 753 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 USP9YP25-201ENST00000457708 443 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 AC108161.1-201ENST00000461060 402 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 RPS3AP41-201ENST00000462701 778 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 PLGLA-202ENST00000482249 475 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 RPS3AP22-201ENST00000488297 769 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 RN7SL244P-201ENST00000493405 297 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 IMPA1P1-201ENST00000510718 842 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
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