Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 AC026355.1-201ENST00000423466 587 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 VDAC1P2-201ENST00000423609 850 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 AC007283.2-201ENST00000424739 197 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 AL353612.1-201ENST00000428769 465 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 RPS10P21-201ENST00000430654 475 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 E2F3-IT1-201ENST00000433182 400 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 ERLEC1P1-201ENST00000433806 578 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 AC128677.1-201ENST00000436016 442 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 LINC01683-201ENST00000443479 412 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 AL645937.3-201ENST00000453647 936 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 BTF3P15-201ENST00000455606 336 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 RPS20P32-201ENST00000456044 356 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 AC093627.1-201ENST00000465755 877 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 AC117430.1-201ENST00000474711 801 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 TMEM251P1-201ENST00000503717 318 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 PCAT4-202ENST00000514836 373 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 IGKV2D-38-201ENST00000518423 240 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 AC090572.1-201ENST00000519251 160 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 IGHVIII-76-1-201ENST00000523776 286 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 ALKBH3-AS1-202ENST00000527960 547 ntTSL 4 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 NARS2-204ENST00000528850 2137 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 AP001893.3-201ENST00000532357 569 ntTSL 4 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 AP002373.2-201ENST00000541631 1060 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 DUX4L52-201ENST00000549363 777 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 AL389895.1-201ENST00000554127 252 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 AC009145.3-201ENST00000567386 476 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 RBM4-213ENST00000578778 582 ntTSL 4 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 MAGOH2P-202ENST00000584384 429 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 RPS11-205ENST00000599561 430 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 AC004908.2-201ENST00000609090 574 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 LRMDA-216ENST00000611306 393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 OR1N1-202ENST00000619659 939 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 uc_338.22-201ENST00000622722 187 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 AC244517.12-201ENST00000623581 663 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 AC130448.2-201ENST00000624082 374 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 AL359757.2-201ENST00000624309 274 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 DLG2-209ENST00000418306 3027 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 ZNF652P1-201ENST00000442420 1309 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 ASNSP3-201ENST00000451989 1306 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 AC005821.1-203ENST00000577270 3145 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 SERPINB8-208ENST00000542677 3192 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 NUF2-202ENST00000367900 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 RAB14-201ENST00000373840 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 LIMA1-202ENST00000394943 3669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 IL6ST-212ENST00000522633 1878 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 TRAPPC13-208ENST00000505553 1410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 MTND4P1-201ENST00000457501 1466 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 WDPCP-204ENST00000409199 2466 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 ESRP1-204ENST00000454170 3482 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 PIK3R3-202ENST00000372006 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 AC004014.2-201ENST00000623718 5122 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 KIF13A-205ENST00000378843 5707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 SELP-201ENST00000263686 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 SPATA31A1-201ENST00000377647 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 SPATA31A7-206ENST00000619167 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 NEDD9-208ENST00000504387 3211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 ANO6-201ENST00000320560 5975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 BBX-207ENST00000416476 2178 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 MPP5-204ENST00000555925 5006 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 MAPK6-201ENST00000261845 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 AP003175.1-201ENST00000641383 6658 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 MAPK10-392ENST00000642103 3126 ntAPPRIS P2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 GDPD4-202ENST00000376217 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 PCYT1B-201ENST00000356768 1289 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 RNU1-65P-201ENST00000363919 148 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 RNU4-1-201ENST00000363925 141 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 CASP10-206ENST00000374650 1126 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 TRBV25-1-202ENST00000390398 381 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 AL603908.1-201ENST00000406098 201 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 RNU4-26P-201ENST00000410270 107 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 AC078974.1-201ENST00000411597 223 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 AL160162.1-202ENST00000417654 244 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 LINC01690-201ENST00000424837 576 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 MTCYBP10-201ENST00000424905 650 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 AL121759.1-202ENST00000425746 387 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 AC092162.2-201ENST00000438143 532 ntTSL 4 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 AMYP1-201ENST00000440059 1023 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 DARS-AS1-205ENST00000444649 558 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 AC095032.1-201ENST00000444810 527 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 RPL7L1P11-201ENST00000446092 721 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 AL772337.3-201ENST00000447524 452 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 AC009948.1-203ENST00000450044 793 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 LINC01729-201ENST00000450640 358 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 MTND3P16-201ENST00000452205 344 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 AL356010.1-201ENST00000456364 102 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 AC117395.2-201ENST00000463122 1128 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 RPS4XP10-201ENST00000465034 731 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 AC104339.1-201ENST00000465478 348 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 AC034234.1-201ENST00000502993 465 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 AC108516.1-201ENST00000503666 257 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 AC108120.1-201ENST00000506543 991 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 AC116634.1-201ENST00000506926 447 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 AC091906.1-201ENST00000511310 391 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 AC093303.1-201ENST00000514549 295 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 COX6CP8-201ENST00000522620 226 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 AC009884.1-201ENST00000522670 545 ntTSL 4 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 PCNAP4-201ENST00000532690 730 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 LINC02406-201ENST00000553029 546 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 NCAPGP2-201ENST00000557911 754 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 AC068722.1-202ENST00000559600 655 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.6 ms