Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 AL157938.2-205ENST00000586290 891 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
TRAM2Q15035 AC008794.2-201ENST00000587779 293 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
TRAM2Q15035 AL008635.1-201ENST00000609073 385 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
TRAM2Q15035 AL353726.1-201ENST00000614041 1000 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
TRAM2Q15035 AC026368.1-201ENST00000614934 690 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
TRAM2Q15035 AC087632.1-216ENST00000625619 487 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
TRAM2Q15035 CGA-206ENST00000630630 832 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
TRAM2Q15035 NKRF-202ENST00000371527 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
TRAM2Q15035 LINC01289-201ENST00000519550 3712 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
TRAM2Q15035 COPS2-202ENST00000388901 6628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
TRAM2Q15035 AC092329.3-201ENST00000611392 1904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
TRAM2Q15035 MS4A1-201ENST00000345732 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
TRAM2Q15035 AL590399.5-201ENST00000428709 3325 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
TRAM2Q15035 N4BP2L2-201ENST00000267068 9427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
TRAM2Q15035 IRF5P1-201ENST00000504852 2164 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
TRAM2Q15035 VPS13C-202ENST00000261517 13400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
TRAM2Q15035 CARF-203ENST00000414439 2099 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
TRAM2Q15035 AC007390.2-201ENST00000606229 3803 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
TRAM2Q15035 SCGB2A2-202ENST00000525380 1305 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
TRAM2Q15035 GCSAML-206ENST00000527084 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
TRAM2Q15035 NCOA1-201ENST00000288599 6952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
TRAM2Q15035 OR2L3-202ENST00000641161 2830 ntAPPRIS P1 BASIC4.19□□□□□ -1.74
TRAM2Q15035 AC009313.2-201ENST00000417893 1941 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
TRAM2Q15035 F8-202ENST00000360256 9059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
TRAM2Q15035 SLC17A1-204ENST00000476801 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
TRAM2Q15035 KLHL13-208ENST00000541812 3102 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
TRAM2Q15035 OR8H1-201ENST00000313022 1038 ntAPPRIS P2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
TRAM2Q15035 RNA5SP151-201ENST00000365632 117 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
TRAM2Q15035 RNU1-44P-201ENST00000384453 163 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
TRAM2Q15035 CASKP1-201ENST00000412870 582 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
TRAM2Q15035 RSU1P3-201ENST00000412878 835 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
TRAM2Q15035 AL031674.1-202ENST00000413070 465 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
TRAM2Q15035 AC062016.2-201ENST00000420950 676 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
TRAM2Q15035 CENPIP1-201ENST00000425713 902 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
TRAM2Q15035 AL133268.3-201ENST00000428903 577 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
TRAM2Q15035 ARL6IP1P2-201ENST00000431356 563 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
TRAM2Q15035 AL034405.1-201ENST00000432062 526 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
TRAM2Q15035 AC076966.1-201ENST00000435560 351 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
TRAM2Q15035 CEACAMP7-201ENST00000444105 496 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
TRAM2Q15035 RPS27AP15-201ENST00000447672 466 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
TRAM2Q15035 AC108463.1-201ENST00000450258 347 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
TRAM2Q15035 AC104763.1-201ENST00000475274 360 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
TRAM2Q15035 AC090013.1-201ENST00000485147 480 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
TRAM2Q15035 RPL36AP41-201ENST00000493820 306 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
TRAM2Q15035 STPG2-AS1-201ENST00000508933 537 ntTSL 4 BASIC4.19□□□□□ -1.74
TRAM2Q15035 AC147055.3-201ENST00000510547 851 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
TRAM2Q15035 LINC02278-201ENST00000512170 500 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
TRAM2Q15035 LINC02429-202ENST00000513836 694 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
TRAM2Q15035 AC091435.2-201ENST00000514586 565 ntTSL 4 BASIC4.19□□□□□ -1.74
TRAM2Q15035 MTHFD2P4-201ENST00000515074 1025 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
