Protein–RNA interactions for Protein: P59942

MCCD1, Mitochondrial coiled-coil domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCD1P59942 ACSL4-204ENST00000469796 5225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
MCCD1P59942 IBTK-201ENST00000306270 6054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
MCCD1P59942 BRCA1-210ENST00000471181 5936 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
MCCD1P59942 ATF2-221ENST00000538946 1325 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
MCCD1P59942 AC025809.2-201ENST00000625085 1802 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
MCCD1P59942 UTP6-201ENST00000261708 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
MCCD1P59942 AC092111.1-201ENST00000618256 3358 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
MCCD1P59942 FCHSD2-208ENST00000458644 2215 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.25
MCCD1P59942 MTND4P27-201ENST00000450813 1354 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
MCCD1P59942 AC011346.1-201ENST00000638059 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
MCCD1P59942 AC127070.3-201ENST00000503695 3263 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
MCCD1P59942 GABRR1-206ENST00000611484 3259 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
MCCD1P59942 NXF2B-203ENST00000604395 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
MCCD1P59942 NXF2-201ENST00000604790 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
MCCD1P59942 AP002001.1-201ENST00000526101 1759 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
MCCD1P59942 CYP2C8-210ENST00000535898 1799 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.25
MCCD1P59942 PRLR-216ENST00000542609 1764 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
MCCD1P59942 ATP1A1-203ENST00000369496 3572 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
MCCD1P59942 PSD3-220ENST00000615573 5843 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
MCCD1P59942 RPS29-201ENST00000245458 296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
MCCD1P59942 LACRT-201ENST00000257867 551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
MCCD1P59942 NAP1L4P1-201ENST00000319092 1157 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
MCCD1P59942 SNORA51.2-201ENST00000364595 132 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
MCCD1P59942 RNU6-317P-201ENST00000384031 107 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
MCCD1P59942 RNU6-456P-201ENST00000384493 107 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
MCCD1P59942 SNORD115.1-201ENST00000391109 76 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
MCCD1P59942 MRPL42P2-201ENST00000403169 426 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
MCCD1P59942 AL353133.1-201ENST00000407695 401 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
MCCD1P59942 RPL12P9-201ENST00000412942 488 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
MCCD1P59942 MRPL50P2-201ENST00000416821 482 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
MCCD1P59942 AC013429.2-201ENST00000418798 781 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
MCCD1P59942 AL135785.1-201ENST00000422554 399 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
MCCD1P59942 TEX41-204ENST00000423031 491 ntTSL 4 BASIC7.21□□□□□ -1.26
MCCD1P59942 SAR1AP4-201ENST00000429225 591 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
MCCD1P59942 BNIP3P2-201ENST00000441221 577 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
MCCD1P59942 CBWD4P-201ENST00000445695 655 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
MCCD1P59942 PFN1P11-201ENST00000445829 389 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
MCCD1P59942 UBBP5-201ENST00000446970 266 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
MCCD1P59942 RPL7P19-201ENST00000469948 618 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
MCCD1P59942 SCG5-207ENST00000497208 949 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
MCCD1P59942 AC099520.1-202ENST00000503650 777 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
MCCD1P59942 AC114967.1-201ENST00000504890 259 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
MCCD1P59942 AC063979.2-201ENST00000513767 958 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
MCCD1P59942 RNU7-30P-201ENST00000516835 62 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
MCCD1P59942 AP001831.1-201ENST00000524610 411 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
MCCD1P59942 AP000842.2-202ENST00000526211 569 ntTSL 4 BASIC7.21□□□□□ -1.26
MCCD1P59942 AC134775.1-201ENST00000531268 464 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
MCCD1P59942 GNG2-203ENST00000553432 577 ntTSL 4 BASIC7.21□□□□□ -1.26
MCCD1P59942 AC026956.1-201ENST00000558741 396 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
MCCD1P59942 AC087721.1-201ENST00000559959 476 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
