Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 THAP12P5-201ENST00000405864 2275 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CHD4Q14839 POSTN-210ENST00000541481 3113 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
CHD4Q14839 SEC24D-211ENST00000511481 2626 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
CHD4Q14839 AC021146.4-201ENST00000309229 279 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CHD4Q14839 PTMAP5-201ENST00000393073 333 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CHD4Q14839 AC007068.1-201ENST00000396690 844 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CHD4Q14839 AC105398.1-201ENST00000446073 402 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CHD4Q14839 AC078828.1-201ENST00000471993 458 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CHD4Q14839 AC107021.1-202ENST00000480247 555 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CHD4Q14839 PLSCR5-202ENST00000482567 1018 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
CHD4Q14839 RPL35P6-201ENST00000490024 372 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CHD4Q14839 F11-205ENST00000492972 1204 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CHD4Q14839 AC092546.1-202ENST00000505628 499 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CHD4Q14839 RN7SKP289-201ENST00000517244 295 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CHD4Q14839 AC105999.1-201ENST00000518722 473 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CHD4Q14839 AC095350.2-201ENST00000544034 201 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CHD4Q14839 RASA1-203ENST00000506290 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CHD4Q14839 MAPK10-372ENST00000641954 3413 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CHD4Q14839 ARPP19-208ENST00000566423 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
CHD4Q14839 MAK-203ENST00000474039 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
CHD4Q14839 ACADSB-201ENST00000358776 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
CHD4Q14839 ANKRD34C-201ENST00000421388 4951 ntAPPRIS P1 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CHD4Q14839 AC015813.1-202ENST00000577267 4056 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CHD4Q14839 RYR3-202ENST00000415757 15557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CHD4Q14839 OR2AG1-202ENST00000641258 6993 ntAPPRIS P1 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CHD4Q14839 HMGN2P31-201ENST00000432430 273 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CHD4Q14839 KCND3-IT1-201ENST00000439736 376 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CHD4Q14839 AL672167.1-201ENST00000441381 464 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CHD4Q14839 RPL7P33-201ENST00000444159 742 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CHD4Q14839 PTMAP3-201ENST00000447474 330 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CHD4Q14839 AL390730.1-201ENST00000457106 692 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CHD4Q14839 AC104849.1-201ENST00000462623 405 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CHD4Q14839 RPL6P9-201ENST00000466502 859 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CHD4Q14839 PPIAP15-201ENST00000479662 484 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CHD4Q14839 LINC00254-201ENST00000563416 662 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CHD4Q14839 AC015802.3-201ENST00000590241 570 ntTSL 4 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CHD4Q14839 RDM1-221ENST00000617591 432 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
CHD4Q14839 AP001002.2-201ENST00000625137 386 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CHD4Q14839 TMEM30CP-203ENST00000637814 1035 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CHD4Q14839 G3BP1-202ENST00000394123 10240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
CHD4Q14839 ATXN3-207ENST00000503767 1315 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
CHD4Q14839 SSR1-202ENST00000397511 3248 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CHD4Q14839 BRCA1-210ENST00000471181 5936 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
CHD4Q14839 MTX3-204ENST00000617335 6155 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CHD4Q14839 SLC17A1-204ENST00000476801 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CHD4Q14839 PMS1-202ENST00000374826 948 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
CHD4Q14839 AL161909.1-201ENST00000397390 712 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
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CHD4Q14839 AC092162.1-201ENST00000432828 434 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
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CHD4Q14839 TFDP2-211ENST00000479040 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
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CHD4Q14839 AC090572.2-201ENST00000520649 761 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
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CHD4Q14839 PHTF2-202ENST00000275575 4541 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
CHD4Q14839 HUWE1-214ENST00000612484 14311 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CHD4Q14839 SGIP1-204ENST00000371039 4080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
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CHD4Q14839 PRB2-201ENST00000389362 1429 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
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CHD4Q14839 FAP-214ENST00000627638 2569 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CHD4Q14839 TRPM6-203ENST00000361255 8271 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
CHD4Q14839 ADGRL2-209ENST00000370727 5164 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CHD4Q14839 OR5P1P-201ENST00000299512 925 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CHD4Q14839 SNORA73.2-201ENST00000364946 201 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
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CHD4Q14839 HYKK-202ENST00000408962 847 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CHD4Q14839 AL390879.2-203ENST00000426943 1121 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CHD4Q14839 AC105940.1-201ENST00000434265 353 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CHD4Q14839 AL353681.1-201ENST00000435828 731 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CHD4Q14839 AL591473.1-201ENST00000464297 313 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CHD4Q14839 AL049873.1-201ENST00000480540 376 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CHD4Q14839 AC018816.1-205ENST00000489771 509 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CHD4Q14839 RNA5SP303-201ENST00000516192 130 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CHD4Q14839 MS4A7-208ENST00000530234 730 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CHD4Q14839 LINC02290-201ENST00000554187 608 ntTSL 4 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CHD4Q14839 RN7SL600P-201ENST00000581811 299 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CHD4Q14839 RALGAPB-202ENST00000397040 8435 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
CHD4Q14839 AC108467.2-201ENST00000617640 1597 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CHD4Q14839 OR5AN1-203ENST00000641998 7647 ntAPPRIS P1 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CHD4Q14839 OR2L3-202ENST00000641161 2830 ntAPPRIS P1 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CHD4Q14839 KCNJ6-201ENST00000609713 19645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
CHD4Q14839 ZNF214-204ENST00000536068 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
CHD4Q14839 SAMD9L-204ENST00000437805 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
CHD4Q14839 EIF2AP4-201ENST00000424793 1781 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CHD4Q14839 GABRA1-220ENST00000638159 4088 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CHD4Q14839 CFHR3-206ENST00000617219 1462 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
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