Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 AC131532.1-201ENST00000555596 519 ntTSL 4 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CDK5RAP3Q96JB5 AC019322.1-201ENST00000571869 389 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CDK5RAP3Q96JB5 AC129507.1-204ENST00000573601 503 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CDK5RAP3Q96JB5 AC022884.3-201ENST00000579571 248 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CDK5RAP3Q96JB5 AC005537.1-201ENST00000588324 1238 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CDK5RAP3Q96JB5 UBL5-207ENST00000590068 390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CDK5RAP3Q96JB5 AC002487.1-201ENST00000604565 994 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CDK5RAP3Q96JB5 AL139407.1-201ENST00000613826 1175 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CDK5RAP3Q96JB5 AC138907.10-201ENST00000623708 983 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CDK5RAP3Q96JB5 METTL15-211ENST00000634762 718 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CDK5RAP3Q96JB5 AC017104.5-201ENST00000637647 639 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CDK5RAP3Q96JB5 MLIP-213ENST00000514921 5743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CDK5RAP3Q96JB5 SUCLA2P2-201ENST00000417269 1309 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CDK5RAP3Q96JB5 NUP155-202ENST00000381843 4200 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CDK5RAP3Q96JB5 FUT9-201ENST00000302103 12783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CDK5RAP3Q96JB5 SLCO1A2-201ENST00000307378 7682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CDK5RAP3Q96JB5 ERVFRD-3-201ENST00000578561 1617 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CDK5RAP3Q96JB5 ZEB1-202ENST00000361642 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CDK5RAP3Q96JB5 AC004982.1-201ENST00000608770 1655 ntTSL 4 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CDK5RAP3Q96JB5 CRISP1-204ENST00000507853 1793 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CDK5RAP3Q96JB5 LTN1-202ENST00000389194 7749 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CDK5RAP3Q96JB5 SLCO1B7-201ENST00000421593 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CDK5RAP3Q96JB5 FBXL13-207ENST00000455112 2274 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CDK5RAP3Q96JB5 RANBP3L-202ENST00000502994 2278 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CDK5RAP3Q96JB5 AFTPH-204ENST00000409933 2811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CDK5RAP3Q96JB5 PCDH15-206ENST00000373965 9237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CDK5RAP3Q96JB5 WDR5B-201ENST00000330689 3720 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF567-203ENST00000585696 3734 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CDK5RAP3Q96JB5 METTL21EP-201ENST00000298105 713 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CDK5RAP3Q96JB5 RNA5SP90-201ENST00000364801 99 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CDK5RAP3Q96JB5 LINC00474-201ENST00000374014 769 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CDK5RAP3Q96JB5 DEFB136-201ENST00000382209 237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CDK5RAP3Q96JB5 AL021331.1-201ENST00000402817 582 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CDK5RAP3Q96JB5 AC013404.1-201ENST00000413068 249 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CDK5RAP3Q96JB5 BMS1P13-201ENST00000417301 885 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CDK5RAP3Q96JB5 AC005005.2-201ENST00000420779 380 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CDK5RAP3Q96JB5 LINC02532-206ENST00000433965 570 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CDK5RAP3Q96JB5 AL121957.1-202ENST00000437040 329 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CDK5RAP3Q96JB5 AL355306.2-209ENST00000437803 357 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CDK5RAP3Q96JB5 AL158828.1-201ENST00000438582 197 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CDK5RAP3Q96JB5 BMS1P22-202ENST00000440946 1160 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CDK5RAP3Q96JB5 CR769776.1-201ENST00000441254 787 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CDK5RAP3Q96JB5 Z73417.1-201ENST00000447373 778 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CDK5RAP3Q96JB5 GAPDHP14-201ENST00000450472 937 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CDK5RAP3Q96JB5 AL606490.1-201ENST00000452266 765 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CDK5RAP3Q96JB5 PTGES3P5-201ENST00000455109 434 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CDK5RAP3Q96JB5 Z92846.1-201ENST00000456203 268 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CDK5RAP3Q96JB5 LNCSRLR-201ENST00000490375 709 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CDK5RAP3Q96JB5 EGFLAM-AS3-201ENST00000505267 549 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CDK5RAP3Q96JB5 LINC00977-201ENST00000509893 1163 