Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 RNU1-87P-201ENST00000363727 170 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 OR2M5-201ENST00000366476 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 OR1L1-202ENST00000373686 1083 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 TRGV10-201ENST00000390341 512 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 MTCO2P31-201ENST00000402702 684 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 AL355300.1-201ENST00000412439 187 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 OR51A3P-201ENST00000413596 924 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 AL391645.1-201ENST00000417409 506 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 AC127526.2-201ENST00000426436 775 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 AP000695.2-201ENST00000428667 715 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 AP001476.3-201ENST00000429512 415 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 AL645634.2-201ENST00000431956 411 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 RPL23AP15-201ENST00000450202 459 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 AL049548.1-201ENST00000458194 385 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 AC004692.2-203ENST00000458590 497 ntTSL 4 BASIC5.63□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 PTPN20-212ENST00000502254 599 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 AC005674.1-201ENST00000503493 459 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 NENFP3-201ENST00000503735 313 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 TPT1P8-201ENST00000510120 555 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 SNORD46.2-201ENST00000516021 102 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 RN7SKP96-201ENST00000516948 297 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 snoZ278.1-201ENST00000517059 112 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 LINCR-0001-202ENST00000518098 524 ntTSL 4 BASIC5.63□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 AC105031.1-201ENST00000518550 476 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 AC084838.1-201ENST00000532973 312 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 AC087623.1-201ENST00000533301 377 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 GYPA-211ENST00000535709 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 LINC02400-201ENST00000548210 351 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 AC090109.1-201ENST00000548885 819 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 AC020612.3-201ENST00000550644 570 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 LINC02406-201ENST00000553029 546 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 SERPINE4P-201ENST00000554978 281 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 PWRN1-207ENST00000565893 818 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 AC008521.2-201ENST00000591021 259 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 AC003991.1-201ENST00000594469 484 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 AC012313.4-201ENST00000596296 495 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 AP000769.2-201ENST00000602344 396 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 AP004247.3-201ENST00000608682 624 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 AC007204.2-201ENST00000615022 616 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 AL513314.2-202ENST00000617077 536 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 AL513314.2-201ENST00000621440 545 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 AP003485.1-201ENST00000625093 753 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 WISP3-211ENST00000639360 1026 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 AC087565.3-203ENST00000641018 837 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 SDC2-204ENST00000519914 1318 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 NBPF14-206ENST00000614999 10080 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 DDX18P3-201ENST00000404856 2007 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 ZNF92-203ENST00000431504 2947 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 OR4S2-202ENST00000641692 2211 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 IQCG-201ENST00000265239 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 AC006210.2-201ENST00000367074 1545 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 SLC38A11-204ENST00000409662 1542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 INTU-201ENST00000335251 13233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 TMEM154-201ENST00000304385 10698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 SEC31A-226ENST00000508479 3397 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 LINC01289-201ENST00000519550 3712 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 SAMSN1-203ENST00000400566 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 WDR7-201ENST00000254442 14083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 AL158835.1-203ENST00000415305 3149 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 CEP97-201ENST00000341893 8361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 C10orf120-201ENST00000329446 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
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BRD3Q15059 HMGB1P20-201ENST00000402555 677 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 OR6C64P-201ENST00000419708 825 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
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BRD3Q15059 AC008592.4-201ENST00000509999 450 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
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BRD3Q15059 LINC01030-201ENST00000517505 738 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 AC079600.1-201ENST00000550326 297 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 AC004217.3-201ENST00000551552 878 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 AC026462.4-202ENST00000564331 532 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
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BRD3Q15059 AC016493.1-201ENST00000586106 688 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 AC010618.3-202ENST00000598141 476 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 GMFG-212ENST00000602185 423 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 AC027243.2-201ENST00000602530 724 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 AC010857.1-201ENST00000606398 594 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 AC109583.2-201ENST00000617367 129 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 AL390318.1-201ENST00000624564 687 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 AP003400.3-201ENST00000624904 346 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 OR4G3P-201ENST00000633500 913 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 LINC01359-206ENST00000634775 888 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 PPP2R2A-224ENST00000640787 318 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
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