Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 AC099782.1-201ENST00000425889 474 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 OR5BE1P-201ENST00000425977 939 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 IPMKP1-201ENST00000425988 855 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 AC024619.1-202ENST00000426489 495 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 AL031736.2-201ENST00000426573 787 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 C8orf59P1-201ENST00000429930 303 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 AL160004.1-201ENST00000434311 478 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 AL731544.1-201ENST00000436500 370 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 AL139327.2-202ENST00000437057 400 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 NDUFS5P5-201ENST00000437256 321 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 AL365258.1-201ENST00000440885 247 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 RPS26P56-201ENST00000444468 240 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 DARS-AS1-206ENST00000446492 488 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 AC073909.1-201ENST00000447112 999 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 AC132807.1-201ENST00000449613 458 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 AC016724.1-201ENST00000453215 421 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 AC097493.1-201ENST00000463958 372 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 RPL30P9-201ENST00000465586 330 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 AC128716.1-201ENST00000475129 166 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 KLHL6-AS1-201ENST00000491676 503 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 AC090638.1-201ENST00000498296 909 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 PTPN20-212ENST00000502254 599 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 MTCYBP17-201ENST00000503579 789 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 AC104663.1-201ENST00000508555 557 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 ZFPM2-AS1-201ENST00000509144 542 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 AC090833.1-201ENST00000513853 806 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 AC091979.1-201ENST00000517595 706 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 AP001208.1-201ENST00000518612 408 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 LINC00944-202ENST00000540684 888 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 AC011603.3-201ENST00000549516 279 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 AC068643.2-202ENST00000552759 622 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 AC079793.1-201ENST00000553076 713 ntTSL 4 BASIC5.3□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 AL157756.1-203ENST00000553269 600 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 AL157871.6-201ENST00000553954 206 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 AC007686.2-201ENST00000554043 469 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 PSMB7P1-201ENST00000556349 514 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 AC090888.3-201ENST00000558917 509 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 AC013652.2-202ENST00000558948 910 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 DCTN5-207ENST00000568272 523 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 AC138907.7-201ENST00000568972 358 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 AC139099.3-202ENST00000574856 439 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 ABBA01006766.1-201ENST00000584728 294 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 AC006504.5-202ENST00000586784 656 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 LINC01966-201ENST00000595809 821 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 IGKV2OR2-1-201ENST00000605129 304 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 AC239868.4-201ENST00000608318 671 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 AC015574.1-205ENST00000611285 524 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 MIR6071-201ENST00000616741 78 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 AC018755.4-201ENST00000619715 454 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 ZNHIT3-208ENST00000619730 926 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 SEC23A-215ENST00000625395 261 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 AC116667.2-201ENST00000641075 823 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 OR5BE1P-202ENST00000641168 1176 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 MLH1-206ENST00000435176 2428 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 ZNF737-201ENST00000427401 2867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 ENTPD1-AS1-202ENST00000416301 4241 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 SLC2A3P1-201ENST00000519666 1451 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 MATR3-230ENST00000394800 5513 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 SMCO3-201ENST00000316048 2104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 KCNJ16-205ENST00000586462 1897 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 AL356473.1-201ENST00000406203 1408 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 LINC01630-202ENST00000578152 3188 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 MAPK6PS2-201ENST00000379571 2060 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 RFX4-201ENST00000229387 3378 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 PPP1R1C-201ENST00000280295 1636 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 PSMA8-205ENST00000612461 1619 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 LGI1-212ENST00000630184 2936 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 MAGI2-205ENST00000519748 3316 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 LRRC37B-204ENST00000543378 3091 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 AC098679.1-203ENST00000505532 2227 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 SMG1-201ENST00000330588 1588 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 LINGO2-204ENST00000613945 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 BRCA1-203ENST00000357654 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 AL162726.3-201ENST00000637606 1301 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 CFAP221-215ENST00000598644 1532 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 BICD1-204ENST00000548411 8811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 CALN1-204ENST00000405452 8571 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 CD84-201ENST00000311224 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 OR4A15-201ENST00000314706 1035 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 ZNF28-201ENST00000339844 650 ntTSL 4 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 LINC02384-201ENST00000360485 471 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 RNA5SP514-201ENST00000363717 111 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 PKIB-203ENST00000368446 556 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 ZNF788-202ENST00000397759 777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 SMARCE1P6-201ENST00000398372 1216 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 AL133384.1-201ENST00000412744 351 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 NUTM2A-AS1-203ENST00000413961 501 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 AC009302.1-201ENST00000417147 390 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 RPL21P50-201ENST00000417698 477 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 AC092484.1-201ENST00000420548 833 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 AC092647.1-201ENST00000420654 287 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 AL672277.1-201ENST00000420865 588 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 AC099336.2-201ENST00000422457 254 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 AL389915.1-201ENST00000422463 466 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 RPL7AP14-201ENST00000424041 802 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 AL451042.1-201ENST00000426353 544 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 AL365184.2-201ENST00000431139 435 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 AC012668.2-201ENST00000431727 503 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 LINC01884-201ENST00000433429 440 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 HCG14-201ENST00000444986 413 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90 ms