Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 AP000648.2-201ENST00000624182 404 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 MIR548A1HG-202ENST00000637804 784 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 OR5H6-203ENST00000642105 978 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 TRIM38-201ENST00000357085 9413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 TMC1-201ENST00000297784 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 SGO1-AS1-205ENST00000634837 1677 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 DTNA-226ENST00000596745 1508 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 MYCBP2-212ENST00000612956 1542 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 CFI-202ENST00000394635 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 ADA2-210ENST00000610390 4137 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 MFSD8-201ENST00000296468 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 DCC-215ENST00000581580 3517 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 HSDL2-201ENST00000398803 2983 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 MROH3P-201ENST00000435735 2676 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 LYSMD3-203ENST00000500869 3863 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 SPARCL1-201ENST00000282470 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 ARPP21-204ENST00000412048 2506 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 LINC01043-201ENST00000565936 6897 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 TRPC4-204ENST00000379673 2760 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 LINC00702-203ENST00000608792 6300 ntTSL 4 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 EIF4ENIF1-205ENST00000397523 3420 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 APBB2-230ENST00000543538 6992 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 ARHGAP20-205ENST00000529591 2623 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 ARL17A-202ENST00000336125 3945 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 CC2D2B-201ENST00000344386 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 CEACAM5-202ENST00000398599 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 IFRD1-216ENST00000535603 3397 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 DAZ2-203ENST00000382424 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 SMAD1-202ENST00000394092 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 RAP1GDS1-204ENST00000408900 1942 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 KIAA0232-201ENST00000307659 7841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 ZNF721-201ENST00000338977 4492 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 OR6K2-201ENST00000359610 975 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 RNU1-49P-201ENST00000363468 159 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 OR1A2-201ENST00000381951 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 RNU6-729P-201ENST00000384399 107 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 Y_RNA.582-201ENST00000391023 95 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 PPP1R1C-203ENST00000409702 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 LINC00427-201ENST00000412722 430 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 BX284656.2-201ENST00000414483 498 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 Z97055.1-201ENST00000419730 712 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 AL022100.2-201ENST00000422548 389 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 TXNDC8-204ENST00000423740 356 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 OR8F1P-201ENST00000425243 930 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 AL157400.1-201ENST00000428166 368 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 VN1R54P-201ENST00000435210 1049 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 AL831737.1-201ENST00000441288 271 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 AC239367.2-201ENST00000447309 705 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 NPM1P39-201ENST00000449818 867 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 ETV5-AS1-201ENST00000453370 560 ntTSL 4 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 OR2AO1P-201ENST00000476497 403 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 AP000797.1-201ENST00000478870 387 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 AC004453.1-201ENST00000487895 408 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 SAR1B-204ENST00000502539 708 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 IMPA1P1-201ENST00000510718 842 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 RNU6-718P-201ENST00000516166 105 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 DEFB108A-201ENST00000530110 222 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 AP001893.1-201ENST00000532866 362 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 AC008250.1-201ENST00000539874 522 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 AC092490.1-202ENST00000540299 809 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 AC022509.2-201ENST00000540392 699 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 LINC01489-201ENST00000542689 605 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 TMEM159-205ENST00000572599 713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 AL109935.2-201ENST00000587737 395 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 AC105094.2-203ENST00000590357 555 ntTSL 4 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 AC113137.1-201ENST00000591869 558 ntTSL 4 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 AL022154.1-201ENST00000604698 785 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 AC004921.1-201ENST00000608884 733 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 AC090970.3-201ENST00000612566 866 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 AC243756.2-201ENST00000618406 463 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 MIR6810-201ENST00000622701 70 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 AC120349.2-201ENST00000625002 298 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 PFKM-232ENST00000629846 381 ntTSL 4 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 AC105749.1-201ENST00000631338 2008 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 DEFB132-201ENST00000382376 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 FCHSD2-205ENST00000409853 1867 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 ZNF562-202ENST00000453372 2111 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 AL161912.4-201ENST00000623889 2468 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 AC119744.1-201ENST00000454746 1715 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 TIMM21-201ENST00000169551 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 LY86-AS1-202ENST00000435641 2819 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 SLAMF1-202ENST00000302035 4006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 OR4F17-202ENST00000585993 2669 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 OLFM3-201ENST00000338858 2189 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 PREPL-216ENST00000541738 6049 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 AC027088.4-201ENST00000611559 1947 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 CPED1-206ENST00000450913 2501 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 MAPK10-261ENST00000641050 3109 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 FOXP2-205ENST00000393489 2285 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 SLC38A11-204ENST00000409662 1542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 ADAM18-202ENST00000379866 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 ZNF28-201ENST00000339844 650 ntTSL 4 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 PRSS37-201ENST00000350549 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 RNA5SP46-201ENST00000362370 120 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 Y_RNA.25-201ENST00000362528 102 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 CRP-204ENST00000368112 787 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 CD80-202ENST00000383669 771 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 MTCYBP36-201ENST00000404146 440 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 MIR1204-201ENST00000408388 67 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 PRR21-201ENST00000408934 1170 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
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