Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 ARPP21-202ENST00000396481 1304 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
NEDD8-MDP1E9PL57 GCSAML-206ENST00000527084 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
NEDD8-MDP1E9PL57 PCDH11X-207ENST00000406881 4156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
NEDD8-MDP1E9PL57 FMN1-202ENST00000334528 12355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
NEDD8-MDP1E9PL57 PTPRD-203ENST00000381196 9911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
NEDD8-MDP1E9PL57 AC008549.2-201ENST00000333482 706 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
NEDD8-MDP1E9PL57 CARD16-202ENST00000375706 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
NEDD8-MDP1E9PL57 AL049693.1-201ENST00000402760 611 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
NEDD8-MDP1E9PL57 AL359643.1-201ENST00000404109 423 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
NEDD8-MDP1E9PL57 RPL31-205ENST00000409320 716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
NEDD8-MDP1E9PL57 RN7SKP247-201ENST00000411094 308 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
NEDD8-MDP1E9PL57 AL592293.2-201ENST00000422292 996 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
NEDD8-MDP1E9PL57 RPL7AP25-201ENST00000423357 805 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
NEDD8-MDP1E9PL57 CHIAP3-201ENST00000423668 1133 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
NEDD8-MDP1E9PL57 EIF4HP2-201ENST00000424380 563 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
NEDD8-MDP1E9PL57 AL139824.1-201ENST00000431983 453 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
NEDD8-MDP1E9PL57 AC092447.2-201ENST00000435487 669 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
NEDD8-MDP1E9PL57 AL138787.1-202ENST00000437804 898 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
NEDD8-MDP1E9PL57 AP000943.1-201ENST00000438416 712 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
NEDD8-MDP1E9PL57 AC239798.3-201ENST00000454459 408 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
NEDD8-MDP1E9PL57 MTND6P32-201ENST00000457611 483 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
NEDD8-MDP1E9PL57 SCARNA10-201ENST00000459255 330 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
NEDD8-MDP1E9PL57 AC089999.1-201ENST00000460336 374 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
NEDD8-MDP1E9PL57 RPL7AP10-201ENST00000481016 791 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
NEDD8-MDP1E9PL57 SOX2-OT-216ENST00000497122 578 ntTSL 4 BASIC4.73□□□□□ -1.65
NEDD8-MDP1E9PL57 GLRX-206ENST00000508780 533 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.73□□□□□ -1.65
NEDD8-MDP1E9PL57 IGLVIV-65-201ENST00000517313 360 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
NEDD8-MDP1E9PL57 AC079035.1-201ENST00000551713 848 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
NEDD8-MDP1E9PL57 AC012414.2-201ENST00000559474 187 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
NEDD8-MDP1E9PL57 AC098850.3-201ENST00000577569 771 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
NEDD8-MDP1E9PL57 CCDC178-208ENST00000579916 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
NEDD8-MDP1E9PL57 AC015802.3-201ENST00000590241 570 ntTSL 4 BASIC4.73□□□□□ -1.65
NEDD8-MDP1E9PL57 AC005191.1-201ENST00000603950 358 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
NEDD8-MDP1E9PL57 CASP1-217ENST00000640184 327 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
NEDD8-MDP1E9PL57 AC010300.1-201ENST00000600671 5134 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
NEDD8-MDP1E9PL57 BBX-204ENST00000406780 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
NEDD8-MDP1E9PL57 TIPARP-207ENST00000542783 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
NEDD8-MDP1E9PL57 MAPK10-349ENST00000641767 3661 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM204A-203ENST00000369183 13889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
NEDD8-MDP1E9PL57 CSNK1G3-210ENST00000521364 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
NEDD8-MDP1E9PL57 RBMS1-203ENST00000409075 1550 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
NEDD8-MDP1E9PL57 AC007491.1-202ENST00000637961 1576 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
NEDD8-MDP1E9PL57 OR5A1-202ENST00000641045 8612 ntAPPRIS P1 BASIC4.73□□□□□ -1.65
NEDD8-MDP1E9PL57 ELF2-203ENST00000379550 3278 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
NEDD8-MDP1E9PL57 AC025031.4-201ENST00000621248 3271 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
NEDD8-MDP1E9PL57 AL031119.1-201ENST00000404707 1879 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
NEDD8-MDP1E9PL57 UGT2B17-201ENST00000317746 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
NEDD8-MDP1E9PL57 AL356317.1-201ENST00000396110 1436 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF285-204ENST00000591679 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC4.72□□□□□ -1.65
NEDD8-MDP1E9PL57 ACE2-202ENST00000427411 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
