Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 GRIA3-207ENST00000620443 4943 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
CSPP1Q1MSJ5 AC093311.1-201ENST00000506586 2021 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
CSPP1Q1MSJ5 BPESC1-201ENST00000418282 3522 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
CSPP1Q1MSJ5 DCX-206ENST00000496551 1320 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
CSPP1Q1MSJ5 TTC41P-205ENST00000551270 3963 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
CSPP1Q1MSJ5 VPS35-201ENST00000299138 6790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
CSPP1Q1MSJ5 RBPJ-202ENST00000342320 5761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
CSPP1Q1MSJ5 PPP4R1L-209ENST00000497138 4680 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
CSPP1Q1MSJ5 OR4G11P-202ENST00000642116 1414 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
CSPP1Q1MSJ5 LRRC39-203ENST00000370138 1466 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
CSPP1Q1MSJ5 MAMDC2-AS1-201ENST00000377178 1504 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
CSPP1Q1MSJ5 LINC01361-202ENST00000452834 1526 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
CSPP1Q1MSJ5 PHTF2-207ENST00000424760 1977 ntTSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
CSPP1Q1MSJ5 PAICS-201ENST00000264221 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
CSPP1Q1MSJ5 ARHGEF6-201ENST00000250617 6019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
CSPP1Q1MSJ5 AC009120.2-204ENST00000621548 2032 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
CSPP1Q1MSJ5 AC006378.2-201ENST00000623178 2476 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
CSPP1Q1MSJ5 BICRAL-202ENST00000394168 6515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
CSPP1Q1MSJ5 LINC01619-203ENST00000549802 2169 ntTSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
CSPP1Q1MSJ5 ZNF92-201ENST00000328747 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
CSPP1Q1MSJ5 B3GNT5-206ENST00000465010 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
CSPP1Q1MSJ5 SYF2-202ENST00000354361 926 ntTSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
CSPP1Q1MSJ5 SPRR2D-202ENST00000368756 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
CSPP1Q1MSJ5 SNORA70H-201ENST00000383910 135 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
CSPP1Q1MSJ5 SNORA70J-201ENST00000384182 135 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
CSPP1Q1MSJ5 Y_RNA.481-201ENST00000384373 102 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
CSPP1Q1MSJ5 OPRPN-201ENST00000399575 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
CSPP1Q1MSJ5 AL136100.1-201ENST00000407696 330 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
CSPP1Q1MSJ5 LINC00396-201ENST00000411690 439 ntTSL 3 BASIC7.93□□□□□ -1.14
CSPP1Q1MSJ5 AL132796.1-201ENST00000421617 479 ntTSL 3 BASIC7.93□□□□□ -1.14
CSPP1Q1MSJ5 EIF1AX-AS1-201ENST00000424026 378 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
CSPP1Q1MSJ5 AC013402.2-201ENST00000424257 437 ntTSL 3 BASIC7.93□□□□□ -1.14
CSPP1Q1MSJ5 AC134879.1-201ENST00000426062 394 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
CSPP1Q1MSJ5 RPL7P4-203ENST00000430239 730 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
CSPP1Q1MSJ5 PUDPP2-201ENST00000431423 643 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
CSPP1Q1MSJ5 UBE2V1P5-201ENST00000440070 405 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
CSPP1Q1MSJ5 H3F3BP1-201ENST00000440551 403 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
CSPP1Q1MSJ5 AC092809.1-201ENST00000441469 474 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
CSPP1Q1MSJ5 YWHAQP9-201ENST00000445891 512 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
CSPP1Q1MSJ5 AL133319.1-201ENST00000447848 777 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
CSPP1Q1MSJ5 CYCSP44-201ENST00000448560 313 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
CSPP1Q1MSJ5 SORCS3-AS1-201ENST00000449805 1278 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
CSPP1Q1MSJ5 MYCBP2-AS1-203ENST00000450627 349 ntTSL 3 BASIC7.93□□□□□ -1.14
CSPP1Q1MSJ5 RPL26P30-201ENST00000453533 435 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
CSPP1Q1MSJ5 RPL31P11-202ENST00000454082 372 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
CSPP1Q1MSJ5 NF1P3-201ENST00000457709 450 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
CSPP1Q1MSJ5 MYL6P4-201ENST00000477911 453 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
CSPP1Q1MSJ5 RN7SL561P-201ENST00000488553 281 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
CSPP1Q1MSJ5 AC008443.2-201ENST00000499096 566 ntTSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
CSPP1Q1MSJ5 POU5F1P7-201ENST00000508759 541 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
