Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 Y_RNA.110-201ENST00000363220 99 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 TRPM3-206ENST00000377097 554 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 TRGV11-201ENST00000390340 463 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 CCL7-203ENST00000394630 687 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 LSM5-205ENST00000409952 687 ntTSL 4 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 LSM5-206ENST00000409987 504 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 BX510359.2-201ENST00000417920 305 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 AL606970.4-201ENST00000424343 455 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 RPL17P35-201ENST00000432217 549 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 AC092162.1-201ENST00000432828 434 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 NPM1P33-201ENST00000438918 872 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 H2AFZP6-201ENST00000444403 394 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 AC073264.2-201ENST00000448886 166 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 TPT1P13-201ENST00000449760 499 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 GYG1P1-201ENST00000460864 698 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 AL035454.1-201ENST00000470758 433 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 AC090543.1-201ENST00000492168 485 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 AC008897.1-201ENST00000494006 347 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 LINC02488-201ENST00000504287 652 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 EGFLAM-AS3-201ENST00000505267 549 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 LINC02236-201ENST00000508881 552 ntTSL 4 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 AC010245.1-201ENST00000511329 754 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 SETP12-201ENST00000514068 805 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 RNU6-889P-201ENST00000517189 103 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 AC138832.1-201ENST00000522871 556 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 AC090809.1-201ENST00000524132 570 ntTSL 4 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 SOX5P1-201ENST00000524155 1127 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 CASP1-206ENST00000526568 1061 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 AP001978.1-201ENST00000526851 834 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 HIGD1AP5-201ENST00000529959 259 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 CASP1-216ENST00000534497 825 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 AP006289.1-201ENST00000538089 277 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 GABARAPL1-212ENST00000543602 653 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 OR6C68-201ENST00000548615 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 AC133555.2-201ENST00000550213 292 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 AL161751.1-201ENST00000555636 1044 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 AC103876.1-201ENST00000568634 418 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 AC002091.1-201ENST00000578788 557 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 MIR4716-201ENST00000579628 84 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 MIMT1-201ENST00000597105 1050 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 AC104687.2-201ENST00000604442 342 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 AL121932.1-201ENST00000605542 214 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 MIR6780A-201ENST00000615089 68 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 AC023490.1-202ENST00000620909 820 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 CLCA3P-202ENST00000466454 3412 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 LINC00550-201ENST00000629293 3434 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 MED23-203ENST00000368058 4576 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 PSMA4-201ENST00000044462 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 ZCCHC7-202ENST00000336755 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 BCLAF1P2-201ENST00000624956 2609 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 MRE11-202ENST00000323977 2588 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 ATP13A4-203ENST00000392443 4016 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 MECOM-217ENST00000494292 3939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 RC3H1-201ENST00000258349 10988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 PCDH9-201ENST00000377861 28227 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 FCHO2-207ENST00000512348 2700 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 PPEF1-201ENST00000349874 2687 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 LINC01249-201ENST00000412134 2663 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 AC068446.1-201ENST00000556425 1549 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 ABCA13-204ENST00000435803 17184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 CLSPN-206ENST00000520551 4010 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 OR52B1P-201ENST00000316506 909 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 RNVU1-6-201ENST00000364688 164 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 ARV1-202ENST00000366658 1170 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 SAMD13-204ENST00000370671 724 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 MIR320B1-201ENST00000390209 79 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 RNA5SP345-201ENST00000410646 108 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 RNA5SP498-201ENST00000411342 120 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 AC003092.2-201ENST00000411946 446 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 OR2B7P-201ENST00000429302 934 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 AC012497.1-201ENST00000429392 575 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 AP000949.1-201ENST00000438328 629 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 AF064858.2-201ENST00000440714 292 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 RPL5P13-201ENST00000462840 709 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 RPS27AP16-201ENST00000492222 470 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 MRPS33-209ENST00000496958 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 SNORD116-26-201ENST00000516006 96 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 AC064807.2-201ENST00000521188 672 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 BUD31P1-201ENST00000521828 359 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 C11orf74-210ENST00000534635 801 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 AL445363.2-202ENST00000555361 435 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 AL049839.1-201ENST00000556151 657 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 AC090515.3-201ENST00000560431 315 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 AC116553.2-201ENST00000564203 463 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 AC009139.2-201ENST00000569032 566 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 TMF1P1-201ENST00000576058 373 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 AC011507.1-201ENST00000585364 567 ntTSL 4 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 AC022726.1-201ENST00000587475 207 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 TTN-AS1-237ENST00000590743 812 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 RPL27-207ENST00000590864 569 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 LINC00458-206ENST00000607494 849 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 AL512506.1-201ENST00000613918 449 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 MIR6853-201ENST00000619642 74 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 AP003497.2-201ENST00000624220 967 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 AC020978.9-201ENST00000624380 1141 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 AC106730.3-201ENST00000624568 641 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 AC004160.1-201ENST00000625468 929 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 AP002512.4-201ENST00000641310 4672 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 RBMX-203ENST00000431446 2004 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 ZZZ3-202ENST00000370801 4328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
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