Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 WDR89-201ENST00000267522 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
ITGB3BPQ13352 SYTL2-217ENST00000528231 3536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
ITGB3BPQ13352 TRAV36DV7-201ENST00000390463 356 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
ITGB3BPQ13352 TTTY21B-201ENST00000421353 307 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
ITGB3BPQ13352 MOBP-206ENST00000428261 561 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.03□□□□□ -1.6
ITGB3BPQ13352 TTTY21-201ENST00000430228 307 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
ITGB3BPQ13352 AC007422.1-201ENST00000433065 1008 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
ITGB3BPQ13352 MORF4L1P4-201ENST00000450245 976 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
ITGB3BPQ13352 AC012671.1-201ENST00000451912 203 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
ITGB3BPQ13352 EIF2S2P5-201ENST00000457635 968 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
ITGB3BPQ13352 AK5-208ENST00000478255 556 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
ITGB3BPQ13352 AC104126.1-201ENST00000504004 711 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
ITGB3BPQ13352 AC097103.1-201ENST00000512398 273 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
ITGB3BPQ13352 AC015795.1-201ENST00000513669 327 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
ITGB3BPQ13352 RNA5SP360-201ENST00000516555 118 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
ITGB3BPQ13352 AC022882.1-201ENST00000532142 501 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
ITGB3BPQ13352 AC016993.1-201ENST00000547033 1258 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
ITGB3BPQ13352 AC004801.3-201ENST00000547602 962 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
ITGB3BPQ13352 KPNA2P3-201ENST00000584190 848 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
ITGB3BPQ13352 AL157938.2-204ENST00000589667 826 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
ITGB3BPQ13352 PDZPH1P-202ENST00000602846 722 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
ITGB3BPQ13352 AC026979.4-201ENST00000606555 645 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
ITGB3BPQ13352 AC005962.2-201ENST00000611427 652 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
ITGB3BPQ13352 LRRC2-AS1-202ENST00000614743 633 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
ITGB3BPQ13352 MLECP1-201ENST00000615893 709 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
ITGB3BPQ13352 OR52H1-202ENST00000641796 1061 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
ITGB3BPQ13352 NCK1-204ENST00000469404 2403 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
ITGB3BPQ13352 MMP16-201ENST00000286614 11558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
ITGB3BPQ13352 PLCB1-210ENST00000612075 6576 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
ITGB3BPQ13352 PLS3-209ENST00000539310 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
ITGB3BPQ13352 ZRANB3-201ENST00000264159 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
ITGB3BPQ13352 INPP4B-215ENST00000509777 4334 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
ITGB3BPQ13352 CR382285.2-201ENST00000624662 1495 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
ITGB3BPQ13352 MAP2-202ENST00000360351 9711 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
ITGB3BPQ13352 C1orf112-202ENST00000359326 4002 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
ITGB3BPQ13352 RNU1-20P-201ENST00000363314 162 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
ITGB3BPQ13352 AL672167.2-201ENST00000377164 879 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
ITGB3BPQ13352 RNA5SP372-201ENST00000390836 115 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
ITGB3BPQ13352 AL590867.1-201ENST00000392385 1212 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
ITGB3BPQ13352 ARAFP1-201ENST00000422172 605 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
ITGB3BPQ13352 AC234779.1-201ENST00000425910 285 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
ITGB3BPQ13352 RPL21P91-201ENST00000429231 479 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
ITGB3BPQ13352 RPS29P17-201ENST00000430795 166 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
ITGB3BPQ13352 TAB3-AS2-201ENST00000445240 292 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
ITGB3BPQ13352 AL512380.1-202ENST00000447728 543 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
ITGB3BPQ13352 TPT1P12-201ENST00000448968 492 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
ITGB3BPQ13352 LINC01729-201ENST00000450640 358 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
ITGB3BPQ13352 RN7SL98P-201ENST00000462271 300 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
ITGB3BPQ13352 RN7SL810P-201ENST00000493031 276 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
ITGB3BPQ13352 AC083829.1-201ENST00000503756 657 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
