Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 AC073114.1-201ENST00000612027 490 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
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RAB39AQ14964 AC008083.4-201ENST00000615076 444 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 SNHG5-214ENST00000623001 598 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
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RAB39AQ14964 CPS1-IT1-201ENST00000628368 2306 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
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RAB39AQ14964 MFSD8-239ENST00000641590 2479 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 CD226-201ENST00000280200 12319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 MMP8-201ENST00000236826 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 ZNF83-202ENST00000536937 2726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
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RAB39AQ14964 RN7SKP187-201ENST00000365536 330 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 SLAMF6-201ENST00000368055 730 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
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RAB39AQ14964 RPS3AP26-201ENST00000398259 784 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
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RAB39AQ14964 C1D-204ENST00000410067 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 RNU6-272P-201ENST00000411028 104 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
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RAB39AQ14964 AC104777.3-201ENST00000416350 545 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
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RAB39AQ14964 PMS2-203ENST00000382321 1386 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 AC006206.1-201ENST00000544842 3387 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 AKAP6-212ENST00000557272 4601 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 FGF1-215ENST00000619447 3818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.3□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 NSD1-202ENST00000354179 12195 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 ZNF143-201ENST00000299606 2562 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 KIAA0408-204ENST00000483725 3284 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 USP15-201ENST00000280377 4748 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
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RAB39AQ14964 AC139713.2-209ENST00000509873 1303 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 ANKRD20A17P-201ENST00000511745 1330 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 RASSF8-216ENST00000615708 1328 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 PRUNE2-204ENST00000376718 12584 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 FAM170B-AS1-203ENST00000442525 2000 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 FAM19A1-201ENST00000478136 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 AL353751.1-201ENST00000354541 495 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 WFDC11-202ENST00000356562 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 OR10R3P-201ENST00000361688 942 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
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