Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 AC074387.1-201ENST00000632044 823 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 LINC01359-206ENST00000634775 888 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 AC068620.4-201ENST00000636730 1182 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 DYNC1I2-201ENST00000340296 2589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 AL442128.2-201ENST00000620246 1824 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 NCOA3-201ENST00000371997 6750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 SRRM1-202ENST00000374389 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 TJP1-202ENST00000356107 6747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 ADAM18-201ENST00000265707 2388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 PRTG-201ENST00000389286 11967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 SMC2-203ENST00000374793 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 ZFP14-201ENST00000270001 7489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 KLHL5-202ENST00000261426 3300 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 FAM26D-202ENST00000368597 1311 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 AIMP1-202ENST00000394701 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 MPDZ-204ENST00000381022 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 CLDN12-203ENST00000394605 3488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 PLEKHG7-201ENST00000344636 3868 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 HHLA2-210ENST00000491820 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 AC092111.2-201ENST00000611627 1414 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 ZNF611-201ENST00000319783 3153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 DEFB112-201ENST00000322246 342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 ANKRD36P1-201ENST00000344424 659 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 RNU6-224P-201ENST00000384055 107 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 SNORA51.8-201ENST00000384234 132 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 MIR589-201ENST00000385238 99 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 SNORD65C-201ENST00000390962 71 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 LUZP4P1-201ENST00000415420 344 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 AC073333.1-201ENST00000418907 648 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 BX119904.4-201ENST00000424402 301 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 SPATA13-AS1-201ENST00000430733 433 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 INTS6L-AS1-201ENST00000430820 398 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 AL590867.3-201ENST00000436953 438 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 OR5H14-201ENST00000437310 1080 ntAPPRIS P1 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 AC006466.1-201ENST00000438721 289 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 PARGP1-202ENST00000440803 790 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 AC026320.1-202ENST00000444729 672 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 AL360091.1-201ENST00000447949 496 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 AC090804.1-201ENST00000448870 490 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 RSL24D1P3-201ENST00000449255 495 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 ART2BP-201ENST00000453501 499 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 AC010890.1-201ENST00000454699 469 ntTSL 4 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 C1orf143-202ENST00000491260 813 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 RPS24P16-201ENST00000497294 392 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 LNX1-AS2-201ENST00000502410 347 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 AC091951.3-201ENST00000504093 246 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 LINC00603-201ENST00000507027 733 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 AC034244.1-201ENST00000507687 207 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 AC093815.1-201ENST00000508637 280 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 AC011389.1-201ENST00000509170 594 ntTSL 4 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 AC097535.1-201ENST00000515263 332 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 AC010261.2-201ENST00000515563 588 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 AC092709.1-201ENST00000521355 1045 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 AC099520.2-201ENST00000523745 567 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 AC107882.1-201ENST00000530837 477 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 LINC02408-202ENST00000538573 559 ntTSL 4 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 AL356022.1-202ENST00000555433 379 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 CLMN-206ENST00000556441 452 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 LINC02170-201ENST00000561519 555 ntTSL 4 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 AC091544.5-202ENST00000568297 374 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 RN7SL290P-201ENST00000578661 300 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 AC099811.4-201ENST00000592536 496 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 ZNF283-207ENST00000593164 1260 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 AC010620.1-201ENST00000601088 1102 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 AC002069.2-201ENST00000603580 883 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 AC242426.3-203ENST00000606757 712 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 OR2BH1P-201ENST00000608850 864 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 AP000550.3-201ENST00000637734 379 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 DOPEY1-202ENST00000349129 8210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 FAM197Y3-202ENST00000427622 2325 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 FAM197Y7-202ENST00000433321 2325 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 TMEM68-209ENST00000521229 2400 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 AL365214.2-201ENST00000433684 1365 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 ZNF573-208ENST00000536220 2257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 LINC02302-201ENST00000556405 2904 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 AC005005.4-201ENST00000623789 16698 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 LIPF-203ENST00000394375 1470 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 AC011287.1-206ENST00000638774 2642 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 LRIT3-201ENST00000327908 3781 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 SLC26A3-201ENST00000340010 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 HTR1F-201ENST00000319595 3140 ntAPPRIS P1 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 KSR2-202ENST00000425217 17008 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 PTPRD-205ENST00000397611 8242 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 IFT52-202ENST00000373039 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 SPATA2P1-201ENST00000431223 2055 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 AL157938.3-201ENST00000502188 3084 ntTSL 4 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 IBTK-206ENST00000503631 3560 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 PEX2-201ENST00000357039 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 ELAVL2-202ENST00000380110 3691 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 TANK-205ENST00000405852 2155 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 MTCO1P18-201ENST00000455518 1419 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 COPB2-205ENST00000507777 3034 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 FANCI-201ENST00000300027 4713 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 PSG1-204ENST00000436291 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 SAMSN1-206ENST00000619120 2028 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 GJA9-201ENST00000357771 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 C5orf42-201ENST00000425232 11199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 OR8A1-201ENST00000284287 1146 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 RN7SKP104-201ENST00000362605 328 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 RNA5SP223-201ENST00000365174 120 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 189.7 ms