Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 RABGEF1-203ENST00000439720 3065 ntTSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
FOXC1Q12948 NUP37-209ENST00000552283 2372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
FOXC1Q12948 TACC2-226ENST00000513429 4114 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
FOXC1Q12948 ZNF33B-201ENST00000359467 5958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
FOXC1Q12948 HLTF-203ENST00000465259 5306 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
FOXC1Q12948 TESPA1-210ENST00000531122 1517 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
FOXC1Q12948 AC110769.2-201ENST00000602760 1548 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
FOXC1Q12948 NRCAM-203ENST00000379024 5782 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
FOXC1Q12948 METTL18-201ENST00000303469 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
FOXC1Q12948 ALB-219ENST00000621085 1418 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
FOXC1Q12948 ERBB4-202ENST00000342788 12136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
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FOXC1Q12948 MCM8-202ENST00000378883 3574 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
FOXC1Q12948 OPRM1-205ENST00000414028 2485 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
FOXC1Q12948 AC138409.1-201ENST00000505001 3598 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
FOXC1Q12948 PLP1-223ENST00000621218 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
FOXC1Q12948 MYLK-206ENST00000418370 7282 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
FOXC1Q12948 CTDSPL2-204ENST00000558966 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
FOXC1Q12948 TAT-201ENST00000355962 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
FOXC1Q12948 THAP6-202ENST00000380837 3423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
FOXC1Q12948 TOR1AIP2-203ENST00000482587 7067 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
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FOXC1Q12948 TRBV21OR9-2-201ENST00000331828 367 ntAPPRIS P1 BASIC6.86□□□□□ -1.31
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FOXC1Q12948 RNU6-251P-201ENST00000363235 104 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
FOXC1Q12948 RNA5SP85-201ENST00000365378 119 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
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FOXC1Q12948 Y_RNA.378-201ENST00000365652 113 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
FOXC1Q12948 TINAG-203ENST00000370869 782 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
FOXC1Q12948 Y_RNA.506-201ENST00000384494 102 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
FOXC1Q12948 RNU6-952P-201ENST00000391164 108 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
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FOXC1Q12948 PPIAP9-201ENST00000403866 498 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
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FOXC1Q12948 AC104777.1-202ENST00000413247 774 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
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FOXC1Q12948 AC093911.1-201ENST00000419129 552 ntTSL 4 BASIC6.86□□□□□ -1.31
FOXC1Q12948 LINC01384-201ENST00000422494 659 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
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FOXC1Q12948 AC011752.1-201ENST00000451476 494 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
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FOXC1Q12948 MAP9-201ENST00000311277 7333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
FOXC1Q12948 DPY19L3-202ENST00000392250 5998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
FOXC1Q12948 CDY2A-202ENST00000426790 2369 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
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FOXC1Q12948 STK33-201ENST00000315204 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
FOXC1Q12948 PHACTR2-201ENST00000305766 1851 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
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FOXC1Q12948 APOOL-202ENST00000613473 6445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
FOXC1Q12948 RASSF6-203ENST00000342081 4331 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
FOXC1Q12948 CACNB2-213ENST00000612134 3825 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
FOXC1Q12948 RC3H1-203ENST00000367696 11261 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
FOXC1Q12948 RFC1-201ENST00000349703 4859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
FOXC1Q12948 LINC01829-202ENST00000433133 2100 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
FOXC1Q12948 DHFR2-202ENST00000394221 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
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