Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 AC073464.3-201ENST00000422564 712 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CDH18Q13634 AC009480.2-201ENST00000422916 432 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CDH18Q13634 RPL7P57-201ENST00000423238 740 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CDH18Q13634 CENPIP1-201ENST00000425713 902 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CDH18Q13634 AF230666.1-201ENST00000429151 786 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CDH18Q13634 AC068287.1-201ENST00000430283 295 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CDH18Q13634 RPL34P6-201ENST00000432390 345 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CDH18Q13634 LIX1L-AS1-205ENST00000437797 536 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CDH18Q13634 AC074367.1-201ENST00000438685 1125 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CDH18Q13634 AL353898.1-201ENST00000444055 238 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CDH18Q13634 MRPL48P1-201ENST00000445390 636 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CDH18Q13634 RHEBP2-201ENST00000450289 600 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CDH18Q13634 AL031668.1-201ENST00000451556 603 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CDH18Q13634 HMGB1P3-201ENST00000502802 616 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CDH18Q13634 ENSA-211ENST00000503345 793 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CDH18Q13634 AC097512.1-203ENST00000506425 957 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CDH18Q13634 AC002456.2-201ENST00000509356 380 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CDH18Q13634 AC106864.1-201ENST00000510655 640 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CDH18Q13634 CDV3-208ENST00000511392 554 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CDH18Q13634 AC098869.2-201ENST00000514187 862 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CDH18Q13634 AP001781.1-201ENST00000530977 207 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CDH18Q13634 AC126178.1-201ENST00000548722 926 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CDH18Q13634 AC112693.1-201ENST00000555297 682 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CDH18Q13634 AL163932.1-201ENST00000555776 542 ntTSL 4 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CDH18Q13634 MTND4LP25-201ENST00000570218 163 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CDH18Q13634 AC090125.1-201ENST00000581541 493 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CDH18Q13634 AC209154.1-201ENST00000582156 337 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CDH18Q13634 SP2-AS1-204ENST00000585280 405 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CDH18Q13634 AC004596.1-201ENST00000586560 528 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CDH18Q13634 AC008745.1-201ENST00000604064 271 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CDH18Q13634 AL122125.1-201ENST00000616999 600 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CDH18Q13634 THRA1/BTR-204ENST00000621191 513 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CDH18Q13634 MIR7641-1-201ENST00000627518 61 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CDH18Q13634 AL355306.2-208ENST00000634868 1251 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CDH18Q13634 CASP1-217ENST00000640184 327 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
CDH18Q13634 ZFPM2-203ENST00000517361 3300 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CDH18Q13634 EYA4-202ENST00000355286 4317 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
CDH18Q13634 UBE4A-203ENST00000545354 2149 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CDH18Q13634 AL022393.1-201ENST00000625142 1677 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CDH18Q13634 MATR3-228ENST00000620916 3134 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CDH18Q13634 KARSP3-201ENST00000571212 1504 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CDH18Q13634 ABCA6-206ENST00000590645 1511 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
CDH18Q13634 CSMD3-203ENST00000343508 13018 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
CDH18Q13634 AL731566.1-201ENST00000620490 1937 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CDH18Q13634 ERMN-201ENST00000397283 3760 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CDH18Q13634 LMOD2-202ENST00000458573 2346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CDH18Q13634 LPAR4-205ENST00000614823 2155 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CDH18Q13634 MTM1-203ENST00000370396 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
CDH18Q13634 SCN1A-220ENST00000641603 12506 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CDH18Q13634 AL031119.1-201ENST00000404707 1879 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CDH18Q13634 SNRPB2-202ENST00000377943 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
CDH18Q13634 ZNF445-201ENST00000396077 18299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
CDH18Q13634 JCHAIN-201ENST00000254801 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
CDH18Q13634 RASA1-203ENST00000506290 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CDH18Q13634 OR14L1P-202ENST00000641545 3009 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CDH18Q13634 DEFB4B-201ENST00000318157 332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
CDH18Q13634 RNA5-8SP7-201ENST00000363443 155 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CDH18Q13634 AL080315.1-201ENST00000406055 466 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CDH18Q13634 AC002524.1-201ENST00000411687 547 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CDH18Q13634 RPL26P37-201ENST00000411983 438 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CDH18Q13634 AL590806.1-201ENST00000415818 853 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CDH18Q13634 AL451107.1-201ENST00000416310 408 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CDH18Q13634 AC066595.1-201ENST00000426697 399 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CDH18Q13634 AC099063.1-201ENST00000437128 324 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CDH18Q13634 Z99127.1-202ENST00000448686 526 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CDH18Q13634 MTND2P28-201ENST00000457540 1044 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CDH18Q13634 snoU13.1-201ENST00000459157 104 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CDH18Q13634 AC092958.2-201ENST00000476987 492 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CDH18Q13634 RPL5P22-201ENST00000480199 884 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CDH18Q13634 SH3GLB1-202ENST00000482504 1199 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
CDH18Q13634 PDCD10-216ENST00000492396 814 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CDH18Q13634 MTND3P24-201ENST00000506306 329 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CDH18Q13634 HMGB3P16-201ENST00000508037 287 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CDH18Q13634 AC008628.1-201ENST00000508663 265 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CDH18Q13634 AC007016.1-201ENST00000512110 244 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CDH18Q13634 LINC02201-203ENST00000514657 674 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CDH18Q13634 SNORA26.10-201ENST00000516427 141 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CDH18Q13634 AP002812.2-201ENST00000525594 585 ntTSL 4 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CDH18Q13634 OR8X1P-201ENST00000534542 869 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CDH18Q13634 AL121852.1-201ENST00000554665 430 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CDH18Q13634 LINC02186-201ENST00000575767 885 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
CDH18Q13634 MIR4675-201ENST00000577898 77 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CDH18Q13634 DPRXP4-201ENST00000578053 568 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CDH18Q13634 AF230666.2-201ENST00000602328 725 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CDH18Q13634 AC242628.1-201ENST00000606810 391 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CDH18Q13634 AL591926.2-202ENST00000615199 719 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CDH18Q13634 CCL14-204ENST00000622526 472 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CDH18Q13634 OR5R1-201ENST00000623286 975 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CDH18Q13634 AC080188.3-201ENST00000624842 748 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CDH18Q13634 AL049536.1-201ENST00000625043 744 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CDH18Q13634 OR5AC4P-202ENST00000642086 985 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CDH18Q13634 CLUL1-213ENST00000620089 1947 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CDH18Q13634 AL512283.1-201ENST00000606756 1384 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CDH18Q13634 AC006148.1-201ENST00000484322 4310 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
CDH18Q13634 ZNF285-204ENST00000591679 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CDH18Q13634 FAM197Y9-201ENST00000451062 2332 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CDH18Q13634 CEP112-204ENST00000537949 2847 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
CDH18Q13634 ZNF660-201ENST00000322734 5834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CDH18Q13634 CASK-207ENST00000421587 8204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
CDH18Q13634 RNMT-209ENST00000592764 4108 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124.9 ms