TRAM2Q15035 RNU6ATAC24P-201ENST00000516811 135 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
TRAM2Q15035 AB015752.1-201ENST00000521975 578 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
TRAM2Q15035 AC084083.1-201ENST00000526947 722 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
TRAM2Q15035 AC021006.3-201ENST00000530771 192 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
TRAM2Q15035 AP001880.2-201ENST00000538233 448 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
TRAM2Q15035 AC087888.1-201ENST00000550884 1254 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
TRAM2Q15035 AC016987.1-201ENST00000558587 499 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
TRAM2Q15035 LINC02168-201ENST00000565327 352 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
TRAM2Q15035 AP000919.3-201ENST00000582591 568 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
TRAM2Q15035 NPM1P45-201ENST00000583151 559 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
TRAM2Q15035 LINC00907-208ENST00000593051 1092 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
TRAM2Q15035 AC092364.1-202ENST00000593824 565 ntTSL 4 BASIC4.19□□□□□ -1.74
TRAM2Q15035 L34079.2-201ENST00000597119 561 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
TRAM2Q15035 AC123786.2-201ENST00000603459 275 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
TRAM2Q15035 AC034236.3-201ENST00000605999 461 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
TRAM2Q15035 AC015813.4-201ENST00000610469 179 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
TRAM2Q15035 AC116447.1-201ENST00000613153 453 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
TRAM2Q15035 AC097478.4-201ENST00000615968 522 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
TRAM2Q15035 RMST_9.1-201ENST00000619945 193 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
TRAM2Q15035 AL359313.1-202ENST00000635073 544 ntTSL 4 BASIC4.19□□□□□ -1.74
TRAM2Q15035 FILIP1L-209ENST00000487087 2321 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
TRAM2Q15035 AC024940.1-203ENST00000398963 4423 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
TRAM2Q15035 ZNF660-201ENST00000322734 5834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
TRAM2Q15035 ZNF808-201ENST00000359798 3600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
TRAM2Q15035 AC074029.4-201ENST00000624796 1859 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
TRAM2Q15035 ANKRD20A10P-201ENST00000457591 1515 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
TRAM2Q15035 ZFAND6-213ENST00000559835 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
TRAM2Q15035 MAP3K20-202ENST00000375213 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
TRAM2Q15035 AC064875.1-201ENST00000425974 1942 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
TRAM2Q15035 UTP20-201ENST00000261637 9025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
TRAM2Q15035 MBNL3-201ENST00000370839 1575 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
TRAM2Q15035 PMCHL2-201ENST00000415808 1841 ntTSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
TRAM2Q15035 GALNT13-202ENST00000409237 2591 ntTSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
TRAM2Q15035 C4BPAP1-201ENST00000415474 1893 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
TRAM2Q15035 SNCA-AS1-201ENST00000501215 2646 ntTSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
TRAM2Q15035 SEC31A-237ENST00000513858 3687 ntTSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
TRAM2Q15035 KCNRG-201ENST00000312942 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
TRAM2Q15035 MTCO1P11-201ENST00000429111 1528 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
TRAM2Q15035 ZPLD1-202ENST00000466937 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
TRAM2Q15035 DEFB106A-201ENST00000335186 303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
TRAM2Q15035 DEFB106B-201ENST00000335479 316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
TRAM2Q15035 CCNB3-202ENST00000348603 1201 ntTSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
TRAM2Q15035 MIR448-201ENST00000362131 111 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
TRAM2Q15035 RNA5SP507-201ENST00000363603 121 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
TRAM2Q15035 RNA5SP22-201ENST00000365393 109 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
TRAM2Q15035 S100A10-201ENST00000368809 616 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
TRAM2Q15035 CCNB3-203ENST00000376038 1201 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
TRAM2Q15035 RNU1-63P-201ENST00000383902 164 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
TRAM2Q15035 SCP2-205ENST00000408941 1298 ntTSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
TRAM2Q15035 BCL11A-205ENST00000409351 756 ntTSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.3 ms