Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 NECTIN3-AS1-202ENST00000467426 664 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ZNF548Q8NEK5 RPS29P22-201ENST00000472363 168 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ZNF548Q8NEK5 RN7SL814P-201ENST00000487715 300 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ZNF548Q8NEK5 AC007686.1-201ENST00000488511 463 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ZNF548Q8NEK5 AC138965.1-202ENST00000502354 547 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ZNF548Q8NEK5 AC026414.1-201ENST00000504046 698 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ZNF548Q8NEK5 AC140125.3-201ENST00000505248 547 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ZNF548Q8NEK5 LINC02466-202ENST00000509105 653 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ZNF548Q8NEK5 ZCCHC10-207ENST00000509437 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
ZNF548Q8NEK5 AC133963.2-201ENST00000513686 578 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ZNF548Q8NEK5 RN7SKP34-201ENST00000516142 244 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ZNF548Q8NEK5 AC027419.2-201ENST00000518439 497 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ZNF548Q8NEK5 LINC01609-201ENST00000519506 424 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ZNF548Q8NEK5 AP003472.2-201ENST00000523554 639 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ZNF548Q8NEK5 AL590385.2-201ENST00000537821 553 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ZNF548Q8NEK5 AC023050.2-201ENST00000544968 387 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ZNF548Q8NEK5 CR383656.6-201ENST00000550518 394 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ZNF548Q8NEK5 C15orf41-203ENST00000562489 715 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ZNF548Q8NEK5 AP005901.2-201ENST00000581690 525 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ZNF548Q8NEK5 AL139344.1-201ENST00000605228 195 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ZNF548Q8NEK5 AC044839.1-205ENST00000614989 542 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ZNF548Q8NEK5 AL034549.1-201ENST00000615120 578 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ZNF548Q8NEK5 CCL14-204ENST00000622526 472 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ZNF548Q8NEK5 PCBP1-AS1-278ENST00000625518 864 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ZNF548Q8NEK5 AC109462.4-201ENST00000637882 581 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ZNF548Q8NEK5 CEP120-203ENST00000328236 4710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ZNF548Q8NEK5 AC008079.2-201ENST00000623543 20396 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ZNF548Q8NEK5 NCOA3-201ENST00000371997 6750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
ZNF548Q8NEK5 CTAGE5-207ENST00000396165 3071 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
ZNF548Q8NEK5 MYO3A-203ENST00000376302 2723 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
ZNF548Q8NEK5 NPY6R-202ENST00000510937 2988 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ZNF548Q8NEK5 GPR18-202ENST00000397470 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
ZNF548Q8NEK5 RGS4-202ENST00000367908 2606 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ZNF548Q8NEK5 AC104623.2-202ENST00000623477 4002 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ZNF548Q8NEK5 FILIP1-203ENST00000393004 7807 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
ZNF548Q8NEK5 AC112198.2-201ENST00000426589 6996 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ZNF548Q8NEK5 GUCY1A3-201ENST00000296518 4400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
ZNF548Q8NEK5 KCTD16-201ENST00000507359 13950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
ZNF548Q8NEK5 PLD1-203ENST00000356327 5855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
ZNF548Q8NEK5 MOCS2-203ENST00000450852 1337 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
ZNF548Q8NEK5 MFSD8-213ENST00000641134 1327 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ZNF548Q8NEK5 ARHGAP18-201ENST00000368149 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
ZNF548Q8NEK5 MTND5P11-201ENST00000511037 1812 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ZNF548Q8NEK5 PPBP-201ENST00000296028 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
ZNF548Q8NEK5 GNAS-202ENST00000306090 477 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ZNF548Q8NEK5 RN7SKP95-201ENST00000362860 303 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ZNF548Q8NEK5 AP002784.2-201ENST00000397300 549 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ZNF548Q8NEK5 LINC00161-201ENST00000412526 870 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ZNF548Q8NEK5 BTBD9-AS1-201ENST00000412822 560 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ZNF548Q8NEK5 CHEK2P3-201ENST00000416118 248 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ZNF548Q8NEK5 AC023347.1-202ENST00000419223 440 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ZNF548Q8NEK5 AC093422.3-201ENST00000428506 305 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ZNF548Q8NEK5 INTS6L-AS1-201ENST00000430820 398 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ZNF548Q8NEK5 AC015971.1-202ENST00000439077 514 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
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ZNF548Q8NEK5 AC096644.1-201ENST00000446169 390 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
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ZNF548Q8NEK5 ZNF886P-201ENST00000450781 723 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
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ZNF548Q8NEK5 DIAPH2-AS1-204ENST00000579945 974 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
ZNF548Q8NEK5 MYL12B-204ENST00000584539 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ZNF548Q8NEK5 AC092142.2-201ENST00000614642 354 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ZNF548Q8NEK5 MIR3974-201ENST00000637126 96 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ZNF548Q8NEK5 LEUTX-202ENST00000638280 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ZNF548Q8NEK5 THAP12P5-201ENST00000405864 2275 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ZNF548Q8NEK5 C8orf22-201ENST00000303202 1499 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
ZNF548Q8NEK5 MAK-203ENST00000474039 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
ZNF548Q8NEK5 USP50-205ENST00000616326 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ZNF548Q8NEK5 GTF2IRD2P1-202ENST00000618962 3055 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
ZNF548Q8NEK5 AC007996.1-201ENST00000620414 2821 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ZNF548Q8NEK5 PCDH15-209ENST00000395433 6942 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ZNF548Q8NEK5 ZNF33A-201ENST00000307441 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ZNF548Q8NEK5 AK9-204ENST00000424296 6326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ZNF548Q8NEK5 A1CF-205ENST00000374001 9221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ZNF548Q8NEK5 RAP1GDS1-206ENST00000453712 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
ZNF548Q8NEK5 ADCY10-201ENST00000367848 5055 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
ZNF548Q8NEK5 STXBP4-202ENST00000398391 2160 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
ZNF548Q8NEK5 EDA2R-203ENST00000396050 3429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
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