Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

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Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 GEMIN2P1-201ENST00000454246 752 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
FOXQ1Q9C009 LINC00430-201ENST00000457672 597 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
FOXQ1Q9C009 RPS27L-205ENST00000462430 681 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
FOXQ1Q9C009 RN7SL269P-201ENST00000467795 305 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
FOXQ1Q9C009 AC112206.1-201ENST00000468416 477 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
FOXQ1Q9C009 AC048346.1-201ENST00000510247 144 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
FOXQ1Q9C009 MTND3P22-201ENST00000510932 243 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
FOXQ1Q9C009 HMGB1P23-201ENST00000518743 568 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
FOXQ1Q9C009 AF117829.1-203ENST00000520306 421 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
FOXQ1Q9C009 GTF2IP11-201ENST00000526931 420 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
FOXQ1Q9C009 AL354920.1-202ENST00000531661 1017 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
FOXQ1Q9C009 LINC02423-202ENST00000542577 460 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
FOXQ1Q9C009 AC117505.1-202ENST00000547027 566 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
FOXQ1Q9C009 AC016526.2-201ENST00000554225 520 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
FOXQ1Q9C009 MIR1269B-201ENST00000580405 75 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
FOXQ1Q9C009 AC004448.4-204ENST00000585389 743 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
FOXQ1Q9C009 DARS-AS1-211ENST00000595061 720 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
FOXQ1Q9C009 DUXAP4-201ENST00000603046 613 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
FOXQ1Q9C009 AL596327.1-201ENST00000603629 213 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
FOXQ1Q9C009 LINC00343-210ENST00000608220 806 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
FOXQ1Q9C009 AC131902.3-201ENST00000611767 581 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
FOXQ1Q9C009 AL359535.1-201ENST00000612100 1087 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
FOXQ1Q9C009 AC118658.2-201ENST00000618697 459 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
FOXQ1Q9C009 AC009033.1-201ENST00000624279 431 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
FOXQ1Q9C009 MIR6863-201ENST00000636112 90 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
FOXQ1Q9C009 MKKS-204ENST00000639674 192 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
FOXQ1Q9C009 HMGN2P46-204ENST00000409454 1923 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
FOXQ1Q9C009 PROX1-202ENST00000366958 8240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
FOXQ1Q9C009 BRCA1-210ENST00000471181 5936 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
FOXQ1Q9C009 NAP1L1-204ENST00000535020 1686 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
FOXQ1Q9C009 TCF7L2-220ENST00000543371 4037 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
FOXQ1Q9C009 DCP1A-206ENST00000610213 5994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
FOXQ1Q9C009 BPESC1-201ENST00000418282 3522 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
FOXQ1Q9C009 AL034370.1-201ENST00000397254 1590 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
FOXQ1Q9C009 UNC13B-209ENST00000635942 14550 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
FOXQ1Q9C009 HABP2-201ENST00000351270 3009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
FOXQ1Q9C009 ZNF66-201ENST00000344519 1745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
FOXQ1Q9C009 VNN3-211ENST00000509351 1700 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
FOXQ1Q9C009 AC010531.4-202ENST00000569872 1718 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
FOXQ1Q9C009 TRAPPC11-209ENST00000512476 2546 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
FOXQ1Q9C009 PIK3C3-202ENST00000398870 9206 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
FOXQ1Q9C009 CASP8-203ENST00000323492 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
FOXQ1Q9C009 C4BPAP1-201ENST00000415474 1893 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
FOXQ1Q9C009 CDR1-202ENST00000625883 1485 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
FOXQ1Q9C009 ARCN1-202ENST00000359415 4038 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
FOXQ1Q9C009 AL031985.3-201ENST00000565390 2449 ntBASIC6.21□□□□□ -1.41
FOXQ1Q9C009 IRF6-201ENST00000367021 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
FOXQ1Q9C009 ST6GAL1-211ENST00000448044 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
FOXQ1Q9C009 LRRC37A3-203ENST00000339474 2589 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.41
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FOXQ1Q9C009 PMFBP1-201ENST00000237353 3527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
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FOXQ1Q9C009 INTS12-202ENST00000394735 1927 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.41
FOXQ1Q9C009 NAA15-208ENST00000515576 2456 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.41
FOXQ1Q9C009 AC009804.2-201ENST00000637566 3032 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.41
FOXQ1Q9C009 PROX1-203ENST00000435016 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 TAOK1-202ENST00000536202 4068 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 CACNB2-207ENST00000377329 3396 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
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FOXQ1Q9C009 TXNDC8-202ENST00000374510 455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
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FOXQ1Q9C009 AL354794.1-201ENST00000442103 516 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
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FOXQ1Q9C009 SIAH1P1-201ENST00000479411 923 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
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FOXQ1Q9C009 AC093270.2-201ENST00000486157 792 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 AC096711.2-201ENST00000510592 454 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 NPM1P21-201ENST00000513394 762 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 MYLK-AS2-202ENST00000515464 754 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 AC040970.1-202ENST00000517908 505 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 AC009120.3-201ENST00000563335 499 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 AC138915.2-201ENST00000569776 97 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 AC007431.2-201ENST00000577189 563 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 MIR4505-201ENST00000582238 73 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 AP001029.2-202ENST00000588197 739 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 AC010928.1-202ENST00000589354 473 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 GMFG-212ENST00000602185 423 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 CEACAM7-204ENST00000602225 524 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 FAM27E4-201ENST00000605259 342 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 TPTE2P2-202ENST00000605924 2113 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 RNU6-88P-201ENST00000606801 100 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 UBE2Q2P2-203ENST00000613592 761 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 AL136221.1-201ENST00000621449 509 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 ZRANB2-AS2-221ENST00000624050 629 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
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