Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 SETSIP-202ENST00000596516 909 ntAPPRIS P2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 VN1R81P-201ENST00000602085 372 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 LLPHP1-201ENST00000603571 367 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 AC007308.1-201ENST00000608856 373 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 DARS-AS1-227ENST00000627442 633 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 PDE6A-205ENST00000617647 4039 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 GPX8-201ENST00000296734 3245 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 ODF2-205ENST00000393527 3653 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 VNN3-203ENST00000392393 1603 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 WBP11P1-201ENST00000562560 1931 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 ADAM21-201ENST00000603540 2658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 CCDC18-AS1-205ENST00000421202 2973 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 MAPK10-261ENST00000641050 3109 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 CNTN5-204ENST00000524871 6258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 DSC1-202ENST00000257198 4225 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 FGF1-216ENST00000621536 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 MFSD8-219ENST00000641228 2559 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 FASTKD3-201ENST00000264669 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 AC005224.3-201ENST00000584683 2140 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 CPB2-202ENST00000439329 1655 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 ARMCX5-202ENST00000372742 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 ZNF644-204ENST00000370440 5702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 AL662795.2-201ENST00000624252 3706 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 CLUL1-205ENST00000579494 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 FBXL17-203ENST00000496714 3773 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 OR2G6-202ENST00000641501 5840 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 CRYZ-204ENST00000370872 1592 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 CLCN3-211ENST00000613795 5874 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 OR4C11-201ENST00000302231 1045 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 RNU6-931P-201ENST00000363850 107 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 Y_RNA.326-201ENST00000365176 113 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 RNA5SP30-201ENST00000365552 115 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 OR14A2-201ENST00000366485 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 Y_RNA.450-201ENST00000384198 113 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 AC003985.1-201ENST00000414127 362 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 LINC01853-201ENST00000417715 444 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 AL445989.1-202ENST00000418943 776 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 FNDC1-IT1-201ENST00000419703 516 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 OR5W1P-201ENST00000423705 938 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 AP001476.3-201ENST00000429512 415 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 AC012075.1-201ENST00000436549 580 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 AL139289.1-201ENST00000436713 731 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 VN1R10P-201ENST00000447106 875 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 AC073072.2-201ENST00000447425 348 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 LRRC69-202ENST00000448384 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 AL450023.1-201ENST00000450868 751 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 LINC01825-201ENST00000452381 850 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 DNAJC19P1-201ENST00000455312 319 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 AL445687.2-201ENST00000458156 728 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 RN7SL184P-201ENST00000488308 297 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 RN7SL629P-201ENST00000489622 285 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 AC104971.1-201ENST00000495117 578 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 EIF3LP3-201ENST00000495197 822 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 AC108062.1-201ENST00000505133 637 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 AK4P6-201ENST00000505168 528 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 LINC02236-201ENST00000508881 552 ntTSL 4 BASIC7.22□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 TOMM22P4-201ENST00000511318 336 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 AC079209.2-201ENST00000519107 431 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 AC084116.2-201ENST00000520171 415 ntTSL 4 BASIC7.22□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 POLR2K-203ENST00000522439 543 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 MTCO3P15-201ENST00000526563 574 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 AC022690.1-201ENST00000526681 550 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 AC125612.1-201ENST00000547580 377 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 AC007342.4-202ENST00000565189 721 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 AC015720.2-201ENST00000567709 334 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 ZNF667-AS1-207ENST00000592146 668 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 OR7A8P-201ENST00000595427 913 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 AL390816.3-201ENST00000604527 1066 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 AL008635.1-201ENST00000609073 385 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 AC015574.1-205ENST00000611285 524 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 ATXN3-251ENST00000617719 1074 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 AC025048.6-202ENST00000627667 438 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 AC090673.1-202ENST00000356215 4617 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 AMOT-203ENST00000371959 7319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 IGF2BP3-218ENST00000619562 2126 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 ADGRE1-202ENST00000312053 3128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 CPS1-IT1-201ENST00000628368 2306 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 GOLGA6L22-204ENST00000622895 4178 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 ATXN7-208ENST00000484332 2741 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 LINC01043-201ENST00000565936 6897 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 TLR6-201ENST00000381950 2938 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 ST6GAL1-211ENST00000448044 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 PGM3-215ENST00000616566 5905 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 WNK3-203ENST00000375169 11172 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 ASAH2-203ENST00000443575 1942 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 NLRP13-202ENST00000588751 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 PUM2-201ENST00000319801 6002 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 GABPB1-204ENST00000396464 1401 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 LMO3-235ENST00000616247 3227 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 SERPINB7-207ENST00000546027 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 AGBL4-201ENST00000334103 881 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 Y_RNA.263-201ENST00000364659 114 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 RNU4-91P-201ENST00000364778 135 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 Y_RNA.453-201ENST00000384223 109 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 BTBD9-203ENST00000403056 1155 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 MIR1178-201ENST00000408396 91 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 AL589986.2-201ENST00000429352 397 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 AL391097.2-201ENST00000435057 485 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 AL390119.1-201ENST00000440329 312 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 AC131571.1-202ENST00000454509 598 ntTSL 4 BASIC7.21□□□□□ -1.26
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