Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ13

SHOC2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, humanhuman

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Length 582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOC2Q9UQ13 AL356056.1-206ENST00000424615 407 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
SHOC2Q9UQ13 AL049749.1-201ENST00000430281 632 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
SHOC2Q9UQ13 CYCSP6-201ENST00000434498 302 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
SHOC2Q9UQ13 HMGB3P10-201ENST00000434734 572 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
SHOC2Q9UQ13 FTH1P16-201ENST00000435241 552 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
SHOC2Q9UQ13 CYCSP12-201ENST00000437729 300 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
SHOC2Q9UQ13 GAPDHP58-201ENST00000438477 1006 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
SHOC2Q9UQ13 AL122019.1-201ENST00000438575 798 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
SHOC2Q9UQ13 FLJ27354-202ENST00000443562 770 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
SHOC2Q9UQ13 GAPDHP25-201ENST00000447061 1001 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
SHOC2Q9UQ13 AC005002.1-201ENST00000447458 540 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
SHOC2Q9UQ13 LINC00709-201ENST00000458168 494 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
SHOC2Q9UQ13 LINC02077-201ENST00000465795 409 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
SHOC2Q9UQ13 C1orf185-202ENST00000467127 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
SHOC2Q9UQ13 AC004069.1-201ENST00000504082 549 ntTSL 4 BASIC5.43□□□□□ -1.54
SHOC2Q9UQ13 snoZ278.1-201ENST00000517059 112 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
SHOC2Q9UQ13 AC027419.2-201ENST00000518439 497 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
SHOC2Q9UQ13 AC083923.1-201ENST00000523708 376 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
SHOC2Q9UQ13 AC130404.1-201ENST00000539362 739 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
SHOC2Q9UQ13 AC092140.1-201ENST00000563090 549 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
SHOC2Q9UQ13 AC005670.2-201ENST00000571841 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
SHOC2Q9UQ13 MTCO1P40-201ENST00000574371 625 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
SHOC2Q9UQ13 AC022098.3-201ENST00000590715 315 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
SHOC2Q9UQ13 AC004862.1-203ENST00000598433 1020 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
SHOC2Q9UQ13 AC092902.2-202ENST00000599350 686 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
SHOC2Q9UQ13 AL353811.1-201ENST00000602851 736 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
SHOC2Q9UQ13 AC011626.1-201ENST00000604710 562 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
SHOC2Q9UQ13 AC064807.4-201ENST00000607201 407 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
SHOC2Q9UQ13 MIR6862-1-201ENST00000613016 70 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
SHOC2Q9UQ13 VN1R74P-201ENST00000613259 503 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
SHOC2Q9UQ13 MIR6862-2-201ENST00000614755 70 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
SHOC2Q9UQ13 VN1R7P-201ENST00000619242 903 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
SHOC2Q9UQ13 ZNF663P-202ENST00000641770 1131 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
SHOC2Q9UQ13 LINC01085-201ENST00000502759 1984 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
SHOC2Q9UQ13 AL445623.2-201ENST00000640307 4805 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
SHOC2Q9UQ13 USP28-213ENST00000544967 3498 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
SHOC2Q9UQ13 CYP4Z2P-201ENST00000423332 1512 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
SHOC2Q9UQ13 AC107021.2-201ENST00000567714 2095 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
SHOC2Q9UQ13 MTND5P31-201ENST00000419366 1374 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
SHOC2Q9UQ13 AC005261.4-201ENST00000600047 1385 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
SHOC2Q9UQ13 AC114947.2-201ENST00000565748 2125 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
SHOC2Q9UQ13 MYO3A-203ENST00000376302 2723 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
SHOC2Q9UQ13 STXBP4-202ENST00000398391 2160 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
SHOC2Q9UQ13 TJP1-209ENST00000545208 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
SHOC2Q9UQ13 IQCJ-SCHIP1-205ENST00000527095 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
SHOC2Q9UQ13 SLC10A7-203ENST00000432059 3747 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
SHOC2Q9UQ13 MED13-201ENST00000397786 10465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
SHOC2Q9UQ13 OR5T3-202ENST00000313033 969 ntAPPRIS P1 BASIC5.42□□□□□ -1.54
SHOC2Q9UQ13 RNA5SP335-201ENST00000363817 110 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
