Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,714 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 AC010374.1-201ENST00000503762 1237 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
COL24A1Q17RW2 ALB-201ENST00000295897 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
COL24A1Q17RW2 AC079915.1-201ENST00000584382 2780 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
COL24A1Q17RW2 PDE4D-216ENST00000507116 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
COL24A1Q17RW2 UPF2-201ENST00000356352 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
COL24A1Q17RW2 RALGAPA2-201ENST00000202677 6152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
COL24A1Q17RW2 FAM49B-212ENST00000519110 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
COL24A1Q17RW2 CLSTN2-201ENST00000458420 14202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
COL24A1Q17RW2 TLR8-201ENST00000218032 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
COL24A1Q17RW2 PTBP3-202ENST00000334318 7990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
COL24A1Q17RW2 NCK1-204ENST00000469404 2403 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
COL24A1Q17RW2 MIR183-201ENST00000384958 110 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
COL24A1Q17RW2 RNA5SP36-201ENST00000410197 133 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
COL24A1Q17RW2 RN7SKP167-201ENST00000411047 285 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
COL24A1Q17RW2 AC062016.2-201ENST00000420950 676 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
COL24A1Q17RW2 AC016912.1-201ENST00000432241 545 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
COL24A1Q17RW2 AC004938.1-201ENST00000438468 308 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
COL24A1Q17RW2 TAB3-AS2-201ENST00000445240 292 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
COL24A1Q17RW2 AL732323.1-201ENST00000445897 456 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
COL24A1Q17RW2 AL139350.1-201ENST00000448825 408 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
COL24A1Q17RW2 DCUN1D1-204ENST00000469954 970 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
COL24A1Q17RW2 CREM-238ENST00000488741 651 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
COL24A1Q17RW2 INPP4B-206ENST00000506217 673 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
COL24A1Q17RW2 NPM1P21-201ENST00000513394 762 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
COL24A1Q17RW2 AC100844.1-201ENST00000580622 440 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
COL24A1Q17RW2 RDM1-221ENST00000617591 432 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
COL24A1Q17RW2 LINC01002-227ENST00000633363 541 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
COL24A1Q17RW2 CRNDE-213ENST00000635991 546 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
COL24A1Q17RW2 CACNB4-229ENST00000636617 5757 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
COL24A1Q17RW2 FREM2-201ENST00000280481 16070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
COL24A1Q17RW2 ZNF334-203ENST00000593880 2635 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
COL24A1Q17RW2 IQCH-201ENST00000335894 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
COL24A1Q17RW2 USP45-204ENST00000369233 2514 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
COL24A1Q17RW2 ZNF546-201ENST00000347077 7987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
COL24A1Q17RW2 PRG4-203ENST00000367485 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
COL24A1Q17RW2 BICRAL-202ENST00000394168 6515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
COL24A1Q17RW2 TIPARP-207ENST00000542783 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
COL24A1Q17RW2 ADGRL2-209ENST00000370727 5164 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
COL24A1Q17RW2 HUWE1-203ENST00000342160 14796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
COL24A1Q17RW2 RPGRIP1-201ENST00000382933 2004 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
COL24A1Q17RW2 PCDH15-212ENST00000395442 2970 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
COL24A1Q17RW2 WAC-221ENST00000628285 2740 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
COL24A1Q17RW2 OR5K1-201ENST00000332650 1097 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
COL24A1Q17RW2 UBE2E2-AS1-202ENST00000430018 499 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
COL24A1Q17RW2 AL138759.1-201ENST00000432120 645 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
COL24A1Q17RW2 AL512326.1-201ENST00000443050 721 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
COL24A1Q17RW2 DDX39BP2-208ENST00000453923 258 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
COL24A1Q17RW2 RPS26P28-201ENST00000470806 348 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
COL24A1Q17RW2 AC069272.1-201ENST00000514843 680 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
COL24A1Q17RW2 AC138832.1-201ENST00000522871 556 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
