Protein–RNA interactions for Protein: P10586

PTPRF, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, humanhuman

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Length 1,907 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRFP10586 XPNPEP3-201ENST00000357137 7988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
PTPRFP10586 PLCH1-201ENST00000334686 6128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
PTPRFP10586 CLCN3-204ENST00000504131 5592 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
PTPRFP10586 GABRA2-205ENST00000507069 1562 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
PTPRFP10586 AC019072.1-201ENST00000604535 1551 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
PTPRFP10586 NDUFA5-207ENST00000471770 5608 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
PTPRFP10586 PLCH1-202ENST00000340059 6168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
PTPRFP10586 GCSAML-202ENST00000366489 4030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.61
PTPRFP10586 OSGEPL1-201ENST00000264151 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
PTPRFP10586 NABP1-205ENST00000425611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
PTPRFP10586 PSMD1-213ENST00000619128 3161 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.61
PTPRFP10586 NOX4-205ENST00000424319 4184 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPRFP10586 CYP3A43-201ENST00000222382 1515 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPRFP10586 AL607077.1-201ENST00000401718 499 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPRFP10586 HMGB3P5-201ENST00000428894 612 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPRFP10586 ADGRL3-AS1-203ENST00000506704 606 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPRFP10586 AL355073.1-201ENST00000560296 517 ntTSL 4 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPRFP10586 IMMP1LP1-201ENST00000605170 488 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPRFP10586 AC025175.1-201ENST00000606482 759 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPRFP10586 PRRC2C-202ENST00000367742 10366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPRFP10586 ATP2C1-212ENST00000507488 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPRFP10586 HACD3-211ENST00000569894 1471 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPRFP10586 ZBTB21-201ENST00000310826 7449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPRFP10586 ERGIC2-212ENST00000611644 4961 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPRFP10586 GCSAML-203ENST00000366491 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPRFP10586 MUC12-206ENST00000536621 16321 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPRFP10586 RLIMP1-201ENST00000339626 1680 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPRFP10586 SLC9C1-201ENST00000305815 4172 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPRFP10586 PTPRO-203ENST00000442921 3030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPRFP10586 AC006946.1-201ENST00000429106 328 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPRFP10586 CDY14P-201ENST00000431260 1014 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPRFP10586 CDY12P-201ENST00000440679 1015 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPRFP10586 CDY13P-201ENST00000445813 1015 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPRFP10586 CDY23P-201ENST00000451661 1014 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPRFP10586 ZCCHC10-206ENST00000509008 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPRFP10586 RNA5SP249-201ENST00000516127 99 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPRFP10586 AC007991.1-201ENST00000522680 631 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPRFP10586 AP001157.1-201ENST00000550837 2339 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPRFP10586 AC076968.1-201ENST00000566418 429 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPRFP10586 AC120057.2-201ENST00000571520 271 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPRFP10586 AL022238.2-202ENST00000607915 658 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPRFP10586 NRDE2-201ENST00000354366 14208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPRFP10586 WDR12-201ENST00000261015 8100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPRFP10586 VEZT-201ENST00000261219 3435 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPRFP10586 LMNTD1-202ENST00000413632 1520 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPRFP10586 ADAM29-201ENST00000359240 3325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPRFP10586 ZNF383-201ENST00000352998 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPRFP10586 UTS2B-201ENST00000340524 2395 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPRFP10586 SYTL2-213ENST00000525702 2727 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPRFP10586 OR11H4-201ENST00000315409 1082 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPRFP10586 GCSAML-201ENST00000366488 3820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPRFP10586 GEN1-202ENST00000381254 6367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPRFP10586 MFAP5-202ENST00000396549 1195 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPRFP10586 RN7SKP182-201ENST00000410772 298 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPRFP10586 AC108032.1-201ENST00000416706 207 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPRFP10586 AL445584.1-201ENST00000431451 330 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPRFP10586 NMNAT1P2-201ENST00000435192 860 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPRFP10586 RPL23AP46-201ENST00000438548 490 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPRFP10586 GTF3AP5-201ENST00000442645 697 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPRFP10586 LINC00189-203ENST00000447125 783 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPRFP10586 AL031963.1-201ENST00000447644 695 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPRFP10586 AC025470.2-201ENST00000506106 897 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPRFP10586 HMGB3P16-201ENST00000508037 287 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPRFP10586 PLAC8-205ENST00000509973 489 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPRFP10586 OR7E10P-201ENST00000526420 991 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPRFP10586 AP005271.1-201ENST00000582470 412 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPRFP10586 AC005520.3-201ENST00000602874 370 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPRFP10586 AP000569.1-201ENST00000607953 591 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPRFP10586 MILR1-203ENST00000615220 1196 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPRFP10586 RPS4Y2-201ENST00000629237 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPRFP10586 OR11H4-203ENST00000641525 1082 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPRFP10586 NUP155-202ENST00000381843 4200 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPRFP10586 EIF3EP2-201ENST00000423042 1814 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPRFP10586 ZNF12-203ENST00000404360 4474 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPRFP10586 SCN1A-203ENST00000409050 5946 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPRFP10586 CDKL5-205ENST00000623535 12533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPRFP10586 LYST-202ENST00000389794 12985 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPRFP10586 LMOD2-202ENST00000458573 2346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPRFP10586 MGC32805-205ENST00000510972 1424 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPRFP10586 EED-206ENST00000527888 1422 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPRFP10586 CSPP1-203ENST00000519668 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPRFP10586 AP000357.1-201ENST00000409926 1165 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPRFP10586 AC115285.1-201ENST00000424879 736 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPRFP10586 PCBP1-AS1-224ENST00000429599 1045 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPRFP10586 AC011897.1-201ENST00000450715 346 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPRFP10586 AL590652.1-201ENST00000453790 850 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPRFP10586 RPL23AP2-201ENST00000471227 466 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPRFP10586 AC131254.2-201ENST00000521908 550 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPRFP10586 LINC01028-202ENST00000588782 458 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPRFP10586 ADGRG2-203ENST00000356606 4630 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPRFP10586 FOXP2-220ENST00000634411 4065 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPRFP10586 DMD-228ENST00000541735 7080 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPRFP10586 TRGC1-201ENST00000443402 2730 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPRFP10586 NADK2-203ENST00000397338 3614 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPRFP10586 TIPARP-205ENST00000486483 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPRFP10586 TMEM71-210ENST00000523829 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPRFP10586 PTPN22-201ENST00000359785 3654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPRFP10586 RWDD2B-207ENST00000493196 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPRFP10586 AC092821.1-204ENST00000518709 3552 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPRFP10586 VWC2L-202ENST00000427124 4480 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
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