SHOC2Q9UQ13 RN7SKP269-201ENST00000365545 319 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
SHOC2Q9UQ13 SNORD116.1-201ENST00000365628 92 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
SHOC2Q9UQ13 RNU6-549P-201ENST00000384433 107 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
SHOC2Q9UQ13 ATXN10-203ENST00000402380 564 ntTSL 4 BASIC5.42□□□□□ -1.54
SHOC2Q9UQ13 RNU6ATAC18P-201ENST00000408413 101 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
SHOC2Q9UQ13 RPL35AP24-201ENST00000413846 330 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
SHOC2Q9UQ13 OR4K6P-201ENST00000416478 897 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
SHOC2Q9UQ13 AC079355.1-201ENST00000421770 223 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
SHOC2Q9UQ13 ZDHHC20P2-201ENST00000424108 429 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
SHOC2Q9UQ13 LINC02238-201ENST00000424953 557 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
SHOC2Q9UQ13 LINC00458-202ENST00000427299 1030 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
SHOC2Q9UQ13 USP9YP11-201ENST00000427537 717 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
SHOC2Q9UQ13 AL451140.1-201ENST00000430534 371 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
SHOC2Q9UQ13 AL512271.1-201ENST00000439878 434 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
SHOC2Q9UQ13 FGF7P5-201ENST00000441829 291 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
SHOC2Q9UQ13 RPS26P30-201ENST00000443431 335 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
SHOC2Q9UQ13 NPM1P13-201ENST00000452663 865 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
SHOC2Q9UQ13 ART2BP-201ENST00000453501 499 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
SHOC2Q9UQ13 MRPL35P4-201ENST00000453682 566 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
SHOC2Q9UQ13 TTTY19-201ENST00000453955 269 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
SHOC2Q9UQ13 SIAH1P1-201ENST00000479411 923 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
SHOC2Q9UQ13 AC093890.1-201ENST00000502554 540 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
SHOC2Q9UQ13 RPL7L1P4-201ENST00000513004 707 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
SHOC2Q9UQ13 AC104619.2-201ENST00000514293 646 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
SHOC2Q9UQ13 AC097535.1-201ENST00000515263 332 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
SHOC2Q9UQ13 AC138938.1-201ENST00000515431 782 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
SHOC2Q9UQ13 Y_RNA.688-201ENST00000516565 95 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
SHOC2Q9UQ13 HDAC2-AS2-217ENST00000523087 493 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
SHOC2Q9UQ13 SMARCE1P3-201ENST00000553649 1231 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
SHOC2Q9UQ13 LINC02290-201ENST00000554187 608 ntTSL 4 BASIC5.42□□□□□ -1.54
SHOC2Q9UQ13 AC018557.2-201ENST00000565082 536 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
SHOC2Q9UQ13 LINC02137-203ENST00000567448 930 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
SHOC2Q9UQ13 AC091544.5-202ENST00000568297 374 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
SHOC2Q9UQ13 MIR548Y-201ENST00000582739 110 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
SHOC2Q9UQ13 AC016382.1-201ENST00000583580 387 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
SHOC2Q9UQ13 AP001269.3-201ENST00000588718 329 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
SHOC2Q9UQ13 AC005252.1-201ENST00000604518 1063 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
SHOC2Q9UQ13 AC009597.2-201ENST00000604659 592 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
SHOC2Q9UQ13 AL133507.1-201ENST00000605269 557 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
SHOC2Q9UQ13 AC080013.6-201ENST00000606185 215 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
SHOC2Q9UQ13 AC009093.5-201ENST00000620963 359 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
SHOC2Q9UQ13 AC021106.3-201ENST00000623925 531 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
SHOC2Q9UQ13 TATDN1-221ENST00000630259 915 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
SHOC2Q9UQ13 LEUTX-202ENST00000638280 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
SHOC2Q9UQ13 AC138409.2-201ENST00000514048 5001 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
SHOC2Q9UQ13 AL121950.1-201ENST00000624993 2077 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
SHOC2Q9UQ13 FILIP1-202ENST00000370020 4051 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
SHOC2Q9UQ13 IL31RA-204ENST00000396834 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
SHOC2Q9UQ13 AC007342.5-201ENST00000571340 2142 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
SHOC2Q9UQ13 RALGAPB-202ENST00000397040 8435 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
SHOC2Q9UQ13 AC104446.1-201ENST00000613728 1321 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
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