Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 OR51K1P-201ENST00000510214 950 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
USF2Q15853 AC096759.1-201ENST00000510744 473 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
USF2Q15853 AC008575.1-201ENST00000520401 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
USF2Q15853 AC022874.1-201ENST00000526382 550 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
USF2Q15853 AC090457.1-201ENST00000579775 211 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
USF2Q15853 AC138207.6-203ENST00000581652 565 ntTSL 4 BASIC3.9□□□□□ -1.79
USF2Q15853 ZNF227-204ENST00000586228 569 ntTSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
USF2Q15853 FKBP1AP1-201ENST00000594588 318 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
USF2Q15853 AL591926.2-202ENST00000615199 719 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
USF2Q15853 MIR6886-201ENST00000619864 61 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
USF2Q15853 MIR6837-201ENST00000620884 64 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
USF2Q15853 AC072062.1-209ENST00000627336 772 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
USF2Q15853 PPP1R9A-208ENST00000456331 10090 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
USF2Q15853 MOCS2-203ENST00000450852 1337 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
USF2Q15853 CIR1P2-201ENST00000514821 1342 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
USF2Q15853 LINC02302-201ENST00000556405 2904 ntTSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
USF2Q15853 IFI16-208ENST00000448393 2245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
USF2Q15853 PUS7L-203ENST00000431332 1873 ntTSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
USF2Q15853 C17orf78-204ENST00000615133 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
USF2Q15853 LINC01247-201ENST00000448901 4209 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
USF2Q15853 ADGRL2-208ENST00000370725 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
USF2Q15853 CLSPN-206ENST00000520551 4010 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
USF2Q15853 FER-201ENST00000281092 12119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
USF2Q15853 ALB-219ENST00000621085 1418 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
USF2Q15853 PRRG1-202ENST00000449135 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
USF2Q15853 AC003092.2-201ENST00000411946 446 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
USF2Q15853 TRBV29-1-201ENST00000422143 402 ntAPPRIS P1 BASIC3.89□□□□□ -1.79
USF2Q15853 AP000233.1-201ENST00000426609 291 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
USF2Q15853 AL031428.1-201ENST00000427154 666 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
USF2Q15853 GNGT1-204ENST00000430875 628 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
USF2Q15853 STXBP5-AS1-204ENST00000431143 644 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
USF2Q15853 AFF2-IT1-201ENST00000435346 443 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
USF2Q15853 AF127577.2-201ENST00000436429 824 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
USF2Q15853 USP9YP7-201ENST00000436723 430 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
USF2Q15853 PSMD10P3-201ENST00000437000 448 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
USF2Q15853 LINC01704-202ENST00000442358 649 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
USF2Q15853 AC091685.1-201ENST00000442436 448 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
USF2Q15853 TTTY22-201ENST00000445253 427 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
USF2Q15853 H2AFZP5-201ENST00000446960 382 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
USF2Q15853 AC068492.1-201ENST00000448672 469 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
USF2Q15853 LINC01034-201ENST00000448806 277 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
USF2Q15853 USP9YP32-201ENST00000452432 430 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
USF2Q15853 FO393415.3-201ENST00000456424 375 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
USF2Q15853 SSR3-206ENST00000476217 807 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
USF2Q15853 AC025445.1-201ENST00000502728 300 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
USF2Q15853 MTATP6P22-201ENST00000507369 598 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
USF2Q15853 LINC01088-203ENST00000507476 785 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
USF2Q15853 ERVH-1-201ENST00000507666 639 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
USF2Q15853 AC108866.1-202ENST00000511064 573 ntTSL 4 BASIC3.89□□□□□ -1.79
USF2Q15853 ZCCHC10-210ENST00000513848 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
USF2Q15853 ATP5LP3-201ENST00000514223 304 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
USF2Q15853 ENPP7P9-201ENST00000514456 627 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
USF2Q15853 BX510359.5-201ENST00000515651 304 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
USF2Q15853 Vault.1-201ENST00000516474 102 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
USF2Q15853 RNU6-1308P-201ENST00000516817 103 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
USF2Q15853 LINC00535-202ENST00000517785 264 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
USF2Q15853 AC090572.2-201ENST00000520649 761 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
USF2Q15853 IGLV2-28-201ENST00000520681 304 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
USF2Q15853 RPL23AP53-201ENST00000521854 457 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
USF2Q15853 NSMCE2-210ENST00000522563 1037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
USF2Q15853 HDAC2-AS2-217ENST00000523087 493 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
USF2Q15853 MAL2-208ENST00000523307 556 ntTSL 4 BASIC3.89□□□□□ -1.79
USF2Q15853 GTF2H1-208ENST00000526630 932 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
USF2Q15853 AP001360.2-201ENST00000534423 562 ntTSL 4 BASIC3.89□□□□□ -1.79
USF2Q15853 TNFSF11-205ENST00000544862 818 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
USF2Q15853 AL049779.2-201ENST00000553847 315 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
USF2Q15853 DISC1FP1-202ENST00000562245 774 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
USF2Q15853 AC106785.3-201ENST00000564064 847 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
USF2Q15853 AC116553.2-201ENST00000564203 463 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
USF2Q15853 AC022154.1-203ENST00000594850 493 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
USF2Q15853 LINC02098-201ENST00000608492 475 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
USF2Q15853 AC116651.1-201ENST00000609724 556 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
USF2Q15853 AK6-205ENST00000618980 483 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
USF2Q15853 OR52B5P-202ENST00000641118 1110 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
USF2Q15853 CASC19-264ENST00000641912 1184 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
USF2Q15853 MAPK10-208ENST00000395169 4049 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
USF2Q15853 EDIL3-202ENST00000380138 4244 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
USF2Q15853 KATNA1-202ENST00000335647 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
USF2Q15853 MGA-201ENST00000219905 12042 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
USF2Q15853 PANDAR-201ENST00000629595 1506 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
USF2Q15853 CEP170-202ENST00000366542 6828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
USF2Q15853 NFAT5-203ENST00000393742 13067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
USF2Q15853 MTRR-202ENST00000440940 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
USF2Q15853 RNF6P1-201ENST00000444889 1784 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
USF2Q15853 CEP112-204ENST00000537949 2847 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
USF2Q15853 AC087565.3-202ENST00000642085 1603 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
USF2Q15853 AL359715.4-201ENST00000606629 1436 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
USF2Q15853 SCN3A-201ENST00000283254 9091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
USF2Q15853 RAPH1-203ENST00000374493 3909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
USF2Q15853 UBE2D2-201ENST00000253815 444 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
USF2Q15853 RNU6-618P-201ENST00000363518 112 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
USF2Q15853 RN7SKP160-201ENST00000363804 340 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
USF2Q15853 RNU1-43P-201ENST00000365052 165 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
USF2Q15853 TRAJ7-201ENST00000390530 59 ntAPPRIS P1 BASIC3.88□□□□□ -1.79
USF2Q15853 SNORA77-201ENST00000408716 125 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
USF2Q15853 RN7SKP114-201ENST00000410327 279 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
USF2Q15853 AL133480.1-201ENST00000411561 638 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
USF2Q15853 AC025946.1-201ENST00000413286 430 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
USF2Q15853 TMBIM7P-201ENST00000418074 855 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
USF2Q15853 HNRNPA3P4-201ENST00000427514 803 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
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