MCCD1P59942 AC122134.1-201ENST00000565664 1104 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
MCCD1P59942 AC006305.2-201ENST00000589617 552 ntTSL 4 BASIC7.21□□□□□ -1.26
MCCD1P59942 MIR6849-201ENST00000618543 69 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
MCCD1P59942 AL603758.1-201ENST00000618654 241 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
MCCD1P59942 PTP4A2-219ENST00000626355 606 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
MCCD1P59942 PTP4A2-220ENST00000627328 615 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
MCCD1P59942 LINC00850-201ENST00000629221 685 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
MCCD1P59942 AL450990.1-201ENST00000632868 582 ntTSL 4 BASIC7.21□□□□□ -1.26
MCCD1P59942 AC099654.6-201ENST00000636487 512 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
MCCD1P59942 AC013488.1-201ENST00000526618 1838 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
MCCD1P59942 ERLIN2-201ENST00000276461 6073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
MCCD1P59942 BEST3-202ENST00000330891 3532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
MCCD1P59942 GABRA3-204ENST00000535043 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
MCCD1P59942 SYTL5-202ENST00000456733 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
MCCD1P59942 SAMMSON-210ENST00000641260 1308 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
MCCD1P59942 TRIM34-204ENST00000514226 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
MCCD1P59942 FGFR2-213ENST00000369061 3803 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
MCCD1P59942 PAK3-213ENST00000620137 2130 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
MCCD1P59942 LINC00622-201ENST00000562811 1570 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
MCCD1P59942 COLCA1-205ENST00000620864 8098 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
MCCD1P59942 SCOC-204ENST00000394205 1964 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
MCCD1P59942 CKAP2P1-201ENST00000555477 2049 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
MCCD1P59942 MTND5P3-201ENST00000438536 1800 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
MCCD1P59942 ATOX1-203ENST00000521264 4341 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
MCCD1P59942 B4GALT4-207ENST00000467604 5794 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
MCCD1P59942 ZNF253-201ENST00000355650 2268 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
MCCD1P59942 AC091045.1-201ENST00000561460 2277 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
MCCD1P59942 AC011455.2-201ENST00000599320 3336 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
MCCD1P59942 PSG5-210ENST00000599812 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
MCCD1P59942 OR9K1P-201ENST00000326513 941 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
MCCD1P59942 RNU1-5P-201ENST00000362684 144 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
MCCD1P59942 MRPS6P2-201ENST00000381143 370 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
MCCD1P59942 RNU1-149P-201ENST00000390870 161 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
MCCD1P59942 VNN3-205ENST00000417437 1117 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
MCCD1P59942 AL159174.1-202ENST00000425588 442 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
MCCD1P59942 AL451042.1-201ENST00000426353 544 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
MCCD1P59942 LINC00575-201ENST00000426551 910 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
MCCD1P59942 DIAPH3-AS2-201ENST00000428656 367 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
MCCD1P59942 AC016766.1-201ENST00000429636 714 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
MCCD1P59942 RPL3P11-201ENST00000434028 1146 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
MCCD1P59942 ATP6V1G1P4-201ENST00000438388 335 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
MCCD1P59942 LRTOMT-209ENST00000440313 253 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
MCCD1P59942 AC010157.1-201ENST00000440589 527 ntTSL 4 BASIC7.2□□□□□ -1.26
MCCD1P59942 GAPDHP33-201ENST00000443168 1013 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
MCCD1P59942 AC022498.1-201ENST00000449845 696 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
MCCD1P59942 AC006480.1-201ENST00000449887 378 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
MCCD1P59942 AL157896.1-201ENST00000451617 790 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
MCCD1P59942 AC096543.1-201ENST00000455038 823 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
MCCD1P59942 RPL12P31-201ENST00000478433 450 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
MCCD1P59942 HYDIN2-201ENST00000493714 554 ntTSL 4 BASIC7.2□□□□□ -1.26
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