Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0W8

SMG9, Protein SMG9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG9Q9H0W8 MTND4P27-201ENST00000450813 1354 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SMG9Q9H0W8 ERC1-204ENST00000397203 9118 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SMG9Q9H0W8 NXF4-201ENST00000360035 3617 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SMG9Q9H0W8 TAOK1-202ENST00000536202 4068 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
SMG9Q9H0W8 NEDD9-216ENST00000620854 4086 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SMG9Q9H0W8 FSTL5-202ENST00000379164 4757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
SMG9Q9H0W8 ST6GAL1-211ENST00000448044 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
SMG9Q9H0W8 AC093010.2-202ENST00000493033 3023 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SMG9Q9H0W8 PPIL1-201ENST00000373699 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
SMG9Q9H0W8 HSD17B4-202ENST00000414835 2551 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SMG9Q9H0W8 AGR3-201ENST00000310398 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
SMG9Q9H0W8 TAF13-201ENST00000338366 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
SMG9Q9H0W8 HIST1H1T-201ENST00000338379 718 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SMG9Q9H0W8 RNA5SP188-201ENST00000362916 129 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SMG9Q9H0W8 SNORA51.2-201ENST00000364595 132 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SMG9Q9H0W8 SNORD81.2-201ENST00000365153 76 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SMG9Q9H0W8 S100A5-201ENST00000368717 506 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SMG9Q9H0W8 LCN1P2-201ENST00000372030 223 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SMG9Q9H0W8 SNORA51.9-201ENST00000384295 124 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SMG9Q9H0W8 RNU6-185P-201ENST00000384421 107 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SMG9Q9H0W8 MT-TP-201ENST00000387461 68 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SMG9Q9H0W8 U8.14-201ENST00000390843 143 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SMG9Q9H0W8 AL589647.1-201ENST00000402485 466 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SMG9Q9H0W8 AL049693.1-201ENST00000402760 611 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SMG9Q9H0W8 JKAMPP1-201ENST00000413804 919 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SMG9Q9H0W8 AC005104.1-201ENST00000414896 442 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SMG9Q9H0W8 LINC01362-201ENST00000419658 338 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SMG9Q9H0W8 AC068631.1-204ENST00000428501 534 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SMG9Q9H0W8 RPS29P14-201ENST00000431518 171 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SMG9Q9H0W8 AC002486.1-201ENST00000435098 391 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SMG9Q9H0W8 AC007953.1-201ENST00000450500 560 ntTSL 4 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SMG9Q9H0W8 MYCBP2-AS1-203ENST00000450627 349 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SMG9Q9H0W8 AC025918.1-201ENST00000452467 383 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SMG9Q9H0W8 IQCG-204ENST00000453254 1230 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SMG9Q9H0W8 LINC01072-201ENST00000455848 431 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SMG9Q9H0W8 PEX5L-AS2-201ENST00000462801 630 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SMG9Q9H0W8 RN7SL643P-201ENST00000471845 291 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SMG9Q9H0W8 RPL35P6-201ENST00000490024 372 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SMG9Q9H0W8 LINC02005-201ENST00000498832 782 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SMG9Q9H0W8 IGBP1P4-201ENST00000503202 879 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SMG9Q9H0W8 AC093864.1-201ENST00000504555 745 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SMG9Q9H0W8 HMGB1P28-201ENST00000507778 552 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SMG9Q9H0W8 AC010486.1-201ENST00000511793 424 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SMG9Q9H0W8 RNA5SP216-201ENST00000516111 123 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SMG9Q9H0W8 RNU6-1281P-201ENST00000516223 105 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SMG9Q9H0W8 AC025524.1-201ENST00000518489 606 ntTSL 4 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SMG9Q9H0W8 CASC21-201ENST00000521586 290 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
SMG9Q9H0W8 AP003122.4-201ENST00000530980 758 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SMG9Q9H0W8 AP001804.2-201ENST00000533932 910 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SMG9Q9H0W8 LINC02460-201ENST00000543558 536 ntTSL 4 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SMG9Q9H0W8 TSSK4-207ENST00000556621 896 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
