Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 KCNH7-202ENST00000332142 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 DLG2-202ENST00000330014 2789 ntTSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 FAM107A-202ENST00000394481 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 ALB-219ENST00000621085 1418 ntTSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 AC026464.2-201ENST00000567834 2421 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 AC131649.2-201ENST00000624925 4439 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 SERPINI2-209ENST00000616363 1769 ntTSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 AC093775.1-201ENST00000624154 1868 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 CDC27-201ENST00000066544 5801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 KIAA0100-201ENST00000389003 6852 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 KIAA0100-203ENST00000544884 6856 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 ANKRD31-201ENST00000274361 6036 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 CDC42SE1-201ENST00000357235 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 CD46-208ENST00000367042 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 DDX24-209ENST00000621632 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 EFCAB7-201ENST00000371088 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 PCAT5-201ENST00000626667 3550 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 MAPK10-279ENST00000641157 2449 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 CAST-236ENST00000511782 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.68□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 WDR19-207ENST00000506503 2513 ntTSL 2 BASIC8.68□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 TRBV21OR9-2-201ENST00000331828 367 ntAPPRIS P1 BASIC8.68□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 RNU1-122P-201ENST00000365538 156 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 THEM5-201ENST00000368817 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 FGFR2-213ENST00000369061 3803 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 RNU6-952P-201ENST00000391164 108 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 PRUNEP1-201ENST00000425846 705 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 AC005083.1-202ENST00000430859 740 ntTSL 2 BASIC8.68□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 RPL21P2-201ENST00000440049 481 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 AC008080.3-201ENST00000440074 380 ntTSL 3 BASIC8.68□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 AL645936.1-201ENST00000441979 518 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 AL031736.1-201ENST00000449688 618 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 AC013470.1-201ENST00000453438 462 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 MTND4LP30-201ENST00000454092 297 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 RPL12P40-201ENST00000467028 488 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 AC009269.1-201ENST00000470368 833 ntTSL 3 BASIC8.68□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 AC117386.1-201ENST00000474444 606 ntTSL 4 BASIC8.68□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 AL035404.1-201ENST00000497982 568 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 HAND2-AS1-235ENST00000515376 951 ntTSL 3 BASIC8.68□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 AP005435.4-201ENST00000529514 284 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 AC090502.2-201ENST00000549267 280 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 BLID-201ENST00000560104 862 ntAPPRIS P1 BASIC8.68□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 CYP4A44P-201ENST00000569984 154 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 C18orf54-203ENST00000578138 776 ntTSL 3 BASIC8.68□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 ZNF675-204ENST00000599168 592 ntTSL 2 BASIC8.68□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 LINC02019-202ENST00000609204 845 ntTSL 2 BASIC8.68□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 AL136097.3-201ENST00000611097 505 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 GLYATL1-219ENST00000612196 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 LINC01232-205ENST00000630421 1002 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 MIR665-201ENST00000635949 72 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 NBPF19-206ENST00000621744 14425 ntTSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 MYO6-207ENST00000615563 4026 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 KIAA1524-207ENST00000619684 2839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 DCP1B-205ENST00000540622 1547 ntTSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 DIO2-210ENST00000557010 6367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.68□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 OR2F1-203ENST00000641412 4829 ntAPPRIS P1 BASIC8.68□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 SP140-203ENST00000392045 3246 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.68□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 MED23-209ENST00000539158 1636 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
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MKRN3Q13064 CAPS2-206ENST00000409799 1859 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 NAT1-209ENST00000541942 1948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.68□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 AC092125.1-201ENST00000562568 1995 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 ZNF69-202ENST00000429654 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.68□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 CASP1-215ENST00000533400 2001 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 SLC16A4-202ENST00000369781 2082 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
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MKRN3Q13064 CASC1-205ENST00000545133 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.68□□□□□ -1.02
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MKRN3Q13064 IGF1R-206ENST00000558762 11726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 AGXT2-201ENST00000231420 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 AC245177.1-201ENST00000375625 2369 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 AC239585.1-201ENST00000375644 2369 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
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MKRN3Q13064 CDH7-201ENST00000323011 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 C11orf63-203ENST00000531316 2782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.67□□□□□ -1.02
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MKRN3Q13064 KIAA1217-201ENST00000307544 3281 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 PLCG2-201ENST00000359376 3819 ntTSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 HERC4-202ENST00000373700 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 SH3D19-203ENST00000409598 5284 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 SRPX2-201ENST00000373004 6679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 GNG13-201ENST00000248150 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 LIN7C-201ENST00000278193 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 SCGB1A1-201ENST00000278282 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 MFSD6-201ENST00000281416 4608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 GPR151-201ENST00000311104 3088 ntAPPRIS P1 BASIC8.67□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 ENTPD5-201ENST00000334696 5842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 RNU6-552P-201ENST00000362869 119 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 SNORD113-7-201ENST00000363762 77 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 Y_RNA.367-201ENST00000365544 101 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 Y_RNA.380-201ENST00000365663 111 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 CD84-204ENST00000368048 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 RNU6-903P-201ENST00000391270 109 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 BMPR1APS1-201ENST00000403332 1598 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 RN7SKP268-201ENST00000411107 316 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 PUM1-205ENST00000424085 4631 ntTSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 AL355607.1-201ENST00000427745 295 ntTSL 3 BASIC8.67□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 SETP5-201ENST00000437270 562 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 MED28P3-201ENST00000444288 531 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
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