Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 DCTN5-201ENST00000300087 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 TOX3-202ENST00000407228 3124 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 SLC2A14-221ENST00000616981 3366 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 NAPEPLD-203ENST00000417955 4988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 AC005332.9-201ENST00000620266 2921 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 AC112255.1-201ENST00000624070 2493 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 RORB-201ENST00000376896 9551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 AC087516.2-201ENST00000558963 3042 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 SYTL2-208ENST00000524452 2733 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 HMBOX1-206ENST00000519047 1551 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 CXADR-205ENST00000400169 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 RPL6-201ENST00000202773 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 TAS2R16-201ENST00000249284 997 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 OR13C4-201ENST00000277216 957 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 OR4K15-201ENST00000305051 1216 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 RPL11P4-201ENST00000332269 436 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 Y_RNA.295-201ENST00000364918 102 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 CD52-201ENST00000374213 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 SNORA40.3-201ENST00000390964 122 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 MTCO3P40-201ENST00000392516 676 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 AL590004.1-201ENST00000405321 300 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 AIMP1P1-201ENST00000418670 937 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 OSBPL10-AS1-202ENST00000418728 458 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 SDCBPP3-201ENST00000419629 891 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 LINC01646-201ENST00000420522 682 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 AC006065.1-201ENST00000422539 802 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 HSPD1P12-201ENST00000429127 1069 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 FAM96AP1-201ENST00000430879 482 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 AL133329.1-201ENST00000437466 478 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 AC007003.1-202ENST00000439318 349 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 MIR205HG-206ENST00000440276 539 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 RPS26P30-201ENST00000443431 335 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 AL357514.1-201ENST00000446322 488 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 AP002856.1-201ENST00000447864 562 ntTSL 4 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 VN1R38P-201ENST00000450265 887 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 RN7SL643P-201ENST00000471845 291 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 GM2AP2-201ENST00000491764 562 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 RN7SL362P-201ENST00000494228 267 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 LINC00483-204ENST00000502517 940 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 AC009646.1-201ENST00000510455 318 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 AC026434.1-201ENST00000511474 454 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 LRRC34P2-201ENST00000514850 553 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 COMMD10-206ENST00000515539 869 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 RNU6-1225P-201ENST00000516336 65 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 LACTB2-AS1-203ENST00000518553 817 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 IGKV1D-22-201ENST00000518953 324 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 AC093331.2-201ENST00000520459 677 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 IGHV1-14-201ENST00000523391 241 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 AC007368.1-201ENST00000536422 974 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 DCN-209ENST00000546745 1026 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 AC125611.2-201ENST00000551907 647 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 TPRX1P1-201ENST00000557620 319 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 AC103740.1-202ENST00000558404 542 ntTSL 4 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 AC091117.2-201ENST00000560324 542 ntTSL 4 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 NIFKP8-201ENST00000560500 874 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 AC009039.1-201ENST00000568711 471 ntTSL 4 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 MIR3154-201ENST00000577829 84 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 AP006219.1-201ENST00000580258 472 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 AC060780.3-201ENST00000589464 80 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 AC004917.1-204ENST00000592441 701 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 AC068020.1-201ENST00000594215 661 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 AC130352.1-201ENST00000602979 661 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 BNIP3P11-201ENST00000603878 563 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 AC107214.2-201ENST00000608204 634 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 AC239809.3-208ENST00000611452 531 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 MIR7109-201ENST00000613748 65 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 AC009233.1-201ENST00000616477 371 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 Metazoa_SRP.179-201ENST00000619020 241 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 ZNHIT3-208ENST00000619730 926 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 AL445264.1-201ENST00000621719 171 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 AP003122.6-201ENST00000623831 495 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 DRG1-207ENST00000629688 309 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 ABBA01000935.2-201ENST00000637477 838 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 5S_rRNA.29-201ENST00000641250 107 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 OR4K15-202ENST00000641512 1216 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 DOCK9-208ENST00000448493 7887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 HSPD1P8-201ENST00000400121 1658 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 ANK2-226ENST00000612754 6134 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 AC006213.6-201ENST00000623722 4179 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 QRSL1P1-201ENST00000400977 1540 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 PPBPP2-201ENST00000513150 1362 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 RNF217-202ENST00000368414 1771 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 NSUN3-201ENST00000314622 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 STXBP4-202ENST00000398391 2160 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 LGALS17A-201ENST00000412609 2562 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 CASC19-246ENST00000641625 1606 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 ATP13A4-204ENST00000400270 1458 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 ZNF107-201ENST00000344930 5174 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 IBTK-210ENST00000610980 5195 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 AC009095.1-201ENST00000388909 1326 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 FGFR2-218ENST00000478859 3990 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 AC044839.1-206ENST00000635559 1324 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 SOX2-OT-218ENST00000498731 3576 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 PNLIPRP3-201ENST00000369230 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 ADAMTS9-AS2-203ENST00000481312 1970 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 TRPC4-210ENST00000625583 3009 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 SBNO1-201ENST00000267176 11121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 NAPG-201ENST00000322897 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 AC005480.1-202ENST00000555916 3548 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 KIAA0232-201ENST00000307659 7841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.8 ms