SMG9Q9H0W8 SLC12A1-210ENST00000561031 735 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SMG9Q9H0W8 AC007151.1-201ENST00000572774 483 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SMG9Q9H0W8 FAM106CP-201ENST00000582212 507 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SMG9Q9H0W8 AC018695.5-201ENST00000605872 315 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SMG9Q9H0W8 LINC02362-201ENST00000608785 516 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SMG9Q9H0W8 LINC02362-202ENST00000610683 724 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SMG9Q9H0W8 AC015574.1-205ENST00000611285 524 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SMG9Q9H0W8 ERC2-214ENST00000612797 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
SMG9Q9H0W8 AC092683.1-207ENST00000620051 837 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SMG9Q9H0W8 SNX18P12-201ENST00000624821 759 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SMG9Q9H0W8 LINC01955-201ENST00000626392 792 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SMG9Q9H0W8 LINC00850-201ENST00000629221 685 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
SMG9Q9H0W8 MAGEB16-203ENST00000399988 1682 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SMG9Q9H0W8 POLQ-204ENST00000621776 9055 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SMG9Q9H0W8 GOLT1B-201ENST00000229314 3227 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
SMG9Q9H0W8 MAPK10-323ENST00000641493 3207 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SMG9Q9H0W8 FAM114A2-201ENST00000351797 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
SMG9Q9H0W8 DAZ1-201ENST00000382510 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
SMG9Q9H0W8 ZNF585B-203ENST00000527838 2732 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
SMG9Q9H0W8 OR2AH1P-202ENST00000641232 2744 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SMG9Q9H0W8 RAI14-228ENST00000515799 3486 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
SMG9Q9H0W8 AL591848.4-201ENST00000567832 3472 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SMG9Q9H0W8 MTCO1P11-201ENST00000429111 1528 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SMG9Q9H0W8 FAM208A-210ENST00000614531 3441 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
SMG9Q9H0W8 AC007744.1-201ENST00000607540 2289 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SMG9Q9H0W8 MAPK10-383ENST00000642032 3390 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SMG9Q9H0W8 CYLC2-204ENST00000612124 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
SMG9Q9H0W8 CASC18-202ENST00000548557 2503 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
SMG9Q9H0W8 LINC01903-201ENST00000580659 2149 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
SMG9Q9H0W8 AAK1-203ENST00000409085 11345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SMG9Q9H0W8 ZNF630-202ENST00000409324 2455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
SMG9Q9H0W8 CX3CR1-201ENST00000358309 3151 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SMG9Q9H0W8 ZNF559-ZNF177-203ENST00000541595 2435 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SMG9Q9H0W8 ADTRP-203ENST00000414691 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
SMG9Q9H0W8 AC104162.1-201ENST00000430831 2382 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SMG9Q9H0W8 AC021242.1-201ENST00000507315 2035 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SMG9Q9H0W8 PGM3-211ENST00000512866 2013 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
SMG9Q9H0W8 LINC01741-201ENST00000427173 1666 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
SMG9Q9H0W8 TAS2R30-201ENST00000539585 1687 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SMG9Q9H0W8 ERG-202ENST00000398897 4651 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SMG9Q9H0W8 PCYT1A-204ENST00000419333 1325 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SMG9Q9H0W8 TTC8-217ENST00000622513 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
SMG9Q9H0W8 AL391262.1-201ENST00000556558 1992 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SMG9Q9H0W8 KLHL2-210ENST00000538127 2907 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
SMG9Q9H0W8 Y_RNA.58-201ENST00000362807 102 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SMG9Q9H0W8 Y_RNA.154-201ENST00000363624 102 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SMG9Q9H0W8 RNY3P1-201ENST00000365085 102 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SMG9Q9H0W8 RNY3-201ENST00000365484 102 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SMG9Q9H0W8 SUGT1P1-201ENST00000379514 476 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
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