CSPP1Q1MSJ5 ADGRL3-AS1-204ENST00000509461 481 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
CSPP1Q1MSJ5 JCHAIN-204ENST00000510437 640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.93□□□□□ -1.14
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-1281P-201ENST00000516223 105 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
CSPP1Q1MSJ5 SCARNA18.2-201ENST00000516882 84 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
CSPP1Q1MSJ5 HMGB1P23-201ENST00000518743 568 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
CSPP1Q1MSJ5 GLYATL1P4-201ENST00000529326 906 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
CSPP1Q1MSJ5 AP003072.1-201ENST00000531740 145 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
CSPP1Q1MSJ5 C8orf59-206ENST00000545322 491 ntTSL 3 BASIC7.93□□□□□ -1.14
CSPP1Q1MSJ5 AP000593.3-201ENST00000546065 578 ntTSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
CSPP1Q1MSJ5 AC008083.3-202ENST00000552063 277 ntTSL 3 BASIC7.93□□□□□ -1.14
CSPP1Q1MSJ5 AL513324.1-201ENST00000575236 632 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
CSPP1Q1MSJ5 MIR4307-201ENST00000582802 84 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
CSPP1Q1MSJ5 AC011990.1-201ENST00000592809 734 ntTSL 3 BASIC7.93□□□□□ -1.14
CSPP1Q1MSJ5 AC013553.2-201ENST00000604244 589 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
CSPP1Q1MSJ5 AC093838.1-201ENST00000613014 469 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
CSPP1Q1MSJ5 TEX41-254ENST00000626394 423 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
CSPP1Q1MSJ5 MCFD2-206ENST00000409800 3955 ntTSL 4 BASIC7.93□□□□□ -1.14
CSPP1Q1MSJ5 ATP10D-201ENST00000273859 6655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
CSPP1Q1MSJ5 MLLT10-217ENST00000631589 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
CSPP1Q1MSJ5 LINC00284-201ENST00000423211 3208 ntTSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
CSPP1Q1MSJ5 EIF4E-203ENST00000450253 11523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
CSPP1Q1MSJ5 CFAP221-215ENST00000598644 1532 ntTSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
CSPP1Q1MSJ5 AC003973.3-201ENST00000624863 2822 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
CSPP1Q1MSJ5 MTCO1P14-201ENST00000441695 1559 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
CSPP1Q1MSJ5 STK32A-202ENST00000397936 5393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
CSPP1Q1MSJ5 STMN2-201ENST00000220876 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
CSPP1Q1MSJ5 UGT2B26P-201ENST00000508672 1613 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
CSPP1Q1MSJ5 LINC00939-201ENST00000502479 4972 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
CSPP1Q1MSJ5 AC245100.2-201ENST00000454544 1679 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
CSPP1Q1MSJ5 TNKS-206ENST00000518281 3897 ntTSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
CSPP1Q1MSJ5 LINC01920-201ENST00000441356 2528 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
CSPP1Q1MSJ5 TRPC4-207ENST00000426868 2709 ntTSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
CSPP1Q1MSJ5 ZNF268-209ENST00000541009 3773 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
CSPP1Q1MSJ5 OR5A1-201ENST00000302030 1051 ntAPPRIS P1 BASIC7.92□□□□□ -1.14
CSPP1Q1MSJ5 FAS-203ENST00000355279 983 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
CSPP1Q1MSJ5 RNA5SP514-201ENST00000363717 111 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
CSPP1Q1MSJ5 RNA5SP114-201ENST00000363780 113 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
CSPP1Q1MSJ5 SNORA62.2-201ENST00000364672 152 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
CSPP1Q1MSJ5 GSTM2-205ENST00000414179 982 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
CSPP1Q1MSJ5 AL596448.1-201ENST00000415024 392 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
CSPP1Q1MSJ5 LINC01058-201ENST00000420694 448 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
CSPP1Q1MSJ5 ICA1L-210ENST00000425178 879 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
CSPP1Q1MSJ5 TMEM246-AS1-202ENST00000425734 466 ntTSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
CSPP1Q1MSJ5 AC017002.2-201ENST00000426124 792 ntTSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
CSPP1Q1MSJ5 SKP1P1-201ENST00000438081 489 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
CSPP1Q1MSJ5 DBIL5P2-201ENST00000443827 253 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
CSPP1Q1MSJ5 AC009950.1-206ENST00000445199 517 ntTSL 3 BASIC7.92□□□□□ -1.14
CSPP1Q1MSJ5 RPS27AP15-201ENST00000447672 466 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
CSPP1Q1MSJ5 LINC01034-201ENST00000448806 277 ntTSL 3 BASIC7.92□□□□□ -1.14
CSPP1Q1MSJ5 AL354771.1-201ENST00000452178 602 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.6 ms