Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 LINC01214-201ENST00000471222 335 ntTSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 AC046144.1-201ENST00000478559 1853 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 NDUFB2-215ENST00000482954 544 ntTSL 3 BASIC8.67□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 PTPN20-212ENST00000502254 599 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 LINC02059-202ENST00000506471 2094 ntTSL 2 BASIC8.67□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 AC110760.2-201ENST00000508031 2546 ntTSL 2 BASIC8.67□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 B4GALNT2P1-201ENST00000508857 307 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 AC017091.1-202ENST00000510941 504 ntTSL 3 BASIC8.67□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 AC106895.2-201ENST00000511291 1824 ntTSL 3 BASIC8.67□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 LINC02150-201ENST00000513157 2120 ntTSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 AC011416.1-201ENST00000514947 1732 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 RNU6-256P-201ENST00000516747 97 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 RNA5SP337-201ENST00000517007 109 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 GRIA4-206ENST00000525187 2822 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 AP000763.2-201ENST00000540641 163 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 SDHAF2-208ENST00000543265 438 ntTSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 LINC02386-201ENST00000551202 509 ntTSL 3 BASIC8.67□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 TDP1-213ENST00000555880 1894 ntTSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 AC079203.2-201ENST00000559867 387 ntTSL 2 BASIC8.67□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 AC138761.3-201ENST00000579993 334 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 MIR7515HG-226ENST00000588330 1055 ntTSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 AC092070.3-201ENST00000596041 337 ntTSL 3 BASIC8.67□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 AC036176.3-201ENST00000602456 418 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 RNF138P2-201ENST00000603490 592 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 IGHV3-29-201ENST00000604817 344 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 pRNA.12-201ENST00000614353 90 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 pRNA.3-201ENST00000615048 90 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 FIGNL1-213ENST00000615084 3368 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.67□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 SLC7A2-204ENST00000494857 7622 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 AGL-201ENST00000294724 7446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 SLC9A6-214ENST00000637581 4872 ntTSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 SCARB2-211ENST00000638603 4284 ntTSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 CHN2-208ENST00000412711 2991 ntTSL 2 BASIC8.67□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 TMEM267-202ENST00000500337 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 LUARIS-201ENST00000436105 2916 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 ZMYND8-211ENST00000446994 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 ASPH-209ENST00000517903 2658 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 ARMC3-203ENST00000409049 2479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 CCDC77-202ENST00000412006 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.66□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 CLHC1-204ENST00000407122 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 ZNF23-204ENST00000428724 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 CTNND1-231ENST00000532463 5749 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 ANKRD36BP1-201ENST00000358576 1779 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 ZHX3-201ENST00000309060 10030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 PTPRT-211ENST00000618610 3230 ntTSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 IPO9-201ENST00000361565 11435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 UQCRC2P1-201ENST00000417777 1332 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 RNA5SP114-201ENST00000363780 113 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 Y_RNA.212-201ENST00000364177 102 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 Y_RNA.270-201ENST00000364693 104 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 RNY4P16-201ENST00000364768 94 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 RNU1-115P-201ENST00000365329 160 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 RN7SKP269-201ENST00000365545 319 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 Y_RNA.378-201ENST00000365652 113 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 Y_RNA.483-201ENST00000384380 101 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 Y_RNA.562-201ENST00000384695 113 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 MIR323B-201ENST00000385269 82 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 IGKC-201ENST00000390237 523 ntAPPRIS P1 BASIC8.66□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 RPS4XP9-201ENST00000405151 780 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 MIR1302-6-201ENST00000408466 90 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 RN7SKP205-201ENST00000410999 307 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 AF274855.1-201ENST00000411474 850 ntTSL 3 BASIC8.66□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 AC017035.1-201ENST00000411999 1115 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 BX323014.1-201ENST00000412876 237 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 AC009413.1-201ENST00000414823 399 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 RPS15AP12-201ENST00000419498 388 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 AL139008.2-201ENST00000420315 395 ntTSL 3 BASIC8.66□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 CHIAP3-201ENST00000423668 1133 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 PLCB1-IT1-201ENST00000441231 373 ntTSL 3 BASIC8.66□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 AL031316.1-202ENST00000441672 449 ntTSL 3 BASIC8.66□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 RPL35AP28-201ENST00000459730 331 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 RPL7L1P8-201ENST00000469911 741 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 FO393415.2-201ENST00000480085 343 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 AC005017.1-201ENST00000482002 490 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 AC016746.1-201ENST00000489557 831 ntTSL 2 BASIC8.66□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 PPP4R2-207ENST00000495566 559 ntTSL 3 BASIC8.66□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 Y_RNA.673-201ENST00000516306 88 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 Y_RNA.700-201ENST00000516806 100 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 CBX5-204ENST00000550411 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 HMGB3P26-201ENST00000560051 582 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 AC026462.3-201ENST00000565153 557 ntTSL 2 BASIC8.66□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 AC019183.1-201ENST00000580524 505 ntTSL 3 BASIC8.66□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 AC069061.2-201ENST00000580686 480 ntTSL 3 BASIC8.66□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 AC002398.1-201ENST00000589397 427 ntTSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 AC002115.1-201ENST00000589603 568 ntTSL 4 BASIC8.66□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 AC092032.1-201ENST00000603090 165 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 AC068506.1-202ENST00000613388 545 ntTSL 3 BASIC8.66□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 Metazoa_SRP.199-201ENST00000615501 281 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 HOTTIP_2.1-201ENST00000616633 376 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 AC091953.5-201ENST00000622919 233 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 AC008013.2-202ENST00000637965 364 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 TNPO1-201ENST00000337273 11183 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 HPSE2-204ENST00000404542 3681 ntTSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 MYLK4-201ENST00000274643 5806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 NME8-201ENST00000199447 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 GRIA2-201ENST00000264426 3445 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 MEF2C-222ENST00000514028 3393 ntTSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 TNFRSF19-203ENST00000382263 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 AL954650.1-201ENST00000430776 2051 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 CTDSPL2-204ENST00000558966 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
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