Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 RPL6P5-201ENST00000445678 828 ntBASIC8□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 PPIAP20-201ENST00000449839 135 ntBASIC8□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 AL096803.2-201ENST00000450032 677 ntBASIC8□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 LINC01878-202ENST00000453965 405 ntTSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 SNORD125-201ENST00000459538 96 ntBASIC8□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 AC087071.2-201ENST00000483283 575 ntTSL 4 BASIC8□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 AC093770.1-201ENST00000511559 571 ntBASIC8□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 AC091965.2-201ENST00000512324 613 ntBASIC8□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 NDUFB4P12-201ENST00000513465 390 ntBASIC8□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 RN7SKP99-201ENST00000517028 307 ntBASIC8□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 NDUFA5P2-201ENST00000519723 344 ntBASIC8□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 NRBF2P4-201ENST00000520874 850 ntBASIC8□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 AC011092.2-201ENST00000533659 586 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 AC068993.1-201ENST00000546724 589 ntBASIC8□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 AKIRIN1P1-201ENST00000547384 544 ntBASIC8□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 AL356022.1-202ENST00000555433 379 ntTSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 AC104938.1-202ENST00000563041 630 ntTSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 AP000897.2-201ENST00000579509 1057 ntTSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 AL157938.2-204ENST00000589667 826 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 AC006363.1-201ENST00000603806 463 ntBASIC8□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 AP003117.2-201ENST00000606010 545 ntBASIC8□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 AC016877.3-201ENST00000606778 504 ntBASIC8□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 OR51C1P-201ENST00000608504 942 ntBASIC8□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 OR2BH1P-201ENST00000608850 864 ntBASIC8□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 AL445423.1-201ENST00000609941 536 ntBASIC8□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 AC010722.1-201ENST00000622595 582 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 PCBP1-AS1-348ENST00000629506 667 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 DYRK1A-202ENST00000339659 8654 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 MGAM2-201ENST00000477922 7867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 TEK-205ENST00000615002 4666 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 AF127577.4-201ENST00000432230 5929 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 SGO1P2-201ENST00000429458 1589 ntBASIC8□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 FBXL13-207ENST00000455112 2274 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 AC091045.1-201ENST00000561460 2277 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 ZBTB38-202ENST00000441582 3662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 RIF1-203ENST00000428287 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 OR1E1-201ENST00000322608 1307 ntAPPRIS P1 BASIC8□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 GAPVD1-206ENST00000394104 6737 ntTSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 EPHA4-202ENST00000409854 3454 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 AL078595.2-201ENST00000605309 1780 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 GABRG2-202ENST00000361925 3767 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 LMNTD1-202ENST00000413632 1520 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 TSPAN6-204ENST00000612152 3796 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 TBC1D23-201ENST00000344949 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 RN7SKP269-201ENST00000365545 319 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 Y_RNA.560-201ENST00000384689 102 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 RPL7P27-201ENST00000403775 720 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 AC008060.2-201ENST00000415333 468 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 AC016994.1-201ENST00000425419 552 ntTSL 4 BASIC7.99□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 VN1R54P-201ENST00000435210 1049 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 COX7BP2-201ENST00000437976 242 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 RAPH1-209ENST00000439222 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 AC099344.3-201ENST00000454489 626 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 AP006216.2-201ENST00000457746 333 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 GIMAP2-202ENST00000474605 309 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 AC104763.1-201ENST00000475274 360 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 AC092691.3-201ENST00000482766 510 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 LINC00888-204ENST00000487386 421 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 RN7SL184P-201ENST00000488308 297 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 AC090638.1-201ENST00000498296 909 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 SPINK13-202ENST00000511106 661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 AC097467.1-201ENST00000513660 370 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 AC133963.2-201ENST00000513686 578 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 AP002428.1-201ENST00000527345 380 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 AHI1-217ENST00000534469 680 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 NR1H4-204ENST00000546380 565 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 AC013437.1-201ENST00000549878 414 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 AC008149.1-201ENST00000551844 525 ntTSL 4 BASIC7.99□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 AC073591.1-201ENST00000552736 597 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 LINS1-207ENST00000560133 1196 ntTSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 NR2F2-AS1-211ENST00000561402 589 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 AC136619.2-201ENST00000563361 631 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 TTN-AS1-219ENST00000586707 834 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 SMIM24-204ENST00000591708 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 AC113137.1-201ENST00000591869 558 ntTSL 4 BASIC7.99□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 TTN-AS1-245ENST00000592182 749 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 ELSPBP1-205ENST00000597519 557 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 AC079089.3-201ENST00000603094 673 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 AC009237.13-201ENST00000603193 276 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 HSPE1-MOB4-201ENST00000604458 890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 AL109618.2-201ENST00000605527 211 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 TULP3P1-203ENST00000606237 586 ntTSL 4 BASIC7.99□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 AC104985.2-201ENST00000620598 500 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 UOX-205ENST00000640983 544 ntTSL 4 BASIC7.99□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 GTF2H5-201ENST00000607778 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 KCNJ10-205ENST00000638728 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 AC006042.3-201ENST00000454684 1469 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 TBCK-205ENST00000432496 3362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 CDC16-202ENST00000252458 1991 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 ENSA-214ENST00000513281 1369 ntTSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 ZNF117-203ENST00000610793 1374 ntTSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 AL034549.2-201ENST00000618285 3373 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 SPATA5-201ENST00000274008 8137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 MIR323A-201ENST00000362199 86 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 Y_RNA.390-201ENST00000383932 102 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 U3.28-201ENST00000391249 210 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 ATF1P1-201ENST00000406040 927 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 ZSCAN12P1-201ENST00000406489 419 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 RN7SKP206-201ENST00000410823 293 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 RN7SKP293-201ENST00000411389 296 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.5 ms