COL24A1Q17RW2 AC015468.4-201ENST00000523496 568 ntTSL 4 BASIC5.43□□□□□ -1.54
COL24A1Q17RW2 LINC02394-201ENST00000549140 543 ntTSL 4 BASIC5.43□□□□□ -1.54
COL24A1Q17RW2 RPL21P12-201ENST00000559810 515 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
COL24A1Q17RW2 AC002069.2-201ENST00000603580 883 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
COL24A1Q17RW2 ZNF345-216ENST00000640438 963 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
COL24A1Q17RW2 ZNF285-204ENST00000591679 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.42□□□□□ -1.54
COL24A1Q17RW2 CHST9-203ENST00000618847 11388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
COL24A1Q17RW2 AC021355.1-202ENST00000519996 1633 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
COL24A1Q17RW2 AL590399.5-201ENST00000428709 3325 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
COL24A1Q17RW2 PATJ-213ENST00000613764 4172 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
COL24A1Q17RW2 PATE1-201ENST00000305738 1527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
COL24A1Q17RW2 KTN1-202ENST00000395308 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
COL24A1Q17RW2 AC003985.2-201ENST00000562268 1669 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
COL24A1Q17RW2 AC104623.2-202ENST00000623477 4002 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
COL24A1Q17RW2 AC051618.1-201ENST00000414295 207 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
COL24A1Q17RW2 TCEA1P4-201ENST00000415066 844 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
COL24A1Q17RW2 AC108032.1-201ENST00000416706 207 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
COL24A1Q17RW2 AL592078.1-201ENST00000421866 321 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
COL24A1Q17RW2 ARPP21-211ENST00000427542 568 ntTSL 4 BASIC5.42□□□□□ -1.54
COL24A1Q17RW2 AL080313.1-201ENST00000434947 405 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
COL24A1Q17RW2 NMNAT1P2-201ENST00000435192 860 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
COL24A1Q17RW2 TBCAP1-201ENST00000436520 327 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
COL24A1Q17RW2 AC020594.1-201ENST00000437680 338 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
COL24A1Q17RW2 AL157400.3-201ENST00000449882 1298 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
COL24A1Q17RW2 RN7SL812P-201ENST00000493791 279 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
COL24A1Q17RW2 AC008591.1-201ENST00000503616 631 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
COL24A1Q17RW2 AC120057.2-201ENST00000571520 271 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
COL24A1Q17RW2 AC005412.1-201ENST00000580812 1049 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
COL24A1Q17RW2 AC091178.1-203ENST00000584586 279 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
COL24A1Q17RW2 OR2BH1P-201ENST00000608850 864 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
COL24A1Q17RW2 AC010608.2-201ENST00000624830 470 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
COL24A1Q17RW2 PRB2-201ENST00000389362 1429 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
COL24A1Q17RW2 AL355596.1-201ENST00000565399 3996 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
COL24A1Q17RW2 HEMK1-203ENST00000434410 17064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
COL24A1Q17RW2 ECT2L-201ENST00000367682 4343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
COL24A1Q17RW2 AL603750.1-201ENST00000624216 1717 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
COL24A1Q17RW2 AC007750.1-202ENST00000418968 4098 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
COL24A1Q17RW2 ZNF214-204ENST00000536068 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
COL24A1Q17RW2 ZNF804A-202ENST00000613975 3986 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
COL24A1Q17RW2 PPIG-201ENST00000260970 6368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
COL24A1Q17RW2 AC068870.3-201ENST00000625077 2536 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
COL24A1Q17RW2 AC096664.2-201ENST00000411843 406 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
COL24A1Q17RW2 CAB39P1-201ENST00000502277 460 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
COL24A1Q17RW2 KCTD9P2-201ENST00000512203 1013 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
COL24A1Q17RW2 AC008641.1-201ENST00000523781 248 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
COL24A1Q17RW2 DUX4L52-201ENST00000549363 777 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
COL24A1Q17RW2 PCLAF-203ENST00000558008 766 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
COL24A1Q17RW2 RPL23AP97-201ENST00000568955 471 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
COL24A1Q17RW2 AL354696.2-202ENST00000620300 613 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
COL24A1Q17RW2 MIR6500-201ENST00000622700 86 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.3 ms