Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 AL023693.1-201ENST00000434255 216 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 AC084149.1-201ENST00000437233 284 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 RPL5P32-201ENST00000454085 879 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 AC000061.1-201ENST00000456270 376 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 ATP1B1P1-201ENST00000509767 915 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 AC005699.1-201ENST00000510095 555 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 AC008957.1-201ENST00000510740 478 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 AC097103.1-201ENST00000512398 273 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 LINC01060-205ENST00000512839 716 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 AC108064.1-201ENST00000513791 460 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 RAD21-203ENST00000517749 1003 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 AC138832.1-201ENST00000522871 556 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 AC008764.5-201ENST00000597851 190 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 AC099676.1-201ENST00000608886 657 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 FAM27D1-201ENST00000612308 341 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 DNAJC10-209ENST00000613960 1010 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 AL589740.1-204ENST00000634677 630 ntTSL 4 BASIC5.68□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 AL121839.2-201ENST00000565058 6943 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 ZNF285-204ENST00000591679 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.68□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 ZC3H12B-201ENST00000338957 7256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 SDR42E1-201ENST00000328945 11566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 ASB5-201ENST00000296525 3031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 PTER-201ENST00000298942 3448 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 AC073136.1-201ENST00000449426 2884 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 RAP1GDS1-205ENST00000408927 3681 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 PHACTR2-207ENST00000427704 9531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 ABCA12-201ENST00000272895 9100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 GABRA2-206ENST00000507460 5812 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 NSD1-204ENST00000439151 12892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 C15orf41-212ENST00000567389 2618 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 AL132656.2-201ENST00000482985 1837 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 CNGA1-209ENST00000544810 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 AC008079.2-201ENST00000623543 20396 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 PTPRD-213ENST00000537002 8224 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 AKAP9-201ENST00000356239 12471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 STX19-201ENST00000315099 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 NAP1L4P1-201ENST00000319092 1157 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 RNU1-83P-201ENST00000363426 164 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 RNA5SP283-201ENST00000365604 119 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 AL583835.1-201ENST00000399570 407 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 RN7SKP33-201ENST00000410942 340 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 AL590609.3-201ENST00000411815 210 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 RPL6P29-201ENST00000414863 865 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 RANP7-201ENST00000418085 644 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 MFSD13B-201ENST00000420133 1290 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 DPYD-AS2-201ENST00000422259 788 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 LINC01307-202ENST00000444327 771 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 EIF4A2P2-201ENST00000455776 1070 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 SAP18P1-201ENST00000512058 390 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 AC010255.3-204ENST00000514637 454 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 MED28P5-201ENST00000528254 438 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 OR5BC1P-201ENST00000529327 739 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 AC095350.2-201ENST00000544034 201 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 SNRPGP1-201ENST00000553864 222 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 AC009852.2-201ENST00000567898 485 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 AC010547.7-201ENST00000570323 333 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 AC004908.3-201ENST00000610248 625 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 C2orf91-203ENST00000615044 393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 AC008785.1-201ENST00000624475 456 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 SMAD4-202ENST00000398417 8495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 BICRAL-201ENST00000314073 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 LUZP2-207ENST00000533227 5016 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 NXPH1-205ENST00000602349 1953 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 AL122126.1-201ENST00000546905 1318 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 C1orf112-202ENST00000359326 4002 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 WDR72-204ENST00000559418 3602 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 IRAK1BP1-204ENST00000607739 1387 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 IQCB2P-201ENST00000401788 1633 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 AL133243.3-201ENST00000617415 3004 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 HERC4-205ENST00000412272 4211 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 STXBP4-204ENST00000434978 2807 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 WDR89-201ENST00000267522 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 AC100871.1-201ENST00000507871 1456 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 AC120036.2-201ENST00000509729 1474 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 HACD3-211ENST00000569894 1471 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 VPS35P1-201ENST00000563400 1518 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 OR8G1-201ENST00000341493 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 RNU1-14P-201ENST00000362759 152 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 RN7SKP235-201ENST00000410662 305 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 OR8G2P-201ENST00000412796 908 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 RPL21P91-201ENST00000429231 479 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 GYG2-AS1-201ENST00000445107 515 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 AC036101.1-201ENST00000449272 597 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 IMMP2L-205ENST00000450877 761 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 AL353718.1-201ENST00000451028 517 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 SNORA84-201ENST00000459229 133 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 AC010374.1-201ENST00000503762 1237 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 AL592156.1-201ENST00000508758 304 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 SPINK9-202ENST00000511717 604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 AC004801.3-201ENST00000547602 962 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 AL355096.1-201ENST00000553561 447 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 AL049835.1-201ENST00000555850 514 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 TVP23BP1-201ENST00000557500 617 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 AC074237.1-201ENST00000577674 471 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 AC091178.1-203ENST00000584586 279 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 HMGB2P1-201ENST00000591146 634 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 CLIC4P2-201ENST00000601934 717 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 RPAP2P1-201ENST00000603626 1168 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 AL161912.3-201ENST00000605404 628 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 AL021997.2-201ENST00000615674 271 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.5 ms