Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 DYNC2H1-201ENST00000334267 2984 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
PTCH1Q13635 RNA5SP513-201ENST00000364648 118 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
PTCH1Q13635 RNU6-673P-201ENST00000365084 104 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
PTCH1Q13635 MT-RNR1-201ENST00000389680 954 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
PTCH1Q13635 SNORA74C-2-201ENST00000411179 201 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
PTCH1Q13635 AL050321.1-201ENST00000432363 400 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
PTCH1Q13635 AL356276.2-201ENST00000435919 558 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
PTCH1Q13635 AL133547.1-201ENST00000448546 220 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
PTCH1Q13635 AC146944.2-203ENST00000502493 354 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
PTCH1Q13635 AC139495.1-202ENST00000513164 354 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
PTCH1Q13635 AC098869.2-201ENST00000514187 862 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.43
PTCH1Q13635 LINC02390-201ENST00000541404 560 ntTSL 4 BASIC6.15□□□□□ -1.43
PTCH1Q13635 VPS29-210ENST00000552130 1057 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
PTCH1Q13635 OCLM-201ENST00000574641 884 ntAPPRIS P1 BASIC6.15□□□□□ -1.43
PTCH1Q13635 AC002094.2-201ENST00000577850 1121 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
PTCH1Q13635 RN7SL339P-201ENST00000580597 296 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
PTCH1Q13635 AL354984.3-201ENST00000604803 325 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
PTCH1Q13635 AC069200.1-201ENST00000609511 323 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
PTCH1Q13635 TMEM212-205ENST00000619900 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.43
PTCH1Q13635 AC244100.1-202ENST00000621554 382 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
PTCH1Q13635 SFT2D2-201ENST00000271375 11040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
PTCH1Q13635 SCN2A-207ENST00000631182 8430 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
PTCH1Q13635 P2RY13-201ENST00000325602 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
PTCH1Q13635 MAPK10-372ENST00000641954 3413 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
PTCH1Q13635 PUS7L-203ENST00000431332 1873 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.43
PTCH1Q13635 MEIOB-205ENST00000470044 1857 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.43
PTCH1Q13635 CNTN1-202ENST00000348761 3328 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
PTCH1Q13635 CASP10-202ENST00000286186 5928 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
PTCH1Q13635 AL359313.1-201ENST00000447311 2293 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
PTCH1Q13635 AC103740.1-201ENST00000558888 7427 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
PTCH1Q13635 LMNTD1-202ENST00000413632 1520 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
PTCH1Q13635 PCDH15-214ENST00000395446 3948 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
PTCH1Q13635 CAST-201ENST00000309190 4282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
PTCH1Q13635 OR5M3-202ENST00000641993 1400 ntAPPRIS P1 BASIC6.14□□□□□ -1.43
PTCH1Q13635 CDH17-201ENST00000027335 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
PTCH1Q13635 MYBPC1-205ENST00000536007 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
PTCH1Q13635 MYBPC1-206ENST00000541119 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
PTCH1Q13635 NECAB1-202ENST00000521366 2908 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
PTCH1Q13635 ADAM29-214ENST00000618444 2949 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.14□□□□□ -1.43
PTCH1Q13635 ZNF681-201ENST00000402377 6497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
PTCH1Q13635 C1orf112-201ENST00000286031 4355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
PTCH1Q13635 PMS1-202ENST00000374826 948 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
PTCH1Q13635 AL157831.1-201ENST00000426134 473 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
PTCH1Q13635 AC018644.1-201ENST00000429934 551 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
PTCH1Q13635 AC013410.1-201ENST00000436223 1232 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
PTCH1Q13635 AL353748.1-201ENST00000440753 474 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
PTCH1Q13635 AL603839.1-201ENST00000453437 432 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
PTCH1Q13635 SPTSSB-202ENST00000497137 880 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
PTCH1Q13635 AC025741.1-201ENST00000506100 544 ntTSL 4 BASIC6.14□□□□□ -1.43
PTCH1Q13635 FTH1P21-201ENST00000512179 511 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
