Protein–RNA interactions for Protein: Q13214

SEMA3B, Semaphorin-3B, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3BQ13214 AF127577.2-201ENST00000436429 824 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
SEMA3BQ13214 AL590867.3-201ENST00000436953 438 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
SEMA3BQ13214 AC016292.1-201ENST00000438344 235 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
SEMA3BQ13214 BMS1P22-202ENST00000440946 1160 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
SEMA3BQ13214 LINC00366-201ENST00000441430 435 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
SEMA3BQ13214 RPL7AP61-201ENST00000443410 636 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SEMA3BQ13214 AC064871.1-201ENST00000444562 427 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
SEMA3BQ13214 TPTE2P6-203ENST00000450973 649 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
SEMA3BQ13214 AC011287.2-201ENST00000456809 842 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
SEMA3BQ13214 ARHGEF3-AS1-201ENST00000477246 489 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
SEMA3BQ13214 AC073023.1-201ENST00000522896 773 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
SEMA3BQ13214 NDUFS5P6-201ENST00000529136 295 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SEMA3BQ13214 DUXAP5-201ENST00000529668 529 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SEMA3BQ13214 LINS1-207ENST00000560133 1196 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
SEMA3BQ13214 AC007922.3-201ENST00000581648 543 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
SEMA3BQ13214 AC087283.1-201ENST00000604029 1074 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SEMA3BQ13214 FRG1HP-204ENST00000617940 757 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SEMA3BQ13214 AC011330.2-201ENST00000621680 635 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SEMA3BQ13214 POLK-210ENST00000508526 2019 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
SEMA3BQ13214 ZEB2-241ENST00000637304 9158 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
SEMA3BQ13214 AL360270.2-201ENST00000562952 5985 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SEMA3BQ13214 USP8-201ENST00000307179 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
SEMA3BQ13214 ALG6-201ENST00000263440 1895 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
SEMA3BQ13214 LINC01923-203ENST00000456248 2528 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 R3HCC1L-202ENST00000314594 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 KTN1-223ENST00000555573 1712 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 BX088651.2-201ENST00000425493 3614 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 PTPRD-213ENST00000537002 8224 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 RAB18-209ENST00000621805 4894 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 AC110079.2-201ENST00000629462 1512 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 CPXCR1-203ENST00000614120 1485 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 STAG2-203ENST00000371145 4393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 GBA3-205ENST00000511446 2018 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 AL354733.2-209ENST00000589233 1434 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 KIF2A-203ENST00000407818 2315 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 OR14C36-201ENST00000317861 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 UBE2Q2P1-202ENST00000354771 883 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 DSCR8-201ENST00000357704 552 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 MT-ND2-201ENST00000361453 1042 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 RNA5SP123-201ENST00000363244 119 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 TAS2R15P-201ENST00000390674 928 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 RPL23AP59-201ENST00000399415 461 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 DSCR8-202ENST00000400477 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 HMGB3P18-201ENST00000406327 590 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 RN7SKP16-201ENST00000410180 299 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 AC211486.3-201ENST00000412694 621 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 AC013472.2-201ENST00000416226 306 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 MTND4P3-201ENST00000417829 541 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 AL390036.1-201ENST00000419428 734 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 AL390774.2-201ENST00000423942 788 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 AC068481.1-202ENST00000428379 555 ntTSL 4 BASIC5.33□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 AC091390.1-201ENST00000433904 331 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 LINC02532-206ENST00000433965 570 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 AC076966.1-201ENST00000435560 351 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 AL355306.2-209ENST00000437803 357 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 PTGES3P1-201ENST00000439531 483 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 MTOR-AS1-202ENST00000445982 705 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 Z73417.1-201ENST00000447373 778 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 AL356289.2-201ENST00000455238 292 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 LINC00601-201ENST00000456514 1168 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 AC009127.1-201ENST00000467090 155 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 AC138965.1-202ENST00000502354 547 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 AC010273.1-201ENST00000504129 946 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 AC140125.3-201ENST00000505248 547 ntTSL 4 BASIC5.33□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 FTH1P11-201ENST00000517577 551 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 AC104417.1-201ENST00000523974 751 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 LRRC6P1-201ENST00000532188 885 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 LINC02408-202ENST00000538573 559 ntTSL 4 BASIC5.33□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 AC006518.2-201ENST00000542513 940 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 AL133304.2-201ENST00000546376 886 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 NR1H4-204ENST00000546380 565 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 AC063949.1-201ENST00000552900 865 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 AC009554.1-201ENST00000559251 399 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 AC022929.1-201ENST00000560675 823 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 AC018552.1-201ENST00000562099 811 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 C15orf65-201ENST00000569691 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 MIR4433B-201ENST00000581329 102 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 SS18L2P2-201ENST00000583960 235 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 AC025811.1-201ENST00000604312 472 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 AL024498.1-201ENST00000606522 1100 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 AC011472.4-201ENST00000615848 491 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 Z99129.2-201ENST00000619967 314 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 AC017104.5-201ENST00000637647 639 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 PRUNE2-201ENST00000223609 2697 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 STAU2-220ENST00000522695 2646 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 MTERF1-202ENST00000406735 1639 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 NRDE2-201ENST00000354366 14208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 CREM-202ENST00000342105 1541 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 EXTL2-201ENST00000370113 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 MIPOL1-204ENST00000539062 2389 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 RALGAPA1P1-201ENST00000443361 6232 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 LINC01206-204ENST00000482787 9580 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 POU1F1-202ENST00000350375 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 IBTK-206ENST00000503631 3560 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 ITCH-201ENST00000262650 3089 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 AC099786.3-201ENST00000565735 1410 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 DAZ4-207ENST00000634662 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 GAS2L3-203ENST00000539410 2229 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 ZNF410-211ENST00000555044 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 WDR63-201ENST00000294664 2995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 136.6 ms