ITGB3BPQ13352 AC008592.2-201ENST00000506070 571 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
ITGB3BPQ13352 AC093840.1-201ENST00000511599 336 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
ITGB3BPQ13352 AL359237.1-202ENST00000556168 487 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
ITGB3BPQ13352 MIR4697-201ENST00000582977 78 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
ITGB3BPQ13352 AC092316.1-201ENST00000598703 297 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
ITGB3BPQ13352 AC233280.2-201ENST00000603917 1070 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
ITGB3BPQ13352 AC006065.6-201ENST00000625201 545 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
ITGB3BPQ13352 TEX41-256ENST00000626411 368 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
ITGB3BPQ13352 OR2M2-202ENST00000641211 1229 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
ITGB3BPQ13352 OR2M2-203ENST00000641836 1151 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
ITGB3BPQ13352 ZNF445-201ENST00000396077 18299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
ITGB3BPQ13352 TTC3-204ENST00000399017 10363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
ITGB3BPQ13352 SPEF2-216ENST00000637569 7350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
ITGB3BPQ13352 DCN-201ENST00000052754 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
ITGB3BPQ13352 ANKRD30A-201ENST00000361713 4405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
ITGB3BPQ13352 UBR1-201ENST00000290650 7761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
ITGB3BPQ13352 PANK1-203ENST00000342512 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
ITGB3BPQ13352 PCDH11X-204ENST00000373088 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
ITGB3BPQ13352 AC090017.1-201ENST00000548612 1779 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
ITGB3BPQ13352 PREPL-205ENST00000409411 4725 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
ITGB3BPQ13352 PLCE1-202ENST00000371380 12024 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
ITGB3BPQ13352 CFAP47-203ENST00000378653 9943 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
ITGB3BPQ13352 CLCA1-201ENST00000234701 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
ITGB3BPQ13352 DTNA-203ENST00000315456 1706 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
ITGB3BPQ13352 CD96-203ENST00000438817 1565 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
ITGB3BPQ13352 AC017104.4-201ENST00000636283 1592 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
ITGB3BPQ13352 RNF133-201ENST00000340112 1445 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
ITGB3BPQ13352 OR5P1P-201ENST00000299512 925 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
ITGB3BPQ13352 OTUD6B-202ENST00000404789 1089 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
ITGB3BPQ13352 AL139039.2-201ENST00000407436 479 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
ITGB3BPQ13352 AL590999.1-204ENST00000430595 638 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
ITGB3BPQ13352 LINC02527-201ENST00000449069 762 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
ITGB3BPQ13352 NPM1P39-201ENST00000449818 867 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
ITGB3BPQ13352 LINC01150-201ENST00000455671 315 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
ITGB3BPQ13352 RPL7AP52-201ENST00000458096 790 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
ITGB3BPQ13352 RPS27AP17-201ENST00000463344 455 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
ITGB3BPQ13352 RPL5P16-201ENST00000471467 790 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
ITGB3BPQ13352 RN7SKP122-201ENST00000515923 296 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
ITGB3BPQ13352 AP002981.1-201ENST00000517692 975 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
ITGB3BPQ13352 AP002518.2-201ENST00000544925 393 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
ITGB3BPQ13352 AC110023.1-201ENST00000554318 457 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
ITGB3BPQ13352 NUDT7-203ENST00000563839 316 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
ITGB3BPQ13352 ATP5J2P6-201ENST00000565203 266 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
ITGB3BPQ13352 AC133552.5-201ENST00000604266 540 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
ITGB3BPQ13352 AP000569.1-201ENST00000607953 591 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
ITGB3BPQ13352 LINC01587-204ENST00000623565 873 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
ITGB3BPQ13352 PRUNE2-208ENST00000443509 12356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
ITGB3BPQ13352 SYNE2-203ENST00000357395 21555 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
ITGB3BPQ13352 CCNYL2-202ENST00000637719 3311 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
ITGB3BPQ13352 ADGRL3-202ENST00000504896 4816 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 133.5 ms