Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 AC074029.4-201ENST00000624796 1859 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 RASAL2-203ENST00000462775 14453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 ABCA12-201ENST00000272895 9100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 KIF23-206ENST00000558585 2296 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 FAM184A-204ENST00000368475 3392 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 MYO3A-203ENST00000376302 2723 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 AC009951.1-201ENST00000623674 2614 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 EMSY-215ENST00000533248 3798 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 GTDC1-206ENST00000409214 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 SCN1A-202ENST00000375405 8097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 IL3-201ENST00000296870 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 OR4F6-201ENST00000328882 1238 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 TMLHE-202ENST00000369439 1248 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 SNORA56-201ENST00000383966 129 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 TRAV12-2-201ENST00000390437 445 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 GSTM3P2-201ENST00000412746 530 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 AC119751.6-201ENST00000416712 186 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 LINC01731-201ENST00000428035 420 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 AC005154.2-201ENST00000438110 379 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 AC016831.4-201ENST00000438302 307 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 AL512625.3-204ENST00000438699 1031 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 FMR1-IT1-201ENST00000441414 343 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 AC000111.2-201ENST00000448200 210 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 AL358075.1-201ENST00000450004 649 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 NDUFA12P1-201ENST00000455914 406 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 RPS29P33-201ENST00000456717 146 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 RPS17P2-201ENST00000461663 408 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 IGLV2-34-201ENST00000490007 283 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 RPL23AP72-201ENST00000492447 435 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 MYL12BP2-201ENST00000503948 512 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 HMGB1P47-201ENST00000511281 589 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 LINC01088-208ENST00000511895 795 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 MTND1P36-201ENST00000522384 936 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 AP001318.3-202ENST00000528876 509 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 FAM222A-AS1-202ENST00000541460 751 ntTSL 4 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 CKS1BP1-201ENST00000555221 240 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 TRAV30-201ENST00000557168 337 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 AC066612.1-202ENST00000561094 518 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 AC055874.1-201ENST00000561458 479 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 LINC00557-201ENST00000563184 1279 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 AC233702.9-201ENST00000581528 203 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 AL133247.2-201ENST00000603236 482 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 AC017076.1-201ENST00000607613 578 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 INTS6-AS1-226ENST00000610018 672 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 AP006248.3-201ENST00000623580 594 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 ZNF415-201ENST00000243643 2270 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 ZNF568-216ENST00000619231 3797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 KIAA0586-202ENST00000354386 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 RWDD2B-207ENST00000493196 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 AC002525.1-201ENST00000624392 1622 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 PTPN12-206ENST00000435495 2526 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 BDNF-AS-202ENST00000499568 2039 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 AC011447.7-201ENST00000624228 1590 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 MAP3K19-201ENST00000358371 3719 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 MLF1-208ENST00000478894 1372 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 AC096656.1-201ENST00000623826 1364 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 HERC4-204ENST00000395198 4445 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 CDK14-203ENST00000406263 5163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 ZNF418-205ENST00000595830 3543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 AC079741.1-201ENST00000321498 212 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
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SGCGQ13326 OR51I1-201ENST00000380211 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 RNU6-398P-201ENST00000384143 109 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 AC013442.1-201ENST00000397347 228 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 AL356057.1-202ENST00000402263 756 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 RN7SKP97-201ENST00000410966 333 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 AF178030.1-201ENST00000415088 402 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 AC023347.1-202ENST00000419223 440 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 AC073464.3-201ENST00000422564 712 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 AL136987.1-201ENST00000434300 396 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 LINC01878-201ENST00000434559 769 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 AL732323.1-201ENST00000445897 456 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
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SGCGQ13326 RN7SL517P-201ENST00000462240 305 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 AC010326.1-201ENST00000462726 602 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 CMAHP-205ENST00000471416 1118 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 FO393419.2-201ENST00000492975 428 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 AC104971.1-201ENST00000495117 578 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 AC083795.2-201ENST00000510034 610 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 SNHG27-203ENST00000514222 680 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 RNU1-6P-201ENST00000516290 144 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 RNA5SP392-201ENST00000516905 112 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 AC104350.1-201ENST00000518750 877 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 TRAPPC2-208ENST00000519885 561 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 AC090819.1-201ENST00000523800 1111 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 AC044810.3-201ENST00000527565 589 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 DERA-209ENST00000532964 854 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 OR5AN2P-201ENST00000534535 896 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 HMGB3P26-201ENST00000560051 582 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 AC040958.1-201ENST00000561102 201 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 AC005154.1-213ENST00000578572 445 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 AC234771.5-201ENST00000600161 514 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 AC011453.2-201ENST00000603737 729 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 AL158211.2-201ENST00000607282 395 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 AC005021.1-201ENST00000608730 355 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 AC123768.3-201ENST00000613733 523 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 uc_338.18-201ENST00000615451 175 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 THRA1/BTR-204ENST00000621191 513 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 AP000648.2-201ENST00000624182 404 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 STAG2-204ENST00000371157 5991 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
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