NEDD8-MDP1E9PL57 ANXA1-202ENST00000376911 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
NEDD8-MDP1E9PL57 MYB-239ENST00000534121 2238 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
NEDD8-MDP1E9PL57 PCDH9-203ENST00000456367 5072 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
NEDD8-MDP1E9PL57 RC3H1-201ENST00000258349 10988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
NEDD8-MDP1E9PL57 CRYZ-203ENST00000370871 1292 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR659-201ENST00000384963 97 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
NEDD8-MDP1E9PL57 CDKN3-203ENST00000395577 637 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
NEDD8-MDP1E9PL57 VDAC2P1-201ENST00000399358 958 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
NEDD8-MDP1E9PL57 AMZ2P2-201ENST00000406819 1057 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
NEDD8-MDP1E9PL57 RNU4-25P-201ENST00000410569 230 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
NEDD8-MDP1E9PL57 AC003975.1-201ENST00000411856 837 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
NEDD8-MDP1E9PL57 AL158166.2-201ENST00000420845 748 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
NEDD8-MDP1E9PL57 AC106901.1-201ENST00000425086 698 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
NEDD8-MDP1E9PL57 RPS12P10-201ENST00000427031 377 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
NEDD8-MDP1E9PL57 AL139327.2-202ENST00000437057 400 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
NEDD8-MDP1E9PL57 AL035706.1-201ENST00000439186 683 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
NEDD8-MDP1E9PL57 RPL23AP93-201ENST00000440847 484 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
NEDD8-MDP1E9PL57 AL512380.1-202ENST00000447728 543 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
NEDD8-MDP1E9PL57 RPL10P17-201ENST00000453852 316 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
NEDD8-MDP1E9PL57 AC005304.1-201ENST00000457609 405 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
NEDD8-MDP1E9PL57 CREM-220ENST00000463314 964 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
NEDD8-MDP1E9PL57 AC083829.1-201ENST00000503756 657 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
NEDD8-MDP1E9PL57 AC012055.1-201ENST00000511346 1144 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
NEDD8-MDP1E9PL57 AC015795.1-201ENST00000513669 327 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
NEDD8-MDP1E9PL57 RNU6-319P-201ENST00000516025 108 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
NEDD8-MDP1E9PL57 IGKV2D-10-201ENST00000520194 281 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
NEDD8-MDP1E9PL57 AC087272.1-201ENST00000523624 533 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
NEDD8-MDP1E9PL57 AP001001.1-202ENST00000527594 692 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
NEDD8-MDP1E9PL57 AC068389.4-201ENST00000531379 689 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
NEDD8-MDP1E9PL57 AP001804.2-201ENST00000533932 910 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
NEDD8-MDP1E9PL57 NRG3-205ENST00000537893 1174 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
NEDD8-MDP1E9PL57 AC103739.1-201ENST00000558389 474 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
NEDD8-MDP1E9PL57 AC084759.1-201ENST00000561168 290 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
NEDD8-MDP1E9PL57 AC020661.4-201ENST00000561388 500 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
NEDD8-MDP1E9PL57 AC115286.1-201ENST00000604298 434 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC02340-201ENST00000610335 626 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
NEDD8-MDP1E9PL57 AC012409.3-201ENST00000611343 981 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
NEDD8-MDP1E9PL57 AC104307.1-201ENST00000616142 196 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
NEDD8-MDP1E9PL57 FP236315.3-201ENST00000623587 307 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
NEDD8-MDP1E9PL57 NRXN1-223ENST00000625891 1164 ntTSL 4 BASIC4.72□□□□□ -1.65
NEDD8-MDP1E9PL57 RXFP1-204ENST00000423548 3930 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
NEDD8-MDP1E9PL57 PARP11-201ENST00000228820 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
NEDD8-MDP1E9PL57 CENPE-208ENST00000611174 8260 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
NEDD8-MDP1E9PL57 CD69-201ENST00000228434 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC5A12-202ENST00000396005 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
NEDD8-MDP1E9PL57 KLHL4-202ENST00000373119 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
NEDD8-MDP1E9PL57 CCDC91-201ENST00000381259 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
NEDD8-MDP1E9PL57 AADAT-202ENST00000353187 2101 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
NEDD8-MDP1E9PL57 ALS2CR12-202ENST00000392257 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
NEDD8-MDP1E9PL57 UGT2B26P-201ENST00000508672 1613 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.3 ms