Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 ABHD15-AS1-201ENST00000581474 187 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 AC025175.1-201ENST00000606482 759 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 LGALS13-204ENST00000621475 494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 AC034229.5-201ENST00000624258 185 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 AL356094.1-201ENST00000624663 1212 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 NCK1-204ENST00000469404 2403 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 ANKRD34C-201ENST00000421388 4951 ntAPPRIS P1 BASIC5.71□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 OR6C3-202ENST00000641364 1341 ntAPPRIS P1 BASIC5.71□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 PEX2-201ENST00000357039 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 SLC35A5-206ENST00000492406 4399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 RNMT-209ENST00000592764 4108 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 RNU1-85P-201ENST00000364127 164 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 WFDC6-202ENST00000372670 620 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 AL050305.1-201ENST00000399993 1230 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 AC013410.2-201ENST00000422627 201 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 AC073310.1-201ENST00000423226 1033 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 MOBP-206ENST00000428261 561 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 AC007422.1-201ENST00000433065 1008 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 AL132765.1-201ENST00000434165 553 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 AL136099.1-201ENST00000436492 557 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 UBE2V1P3-201ENST00000439651 417 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 LINC01150-201ENST00000455671 315 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 AC073486.1-202ENST00000458437 489 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 RN7SL812P-201ENST00000493791 279 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 AC010451.2-201ENST00000511514 545 ntTSL 4 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 SETP12-201ENST00000514068 805 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 AC098869.2-201ENST00000514187 862 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 HMGB1P23-201ENST00000518743 568 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 AC006065.3-201ENST00000541769 419 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 NELL2-211ENST00000548826 559 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 LINC02290-201ENST00000554187 608 ntTSL 4 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 AL158211.1-201ENST00000566763 763 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 AC022916.2-201ENST00000590144 559 ntTSL 4 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 AC011477.2-201ENST00000590697 921 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 AC008277.1-203ENST00000594921 1149 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 AL161729.3-201ENST00000603533 673 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 PDCD6IPP1-202ENST00000622242 1064 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 AC112484.5-201ENST00000624189 228 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 AC004777.1-201ENST00000624317 287 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 MAK-203ENST00000474039 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 DOCK9-207ENST00000442173 7643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 XRN1-201ENST00000264951 10143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 KTN1-202ENST00000395308 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 UBE3A-203ENST00000428984 2986 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 C9orf57-201ENST00000377024 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 NUCB2-220ENST00000622082 1369 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 GTDC1-202ENST00000344850 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 ADGRG2-201ENST00000340581 3594 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 AL022311.1-201ENST00000623726 19416 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 GABRA1-220ENST00000638159 4088 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 KMO-202ENST00000366557 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 AL132656.3-201ENST00000606384 1595 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 AC104260.2-201ENST00000623551 3497 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 PTPN13-209ENST00000511467 8076 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 STAG2-205ENST00000371160 6045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 SCN2A-202ENST00000375427 8553 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 RN7SKP224-201ENST00000364140 325 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 DEFB135-201ENST00000382208 234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 AC019070.1-201ENST00000415008 1024 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 AL159174.1-202ENST00000425588 442 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 AL590730.1-201ENST00000426283 398 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 AL512326.1-201ENST00000443050 721 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 MTCO3P17-201ENST00000443775 513 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 MTND2P25-201ENST00000449028 610 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 AL132838.2-201ENST00000492041 314 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 AC079209.1-201ENST00000519412 820 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 AC087439.2-201ENST00000519498 552 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 AC024958.1-203ENST00000520256 577 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 CCDC7-207ENST00000535327 700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 AL136298.1-202ENST00000556520 518 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 AC068397.1-201ENST00000560337 531 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 MIR4660-201ENST00000583549 74 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 AC006130.2-201ENST00000586202 326 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 AC022916.3-201ENST00000592961 742 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 MIR6867-201ENST00000610636 67 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 AL162574.2-201ENST00000614618 657 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 AC013727.1-201ENST00000618581 839 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 AC006927.4-201ENST00000639187 543 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 CNGA1-202ENST00000402813 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 AL157756.1-201ENST00000532515 2859 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 PRG4-204ENST00000445192 5044 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 MS4A14-208ENST00000531783 2910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 CNTRL-205ENST00000373850 5824 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 AC003985.2-201ENST00000562268 1669 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 SMAD5-212ENST00000545620 6937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 NR2C2-213ENST00000617312 8113 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 CKAP5-202ENST00000354558 6428 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 BMPR1B-202ENST00000394931 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 MYBPC1-202ENST00000361685 3871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 RIMS1-204ENST00000401910 3542 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 FILIP1-202ENST00000370020 4051 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 CUL2-201ENST00000374746 3903 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 MIR372-201ENST00000362225 67 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 SF3B1-202ENST00000409915 600 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 LINC00446-201ENST00000414743 459 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 RAB9AP4-201ENST00000415230 609 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 OR13Z1P-201ENST00000416141 834 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 GCG-202ENST00000418842 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 TRGV5P-201ENST00000419915 354 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 AL157831.1-201ENST00000426134 473 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.5 ms