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CDK5RAP3Q96JB5 EIF3KP3-201ENST00000514461 639 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CDK5RAP3Q96JB5 LINC02143-201ENST00000519929 520 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CDK5RAP3Q96JB5 GTF2H1-208ENST00000526630 932 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CDK5RAP3Q96JB5 LINC01493-201ENST00000530102 460 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CDK5RAP3Q96JB5 PAFAH1B2-206ENST00000530272 850 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CDK5RAP3Q96JB5 AC008083.2-201ENST00000546707 476 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CDK5RAP3Q96JB5 GPATCH2L-203ENST00000553588 776 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CDK5RAP3Q96JB5 RNASE9-208ENST00000556208 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CDK5RAP3Q96JB5 RNASE9-210ENST00000557209 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CDK5RAP3Q96JB5 AC007225.2-201ENST00000562529 256 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CDK5RAP3Q96JB5 AC009101.2-201ENST00000564293 456 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CDK5RAP3Q96JB5 MMP2-AS1-202ENST00000569037 553 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CDK5RAP3Q96JB5 MTCYBP13-201ENST00000578634 1093 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CDK5RAP3Q96JB5 PRPF19P1-201ENST00000584766 898 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CDK5RAP3Q96JB5 AC008814.1-201ENST00000603797 406 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CDK5RAP3Q96JB5 DARS-AS1-220ENST00000607985 660 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CDK5RAP3Q96JB5 C1orf185-204ENST00000612209 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CDK5RAP3Q96JB5 AL353770.4-201ENST00000614936 468 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CDK5RAP3Q96JB5 AL590491.2-203ENST00000614969 468 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CDK5RAP3Q96JB5 AC135068.12-201ENST00000637370 931 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CDK5RAP3Q96JB5 ODAM-201ENST00000396094 1319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CDK5RAP3Q96JB5 MUM1L1-202ENST00000357175 4173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CDK5RAP3Q96JB5 PRPF4B-201ENST00000337659 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CDK5RAP3Q96JB5 AC011493.1-201ENST00000596753 1632 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CDK5RAP3Q96JB5 CCT8P1-201ENST00000413611 1657 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CDK5RAP3Q96JB5 AC021205.3-201ENST00000609680 1709 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CDK5RAP3Q96JB5 CLCA1-202ENST00000394711 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CDK5RAP3Q96JB5 MYBPC1-205ENST00000536007 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CDK5RAP3Q96JB5 MYBPC1-206ENST00000541119 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CDK5RAP3Q96JB5 PLCH1-201ENST00000334686 6128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CDK5RAP3Q96JB5 TOPBP1-201ENST00000260810 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CDK5RAP3Q96JB5 AL158066.1-201ENST00000451298 3796 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CDK5RAP3Q96JB5 CLDN12-203ENST00000394605 3488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CDK5RAP3Q96JB5 EEF1A1-210ENST00000610520 3447 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CDK5RAP3Q96JB5 ZEB1-219ENST00000560721 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CDK5RAP3Q96JB5 RNF32-203ENST00000392741 2260 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CDK5RAP3Q96JB5 PSD3-201ENST00000286485 6665 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CDK5RAP3Q96JB5 AL133268.1-201ENST00000405676 1401 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CDK5RAP3Q96JB5 UQCRC2P1-201ENST00000417777 1332 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CDK5RAP3Q96JB5 OR2AE1-201ENST00000316368 1071 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CDK5RAP3Q96JB5 APOA2-201ENST00000367990 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CDK5RAP3Q96JB5 RCAN3-201ENST00000374393 382 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CDK5RAP3Q96JB5 SNORD116-12-201ENST00000384468 92 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CDK5RAP3Q96JB5 MIR600-201ENST00000385007 98 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CDK5RAP3Q96JB5 PDC-201ENST00000391997 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CDK5RAP3Q96JB5 MTERF4-204ENST00000406593 802 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CDK5RAP3Q96JB5 RNU4-22P-201ENST00000411058 166 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CDK5RAP3Q96JB5 RPL12P9-201ENST00000412942 488 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CDK5RAP3Q96JB5 AC025946.1-201ENST00000413286 430 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CDK5RAP3Q96JB5 LINC01589-201ENST00000422971 548 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.7 ms