Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 AL049536.1-201ENST00000625043 744 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
VPS72Q15906 RNA5SP196-201ENST00000625967 102 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
VPS72Q15906 SATB1-AS1-259ENST00000629477 853 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
VPS72Q15906 CCDC25-212ENST00000640944 261 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
VPS72Q15906 TCF7L2-217ENST00000536810 3953 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
VPS72Q15906 CUL3-216ENST00000617432 1426 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
VPS72Q15906 LPAR4-205ENST00000614823 2155 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.48□□□□□ -1.37
VPS72Q15906 CLCA3P-201ENST00000284054 2407 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
VPS72Q15906 SCN1A-217ENST00000637988 8562 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
VPS72Q15906 LINC01189-201ENST00000428440 3321 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
VPS72Q15906 EPB41L2-226ENST00000530757 4360 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
VPS72Q15906 FCHSD2-208ENST00000458644 2215 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
VPS72Q15906 OR52E5-201ENST00000610445 2244 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
VPS72Q15906 PMP2-201ENST00000256103 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
VPS72Q15906 AC087257.1-201ENST00000506925 2639 ntTSL 4 BASIC6.47□□□□□ -1.37
VPS72Q15906 LIPJ-201ENST00000371939 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
VPS72Q15906 SLC4A7-206ENST00000428386 7385 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
VPS72Q15906 SLAIN1-202ENST00000314070 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
VPS72Q15906 ERVH48-1-201ENST00000447535 2790 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
VPS72Q15906 KCNAB1-205ENST00000471742 3301 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
VPS72Q15906 RAD17P1-201ENST00000418130 2042 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
VPS72Q15906 FTO-204ENST00000463855 3056 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
VPS72Q15906 FBXO3-213ENST00000534136 3217 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
VPS72Q15906 ZNF525-201ENST00000467003 6107 ntTSL 4 BASIC6.47□□□□□ -1.37
VPS72Q15906 CDKL3-210ENST00000523832 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
VPS72Q15906 BEND2-201ENST00000380030 1938 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
VPS72Q15906 SYTL2-204ENST00000389958 1943 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
VPS72Q15906 NBPF19-201ENST00000369227 3670 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
VPS72Q15906 ZNF528-203ENST00000391788 4209 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
VPS72Q15906 RNASE2-201ENST00000304625 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
VPS72Q15906 OR4K13-201ENST00000315693 915 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
VPS72Q15906 RNU6-792P-201ENST00000363490 107 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
VPS72Q15906 CTNNAL1-203ENST00000374594 824 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
VPS72Q15906 TRGV11-201ENST00000390340 463 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
VPS72Q15906 ATP5F1P2-201ENST00000398143 760 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
VPS72Q15906 RNA5SP44-201ENST00000410446 133 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
VPS72Q15906 RNA5SP498-201ENST00000411342 120 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
VPS72Q15906 RPL21P108-201ENST00000413857 481 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
VPS72Q15906 CEACAMP8-201ENST00000413902 580 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
VPS72Q15906 TBCAP2-201ENST00000416175 326 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
VPS72Q15906 BBIP1-203ENST00000423273 492 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
VPS72Q15906 AC006041.1-201ENST00000425322 328 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
VPS72Q15906 LINC00458-202ENST00000427299 1030 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
VPS72Q15906 PPEF1-AS1-201ENST00000430641 430 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
VPS72Q15906 TRBV26OR9-2-201ENST00000432077 293 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
VPS72Q15906 LINC01826-201ENST00000432894 584 ntTSL 4 BASIC6.47□□□□□ -1.37
VPS72Q15906 MTCYBP31-201ENST00000438855 1122 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
VPS72Q15906 LARS2-AS1-201ENST00000442534 575 ntTSL 4 BASIC6.47□□□□□ -1.37
VPS72Q15906 HMGB1P4-201ENST00000455362 567 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
VPS72Q15906 FPGT-203ENST00000467578 601 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
VPS72Q15906 PPP1R11P1-201ENST00000486095 376 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
VPS72Q15906 LINC01323-201ENST00000486767 576 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
VPS72Q15906 AP002812.1-201ENST00000495378 474 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
VPS72Q15906 AC112695.1-201ENST00000504213 592 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
VPS72Q15906 AC107396.1-201ENST00000509641 735 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
VPS72Q15906 OR52Z1-201ENST00000510471 897 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
VPS72Q15906 LINC02223-202ENST00000511596 578 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
VPS72Q15906 AC006063.1-201ENST00000512511 560 ntTSL 4 BASIC6.47□□□□□ -1.37
VPS72Q15906 TMPRSS11BNL-205ENST00000514295 1262 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
VPS72Q15906 RAD21-203ENST00000517749 1003 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
VPS72Q15906 THUMPD3-AS1-210ENST00000519043 1115 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
VPS72Q15906 CSNK1A1P1-202ENST00000563423 981 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
VPS72Q15906 AC090518.1-202ENST00000568246 578 ntTSL 4 BASIC6.47□□□□□ -1.37
VPS72Q15906 CCDC178-208ENST00000579916 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
VPS72Q15906 CBX3P2-202ENST00000583365 535 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
VPS72Q15906 AC068408.2-201ENST00000584566 439 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
VPS72Q15906 AC008751.2-201ENST00000597885 980 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
VPS72Q15906 MIR99AHG-211ENST00000602323 475 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
VPS72Q15906 LINC01930-201ENST00000602672 870 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
VPS72Q15906 AC146944.4-201ENST00000602697 718 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
VPS72Q15906 AC025175.1-201ENST00000606482 759 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
VPS72Q15906 AC005392.3-201ENST00000607109 459 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
VPS72Q15906 AL022238.2-202ENST00000607915 658 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
VPS72Q15906 C1orf185-204ENST00000612209 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
VPS72Q15906 AC090617.9-201ENST00000623751 147 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
VPS72Q15906 LAMA2-201ENST00000421865 9640 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
VPS72Q15906 ZNF432-202ENST00000594154 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
VPS72Q15906 RBMS1-202ENST00000392753 3781 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
VPS72Q15906 FOXP1-IT1-201ENST00000498714 3539 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
VPS72Q15906 ARHGEF6-203ENST00000370622 4779 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
VPS72Q15906 LINC01538-201ENST00000588074 2408 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
VPS72Q15906 OR2AT4-202ENST00000641504 8661 ntAPPRIS P1 BASIC6.46□□□□□ -1.37
VPS72Q15906 AC004852.2-204ENST00000614137 1370 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
VPS72Q15906 TTC39DP-201ENST00000416781 1688 ntBASIC6.46□□□□□ -1.37
VPS72Q15906 GRIA3-207ENST00000620443 4943 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 FRMD7-202ENST00000370879 2864 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 CLCN3-204ENST00000504131 5592 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 PDCL2-201ENST00000295645 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 AL451142.1-201ENST00000375867 775 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 RNU6-244P-201ENST00000391028 104 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 TATDN1P1-201ENST00000414123 891 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 AP001324.1-201ENST00000428553 399 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 AL021408.1-201ENST00000430428 552 ntTSL 4 BASIC6.46□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 LINC01688-201ENST00000435492 259 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 AL512271.1-201ENST00000439878 434 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 LINC01307-202ENST00000444327 771 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 AP000302.1-201ENST00000450928 666 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 RPL23AP23-201ENST00000452590 471 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 EIF4A2P4-201ENST00000458691 1196 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 RPL7P19-201ENST00000469948 618 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
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