Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 AC109780.2-201ENST00000413467 845 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 AC084816.1-201ENST00000413794 565 ntTSL 4 BASIC5.03□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 HMGB3P23-201ENST00000414981 585 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 AC245052.5-201ENST00000416320 649 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 AC092687.1-201ENST00000418835 389 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 ODF2-AS1-201ENST00000420801 407 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 OFD1P18Y-201ENST00000420889 959 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 CYCSP52-201ENST00000422857 310 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 RPS7P14-201ENST00000426405 583 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 AC023141.3-201ENST00000436698 278 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 LINC00411-201ENST00000436722 461 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 AL031663.1-201ENST00000437445 219 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 ATP6V1E1P1-201ENST00000439215 681 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 KRTAP2-5P-201ENST00000446109 396 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 AL355390.2-201ENST00000446691 880 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 AL139275.1-201ENST00000447315 824 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 WASF1P1-201ENST00000447560 1131 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 LINC00704-203ENST00000449712 703 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 NDUFA5P7-201ENST00000452914 242 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 AC098824.1-201ENST00000453565 980 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 SETP20-201ENST00000457046 852 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 RPL23AP12-201ENST00000467573 473 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 DCUN1D1-204ENST00000469954 970 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 AC128716.1-201ENST00000475129 166 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 RPL7P51-201ENST00000490532 749 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 RPL9P6-201ENST00000492764 598 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 FCF1P3-201ENST00000496394 590 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 AC010343.2-201ENST00000510162 224 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 MOCS2-206ENST00000510818 1251 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 HAND2-AS1-235ENST00000515376 951 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 RNU6-583P-201ENST00000516012 92 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 AC090193.1-201ENST00000518633 543 ntTSL 4 BASIC5.03□□□□□ -1.6
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HOXA3O43365 IGKV3D-34-201ENST00000522638 302 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 AC091185.1-201ENST00000523840 528 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
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HOXA3O43365 AP003396.4-201ENST00000527574 265 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 AP002748.2-201ENST00000528671 348 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 ANAPC15-205ENST00000535503 734 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 OR6C73P-201ENST00000546432 358 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 AC110023.1-201ENST00000554318 457 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
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HOXA3O43365 CCL23-201ENST00000612516 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
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HOXA3O43365 NANOGNB-202ENST00000640040 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
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HOXA3O43365 C12orf4-209ENST00000545746 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
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HOXA3O43365 LINC01981-201ENST00000432163 2833 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
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HOXA3O43365 SREK1IP1-204ENST00000513458 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 DCTN5-201ENST00000300087 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 IFI16-201ENST00000295809 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 UGT2B11-201ENST00000446444 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 FAM162A-201ENST00000232125 801 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 CLEC4A-203ENST00000352620 615 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 RNU1-134P-201ENST00000362935 165 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 RNU6-115P-201ENST00000364310 107 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 RNU5E-5P-201ENST00000365379 116 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
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