PTCH1Q13635 AC084757.2-201ENST00000559165 540 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
PTCH1Q13635 AC087477.6-201ENST00000559595 843 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
PTCH1Q13635 AC007066.2-202ENST00000566531 914 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
PTCH1Q13635 MIR4298-201ENST00000584380 73 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
PTCH1Q13635 LINC01355-202ENST00000604481 400 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
PTCH1Q13635 RNU4-89P-201ENST00000607443 133 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
PTCH1Q13635 ZNF479-203ENST00000620639 1239 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
PTCH1Q13635 AC010809.3-201ENST00000621310 641 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
PTCH1Q13635 AC091953.5-201ENST00000622919 233 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
PTCH1Q13635 LINC01902-203ENST00000637369 7356 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
PTCH1Q13635 ALMS1-IT1-201ENST00000441587 2107 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
PTCH1Q13635 FOXP2-226ENST00000635638 2598 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
PTCH1Q13635 ZNF24-202ENST00000399061 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
PTCH1Q13635 ARHGAP42-201ENST00000298815 4752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
PTCH1Q13635 RFX3-212ENST00000617270 9253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
PTCH1Q13635 AL133243.3-201ENST00000617415 3004 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
PTCH1Q13635 USP29-202ENST00000598197 3284 ntAPPRIS P1 BASIC6.13□□□□□ -1.43
PTCH1Q13635 TRIM51-201ENST00000244891 1329 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
PTCH1Q13635 AP005435.3-201ENST00000531260 3198 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
PTCH1Q13635 AL359922.3-201ENST00000624779 1670 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
PTCH1Q13635 C5orf42-201ENST00000425232 11199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
PTCH1Q13635 RNU1-14P-201ENST00000362759 152 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
PTCH1Q13635 RNA5SP130-201ENST00000364431 114 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
PTCH1Q13635 C1orf105-203ENST00000367727 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
PTCH1Q13635 SPRR2E-202ENST00000368751 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
PTCH1Q13635 RPS3AP25-201ENST00000411660 793 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
PTCH1Q13635 MED4-AS1-201ENST00000422483 542 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
PTCH1Q13635 AC004938.1-201ENST00000438468 308 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
PTCH1Q13635 AC105398.1-201ENST00000446073 402 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
PTCH1Q13635 AC012671.1-201ENST00000451912 203 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
PTCH1Q13635 RPS27AP17-201ENST00000463344 455 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
PTCH1Q13635 AC090589.1-201ENST00000473109 362 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
PTCH1Q13635 AC090686.1-201ENST00000481577 749 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
PTCH1Q13635 NPM1P41-201ENST00000512920 831 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
PTCH1Q13635 C5orf46-203ENST00000515291 573 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
PTCH1Q13635 AC024958.1-203ENST00000520256 577 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
PTCH1Q13635 AC022874.1-201ENST00000526382 550 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
PTCH1Q13635 AC053481.4-201ENST00000583164 216 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
PTCH1Q13635 AC243829.4-202ENST00000610845 410 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
PTCH1Q13635 DDAH1-206ENST00000633113 703 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
PTCH1Q13635 IL1RAP-205ENST00000412504 4875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
PTCH1Q13635 MYB-239ENST00000534121 2238 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
PTCH1Q13635 EPS8-207ENST00000540613 2204 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
PTCH1Q13635 PTPRD-202ENST00000356435 9472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PTCH1Q13635 CD200R1-204ENST00000471858 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
PTCH1Q13635 THOC1-221ENST00000631280 2011 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PTCH1Q13635 LMO3-201ENST00000261169 3810 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
PTCH1Q13635 TMEM255A-202ENST00000371352 2879 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PTCH1Q13635 GOLPH3L-201ENST00000271732 2999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
PTCH1Q13635 TTTY21B-201ENST00000421353 307 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
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