Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 CDH19-201ENST00000262150 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
CHD4Q14839 ZNF678-201ENST00000343776 8556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
CHD4Q14839 TCF4-268ENST00000629387 3789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CHD4Q14839 ADAMDEC1-201ENST00000256412 2348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
CHD4Q14839 AC008549.2-201ENST00000333482 706 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CHD4Q14839 Y_RNA.500-201ENST00000384466 111 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CHD4Q14839 AL035696.2-201ENST00000407941 709 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CHD4Q14839 BX119904.3-201ENST00000428194 957 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CHD4Q14839 HSPE1P27-201ENST00000430808 296 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CHD4Q14839 AC084149.1-201ENST00000437233 284 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CHD4Q14839 BMS1P22-202ENST00000440946 1160 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
CHD4Q14839 AC005518.1-201ENST00000448131 1116 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CHD4Q14839 AC008958.1-201ENST00000511047 682 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CHD4Q14839 AC104393.1-201ENST00000517495 255 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CHD4Q14839 RPL23AP53-201ENST00000521854 457 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CHD4Q14839 AF111169.4-202ENST00000553507 262 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CHD4Q14839 AL451086.1-201ENST00000605596 223 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CHD4Q14839 XPNPEP3-201ENST00000357137 7988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
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CHD4Q14839 PCDH18-201ENST00000344876 5906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
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CHD4Q14839 CFH-206ENST00000630130 1658 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
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CHD4Q14839 SLX4IP-201ENST00000334534 6062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
CHD4Q14839 CDR1-201ENST00000370532 2467 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CHD4Q14839 IQCM-205ENST00000636414 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
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CHD4Q14839 SFT2D2-201ENST00000271375 11040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
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CHD4Q14839 PPIG-201ENST00000260970 6368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
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CHD4Q14839 AL449983.1-201ENST00000430640 414 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
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CHD4Q14839 LINC01923-201ENST00000443261 592 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CHD4Q14839 SEC31A-237ENST00000513858 3687 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
CHD4Q14839 AP001267.3-202ENST00000525992 448 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
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CHD4Q14839 AC048338.2-201ENST00000623601 684 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CHD4Q14839 MIR3653-201ENST00000625572 110 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CHD4Q14839 ADGRG4-202ENST00000394141 8971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
CHD4Q14839 VPS13C-204ENST00000395898 11012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
CHD4Q14839 TPTE2-205ENST00000400230 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CHD4Q14839 NOX4-205ENST00000424319 4184 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CHD4Q14839 LMOD2-202ENST00000458573 2346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CHD4Q14839 CCNE2-202ENST00000396133 1361 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
CHD4Q14839 AP005435.3-201ENST00000531260 3198 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CHD4Q14839 SYNCRIP-204ENST00000616122 6764 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
CHD4Q14839 HYKK-206ENST00000569878 4097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
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