Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 AP000827.1-201ENST00000527814 258 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 AL157938.2-205ENST00000586290 891 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 AC008894.1-201ENST00000587693 367 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 AC023762.1-201ENST00000603280 584 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 MROH9-202ENST00000367759 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 IQCH-214ENST00000629425 1822 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 ASAH2-204ENST00000447815 2311 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 FAM111B-206ENST00000620384 3405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 OR2AT4-203ENST00000641541 8795 ntAPPRIS P1 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 SCN3A-202ENST00000360093 9123 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 CHL1-216ENST00000620033 7311 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 SAMMSON-213ENST00000641336 1521 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 ERGIC2-212ENST00000611644 4961 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 CUL3-216ENST00000617432 1426 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 CDH17-201ENST00000027335 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 CPHL1P-201ENST00000461341 3407 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 PRIM2-202ENST00000370687 909 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 MIR921-201ENST00000401133 56 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 AL034374.1-201ENST00000406329 351 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 AC099060.1-201ENST00000427806 448 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 AP001324.1-201ENST00000428553 399 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 AL122010.1-201ENST00000429293 720 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 AL590999.1-204ENST00000430595 638 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 AP000943.1-201ENST00000438416 712 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 NPM1P33-201ENST00000438918 872 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 DOCK9-AS1-201ENST00000439367 392 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 CBX1P1-201ENST00000440184 427 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 AC114878.1-201ENST00000441166 358 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 AP000302.1-201ENST00000450928 666 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 LINC01150-201ENST00000455671 315 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 AP002345.1-201ENST00000456493 928 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 RPL5P13-201ENST00000462840 709 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 AC112206.1-201ENST00000468416 477 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 AC011276.1-201ENST00000469688 323 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 RPL23AP37-201ENST00000479658 549 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 AC005699.1-205ENST00000510639 427 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 MTCYBP19-201ENST00000517463 1124 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 AP001330.2-201ENST00000523121 979 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 EIF4A2P3-201ENST00000525903 1055 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 AF233439.1-201ENST00000526235 401 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 C11orf74-210ENST00000534635 801 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 AC069437.1-201ENST00000551372 512 ntTSL 4 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 AC084783.1-201ENST00000565846 910 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 AC023575.1-201ENST00000580510 358 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 PSMG2-204ENST00000585331 983 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 MIMT1-201ENST00000597105 1050 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 AL020997.2-201ENST00000602607 184 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 AC008782.1-201ENST00000603386 430 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 AC005191.1-201ENST00000603950 358 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 AC115286.1-201ENST00000604298 434 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 AP004372.1-201ENST00000604842 844 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 AC005962.2-201ENST00000611427 652 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 AC022106.2-201ENST00000620114 757 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 ATL2-217ENST00000629272 1242 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 AC004982.1-201ENST00000608770 1655 ntTSL 4 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 CASC17-201ENST00000569074 2059 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 ADNP-201ENST00000349014 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 OTC-201ENST00000039007 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 AC108467.2-201ENST00000617640 1597 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 IQCH-202ENST00000358767 3062 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 CSPP1-203ENST00000519668 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 NBPF10-201ENST00000583866 13042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 OR6K3-201ENST00000368145 1844 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 CNTN5-207ENST00000527185 4303 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 OR56B2P-202ENST00000641377 2453 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 FAM135A-210ENST00000505868 5173 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 CTSS-201ENST00000368985 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 TCP11X1-202ENST00000622971 1372 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 AL360270.1-201ENST00000440689 2359 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 CFAP70-201ENST00000310715 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 RAD17P1-201ENST00000418130 2042 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 NFIB-211ENST00000606230 2311 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 EPHA7-202ENST00000369303 6588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 C15orf41-212ENST00000567389 2618 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 TEX35-205ENST00000367643 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 UBBP2-201ENST00000376781 231 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 CDKN3-203ENST00000395577 637 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 NPM1P10-201ENST00000398310 865 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 EI24P3-201ENST00000399046 1062 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 OTUD6B-202ENST00000404789 1089 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 AL590806.1-201ENST00000415818 853 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 AC066595.1-201ENST00000426697 399 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 LINC00458-202ENST00000427299 1030 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 LIX1L-AS1-205ENST00000437797 536 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 RPL23AP93-201ENST00000440847 484 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 Z99127.2-201ENST00000441426 334 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 RPL23AP43-201ENST00000446445 471 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 AL627224.1-201ENST00000448334 444 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 PPIAP21-201ENST00000464473 501 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 AC109327.1-201ENST00000471666 403 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 AC113382.2-201ENST00000506911 646 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 FABP5P6-201ENST00000510588 409 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 AC034244.2-201ENST00000514668 858 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 RNU6-760P-201ENST00000516078 97 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 FTH1P11-201ENST00000517577 551 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 RAD21-204ENST00000518055 896 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 AC021242.2-201ENST00000522765 454 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 PTH-202ENST00000529816 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 MFAP5-205ENST00000535336 566 ntTSL 4 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 MIR3936-201ENST00000584304 110 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 152.7 ms