Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 ATP6V1G1P6-201ENST00000504007 334 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
NME3Q13232 OR52Z1-201ENST00000510471 897 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
NME3Q13232 AC011396.2-202ENST00000511390 375 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
NME3Q13232 ACTR6P1-201ENST00000514311 1104 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
NME3Q13232 LINC02465-204ENST00000514892 481 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
NME3Q13232 RNU6-362P-201ENST00000516736 90 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
NME3Q13232 AC013714.1-201ENST00000524707 747 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
NME3Q13232 AC087783.1-201ENST00000527135 564 ntTSL 4 BASIC4.72□□□□□ -1.65
NME3Q13232 AC004801.3-201ENST00000547602 962 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
NME3Q13232 AC012414.2-201ENST00000559474 187 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
NME3Q13232 C1QBP-206ENST00000574444 901 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
NME3Q13232 MIR4330-201ENST00000579077 105 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
NME3Q13232 AC127540.1-201ENST00000580311 689 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
NME3Q13232 AC090844.2-203ENST00000582263 632 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
NME3Q13232 PSMG2-204ENST00000585331 983 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
NME3Q13232 ZNF540-204ENST00000586792 564 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
NME3Q13232 SNORD91B-202ENST00000608459 222 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
NME3Q13232 MIR6820-201ENST00000611508 62 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
NME3Q13232 AP000346.3-201ENST00000622821 210 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
NME3Q13232 OR5T1-202ENST00000641665 1471 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
NME3Q13232 EED-203ENST00000351625 1696 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
NME3Q13232 AL132640.2-201ENST00000559968 1698 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
NME3Q13232 MAPK10-236ENST00000638313 3971 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
NME3Q13232 STAMBPL1-202ENST00000371924 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
NME3Q13232 OR6K3-201ENST00000368145 1844 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
NME3Q13232 OR2J3-201ENST00000377169 1325 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
NME3Q13232 SLC10A2-201ENST00000245312 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
NME3Q13232 PSMD1-213ENST00000619128 3161 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.65
NME3Q13232 UGT2A3-201ENST00000251566 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
NME3Q13232 NUP205-201ENST00000285968 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
NME3Q13232 NABP1-205ENST00000425611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
NME3Q13232 ESCO1-204ENST00000622333 1850 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
NME3Q13232 ADAM29-214ENST00000618444 2949 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.71□□□□□ -1.66
NME3Q13232 AC097461.1-201ENST00000568928 2821 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
NME3Q13232 MFSD8-216ENST00000641147 4009 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
NME3Q13232 MUCL1-201ENST00000308796 470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
NME3Q13232 TRPM3-206ENST00000377097 554 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
NME3Q13232 TRAJ35-201ENST00000390502 59 ntAPPRIS P1 BASIC4.71□□□□□ -1.66
NME3Q13232 FCF1P5-201ENST00000406490 482 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
NME3Q13232 RPL7AP25-201ENST00000423357 805 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
NME3Q13232 RPEP3-201ENST00000425462 676 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
NME3Q13232 AL445528.1-201ENST00000426330 420 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
NME3Q13232 AP001324.1-201ENST00000428553 399 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
NME3Q13232 AC005772.1-201ENST00000446671 976 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
NME3Q13232 AC073284.1-201ENST00000448086 404 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
NME3Q13232 AL445433.1-201ENST00000457507 257 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
NME3Q13232 AC117513.1-201ENST00000462792 766 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
NME3Q13232 ARHGEF3-AS1-202ENST00000495939 336 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
NME3Q13232 AC139713.2-213ENST00000505000 796 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
NME3Q13232 LINC01088-205ENST00000509088 756 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
NME3Q13232 AC021146.7-201ENST00000509604 775 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
NME3Q13232 AC090753.1-201ENST00000522087 331 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
NME3Q13232 OR10D4P-201ENST00000525892 951 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
NME3Q13232 AC022874.1-201ENST00000526382 550 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
NME3Q13232 CR383656.6-201ENST00000550518 394 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
NME3Q13232 AC109462.2-201ENST00000558730 763 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
NME3Q13232 AC104785.1-201ENST00000603220 588 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
NME3Q13232 AC103792.1-201ENST00000603591 919 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
NME3Q13232 AC100814.1-201ENST00000606963 623 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
NME3Q13232 AC020634.1-201ENST00000608701 549 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
NME3Q13232 AC097505.1-201ENST00000610199 565 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
NME3Q13232 AC074276.2-201ENST00000619891 348 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
NME3Q13232 LGALS13-204ENST00000621475 494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
NME3Q13232 RPL23AP61-201ENST00000623642 466 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
NME3Q13232 TEX41-256ENST00000626411 368 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
NME3Q13232 LINC00706-201ENST00000628989 699 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
NME3Q13232 RUVBL2-213ENST00000639391 120 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
NME3Q13232 OR2L1P-202ENST00000641567 1023 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
NME3Q13232 AL596275.2-204ENST00000641628 552 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
NME3Q13232 AL596275.2-206ENST00000641957 626 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
NME3Q13232 OR5AC4P-202ENST00000642086 985 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
NME3Q13232 ZNF534-204ENST00000433050 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
NME3Q13232 HSPD1P14-201ENST00000432666 1618 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
NME3Q13232 AC120338.1-201ENST00000625074 1541 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
NME3Q13232 CUL3-216ENST00000617432 1426 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
NME3Q13232 NCK1-204ENST00000469404 2403 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
NME3Q13232 ZNF208-207ENST00000609966 3653 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
NME3Q13232 WDR89-201ENST00000267522 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
NME3Q13232 SNRPB2-202ENST00000377943 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
NME3Q13232 AC005332.5-201ENST00000591222 2919 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
NME3Q13232 AC000123.3-201ENST00000624029 4975 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
NME3Q13232 OMG-201ENST00000247271 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
NME3Q13232 AC139769.1-204ENST00000472297 1931 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
NME3Q13232 CYP3A43-203ENST00000342499 1396 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
NME3Q13232 PRR4-201ENST00000228811 563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
NME3Q13232 SNORD96B-201ENST00000386148 79 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
NME3Q13232 NPM1P10-201ENST00000398310 865 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
NME3Q13232 SDHCP2-201ENST00000398565 501 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
NME3Q13232 MIR921-201ENST00000401133 56 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
NME3Q13232 RPS3AP23-201ENST00000401762 784 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
NME3Q13232 AL034374.1-201ENST00000406329 351 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
NME3Q13232 SNRPFP1-201ENST00000414761 252 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
NME3Q13232 RAD23BP1-201ENST00000421404 1227 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
NME3Q13232 RPL21P91-201ENST00000429231 479 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
NME3Q13232 AL451070.1-201ENST00000430143 439 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
NME3Q13232 LINC01935-201ENST00000431897 437 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
NME3Q13232 CEACAMP9-201ENST00000442990 513 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
NME3Q13232 AC012671.1-201ENST00000451912 203 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
NME3Q13232 HGF-207ENST00000453018 721 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
NME3Q13232 MTND2P28-201ENST00000457540 1044 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.9 ms