Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 CCL20-201ENST00000358813 800 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 AC012358.3-203ENST00000366287 1110 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 RNA5SP397-201ENST00000391323 118 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 ATP5F1P2-201ENST00000398143 760 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 RN7SKP106-201ENST00000410832 272 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 RPS20P14-201ENST00000412545 360 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 AC099060.1-201ENST00000427806 448 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 NPM1P48-201ENST00000436002 853 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 AP000936.3-201ENST00000438127 255 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 YWHAZP2-201ENST00000440317 728 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 GEMIN8P3-201ENST00000445417 720 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 AL365271.1-201ENST00000448909 603 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 COX7A2-205ENST00000460985 357 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 AC083982.1-201ENST00000485679 344 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 ATXN3-206ENST00000502250 1259 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 GYPB-202ENST00000502664 521 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 PARP4P3-201ENST00000510265 317 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 PTH-202ENST00000529816 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 KIRREL3-AS2-201ENST00000532988 492 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 LINC02390-201ENST00000541404 560 ntTSL 4 BASIC3.61□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 AC009803.1-202ENST00000551940 544 ntTSL 4 BASIC3.61□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 AC104002.2-201ENST00000553919 318 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 AC091073.1-201ENST00000559620 666 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 HMGB3P26-201ENST00000560051 582 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 AC009039.1-201ENST00000568711 471 ntTSL 4 BASIC3.61□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 AP005119.2-201ENST00000579735 1105 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 AC090312.1-201ENST00000580637 348 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 AP005121.1-202ENST00000584414 555 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 ZNF540-204ENST00000586792 564 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 AC006504.5-212ENST00000587188 746 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 OR7A5-202ENST00000594432 1029 ntAPPRIS P1 BASIC3.61□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 MIR4527HG-203ENST00000600127 704 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 AC090181.2-201ENST00000602975 672 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 AP005019.3-201ENST00000620418 560 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 SNAP23-222ENST00000626061 237 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 SNAP23-223ENST00000627440 210 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 OR52N4-202ENST00000641350 1276 ntAPPRIS P1 BASIC3.61□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 ARHGAP42P1-201ENST00000507474 1976 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 FAM169A-201ENST00000389156 5990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 MTND4P26-201ENST00000415971 1359 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 RIMS2-201ENST00000262231 3854 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 PLEKHG7-203ENST00000638590 3267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 ELAVL4-206ENST00000371827 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 PCDH15-218ENST00000437009 6804 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 EIF3E-201ENST00000220849 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 MAPK10-373ENST00000641983 6772 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 DNAJC10-201ENST00000264065 20129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 SCN3A-209ENST00000639244 8854 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 SLC26A7-209ENST00000617078 5094 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 GPR174-201ENST00000276077 1258 ntAPPRIS P1 BASIC3.6□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 RNU1-15P-201ENST00000353977 144 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 RHOT1P2-201ENST00000366423 333 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 LZIC-201ENST00000377213 945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 MIR323B-201ENST00000385269 82 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 CEBPZOS-205ENST00000406711 687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 VN1R8P-201ENST00000407739 893 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 AC009302.1-201ENST00000417147 390 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 LINC01507-201ENST00000417801 446 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 NPM1P26-201ENST00000426339 738 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 AC005828.1-201ENST00000431604 524 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 TMEM196-204ENST00000433641 768 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 HMGB3P10-201ENST00000434734 572 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
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RTL8BQ17RB0 AL133244.1-201ENST00000456007 258 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
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RTL8BQ17RB0 TTC26-205ENST00000474035 1193 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 MRPS33-209ENST00000496958 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 HMGB3P13-201ENST00000511263 607 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 AC021351.1-201ENST00000560886 652 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
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RTL8BQ17RB0 AC069061.3-201ENST00000582254 823 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
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RTL8BQ17RB0 AC013244.1-201ENST00000604279 193 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 AC243585.1-201ENST00000617867 607 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
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RTL8BQ17RB0 TAOK3-202ENST00000419821 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 ZMYM6-201ENST00000317538 2702 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 LINC01187-201ENST00000506431 2314 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 ERBB4-203ENST00000402597 11699 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 CASC8-203ENST00000502082 1420 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 ZBTB37-201ENST00000367701 19128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 TRIM36-209ENST00000514154 1952 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 MYCT1-201ENST00000367245 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 CEP152-203ENST00000399334 5097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 MRE11-202ENST00000323977 2588 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 SEC23A-202ENST00000537403 4215 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 WAC-221ENST00000628285 2740 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 TMEM255A-202ENST00000371352 2879 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 AC090971.4-201ENST00000560291 1800 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 CDR1-201ENST00000370532 2467 ntAPPRIS P1 BASIC3.59□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 DEFB4B-201ENST00000318157 332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 RNA5SP52-201ENST00000362448 134 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 RNA5SP87-201ENST00000384155 118 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 MIR93-201ENST00000385024 80 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 C8orf22-202ENST00000399653 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 RPS23P10-201ENST00000416185 486 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
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