Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 AC239798.3-201ENST00000454459 408 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ITGB3BPQ13352 AC010149.1-201ENST00000455357 571 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ITGB3BPQ13352 AC053481.1-201ENST00000467217 306 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ITGB3BPQ13352 PLSCR5-202ENST00000482567 1018 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
ITGB3BPQ13352 SSBP1-211ENST00000484178 676 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ITGB3BPQ13352 AC110288.1-201ENST00000517950 446 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ITGB3BPQ13352 AP003557.1-202ENST00000528978 562 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ITGB3BPQ13352 SAMD15-202ENST00000533095 412 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ITGB3BPQ13352 TMEM106C-220ENST00000552561 810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
ITGB3BPQ13352 RPL21P7-201ENST00000557463 483 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ITGB3BPQ13352 AL121890.3-201ENST00000618494 516 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ITGB3BPQ13352 AC011944.2-201ENST00000624440 683 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ITGB3BPQ13352 LINC01808-202ENST00000641680 1116 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ITGB3BPQ13352 ESCO1-204ENST00000622333 1850 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ITGB3BPQ13352 ATG12-208ENST00000509910 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
ITGB3BPQ13352 STARD4-201ENST00000296632 4606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ITGB3BPQ13352 PLCH1-201ENST00000334686 6128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
ITGB3BPQ13352 C15orf41-212ENST00000567389 2618 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
ITGB3BPQ13352 PIK3CB-214ENST00000544716 3181 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
ITGB3BPQ13352 ROBO2-213ENST00000614793 7662 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ITGB3BPQ13352 MTUS1-203ENST00000381861 3996 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ITGB3BPQ13352 ARHGAP21-218ENST00000636789 4210 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ITGB3BPQ13352 CMYA5-201ENST00000446378 12847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ITGB3BPQ13352 LRRTM4-203ENST00000409282 2451 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
ITGB3BPQ13352 CASC19-255ENST00000641733 1385 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ITGB3BPQ13352 IPO5-201ENST00000261574 6003 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
ITGB3BPQ13352 PTPN13-209ENST00000511467 8076 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ITGB3BPQ13352 BBX-203ENST00000402543 3980 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ITGB3BPQ13352 CASC19-204ENST00000641001 2055 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ITGB3BPQ13352 SNORA62-201ENST00000365493 153 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ITGB3BPQ13352 AC136624.1-201ENST00000400791 413 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ITGB3BPQ13352 AL356968.2-201ENST00000412769 1257 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ITGB3BPQ13352 COX6CP17-201ENST00000421389 185 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ITGB3BPQ13352 GAPDHP49-201ENST00000421421 961 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ITGB3BPQ13352 NPM1P26-201ENST00000426339 738 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ITGB3BPQ13352 DHFRP3-201ENST00000455595 559 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ITGB3BPQ13352 RPL23AP37-201ENST00000479658 549 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ITGB3BPQ13352 ATP6V1G1P6-201ENST00000504007 334 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ITGB3BPQ13352 AC025741.1-201ENST00000506100 544 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ITGB3BPQ13352 AC010476.1-201ENST00000519111 851 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ITGB3BPQ13352 AC093331.2-201ENST00000520459 677 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ITGB3BPQ13352 LINC02157-201ENST00000558885 447 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ITGB3BPQ13352 LINC02284-202ENST00000560924 566 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ITGB3BPQ13352 BPIFA4P-203ENST00000603168 689 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ITGB3BPQ13352 COX6CP4-201ENST00000605798 228 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ITGB3BPQ13352 DAOA-AS1_1.1-201ENST00000613021 201 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ITGB3BPQ13352 AC234782.5-201ENST00000617723 324 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ITGB3BPQ13352 AL035461.2-201ENST00000619201 524 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ITGB3BPQ13352 AC079298.2-201ENST00000623885 459 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ITGB3BPQ13352 HMCN1-201ENST00000271588 18208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
ITGB3BPQ13352 GTDC1-203ENST00000392867 2408 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ITGB3BPQ13352 LYST-202ENST00000389794 12985 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ITGB3BPQ13352 PPP1R9A-205ENST00000424654 4058 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ITGB3BPQ13352 ING3-201ENST00000315870 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
ITGB3BPQ13352 LINC02389-201ENST00000535058 3546 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ITGB3BPQ13352 LINC01239-202ENST00000436786 2347 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ITGB3BPQ13352 ZBED6-202ENST00000550078 12481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
ITGB3BPQ13352 FLJ46284-201ENST00000504861 3421 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ITGB3BPQ13352 RBMS1-203ENST00000409075 1550 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
ITGB3BPQ13352 AC104118.1-201ENST00000607625 1589 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ITGB3BPQ13352 SLC24A2-202ENST00000341998 10749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
ITGB3BPQ13352 AC016687.3-202ENST00000505018 2404 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
ITGB3BPQ13352 MPHOSPH9-211ENST00000541076 6136 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ITGB3BPQ13352 PTRH2-203ENST00000470557 4114 ntAPPRIS P3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ITGB3BPQ13352 AC004803.1-201ENST00000503602 3207 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
ITGB3BPQ13352 AC087190.4-201ENST00000574616 8334 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ITGB3BPQ13352 AC079915.1-201ENST00000584382 2780 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ITGB3BPQ13352 LARP4-202ENST00000347328 3621 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
ITGB3BPQ13352 AC008033.1-201ENST00000216407 1162 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ITGB3BPQ13352 LGALS13-201ENST00000221797 602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
ITGB3BPQ13352 RNU1-94P-201ENST00000362627 173 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ITGB3BPQ13352 AC098872.1-201ENST00000413304 543 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ITGB3BPQ13352 SEPT7P8-201ENST00000413308 775 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ITGB3BPQ13352 AC009237.10-201ENST00000414112 510 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ITGB3BPQ13352 AC004448.2-201ENST00000422360 586 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ITGB3BPQ13352 NAP1L4P3-201ENST00000432820 1147 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ITGB3BPQ13352 CASP12-204ENST00000433738 709 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
ITGB3BPQ13352 AC091390.1-201ENST00000433904 331 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ITGB3BPQ13352 RPS23P7-201ENST00000466210 444 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ITGB3BPQ13352 RPS4XP18-201ENST00000495480 763 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ITGB3BPQ13352 AC024587.2-201ENST00000509458 805 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ITGB3BPQ13352 AC110760.1-201ENST00000513770 590 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ITGB3BPQ13352 RNA5SP446-201ENST00000515955 82 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ITGB3BPQ13352 THUMPD3-AS1-210ENST00000519043 1115 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ITGB3BPQ13352 NRG3-205ENST00000537893 1174 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
ITGB3BPQ13352 LINC01533-202ENST00000588694 632 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ITGB3BPQ13352 OR10A6-202ENST00000623991 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ITGB3BPQ13352 KIF21A-201ENST00000361418 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
ITGB3BPQ13352 IL6ST-212ENST00000522633 1878 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
ITGB3BPQ13352 RPS6KA5-207ENST00000614987 26795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
ITGB3BPQ13352 GPR85-201ENST00000297146 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
ITGB3BPQ13352 ADCY10-202ENST00000367851 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
ITGB3BPQ13352 CASC1-202ENST00000354189 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
ITGB3BPQ13352 NUTM2B-AS1-213ENST00000619625 7611 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ITGB3BPQ13352 SAMSN1-201ENST00000285670 2185 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
ITGB3BPQ13352 MTCO1P22-201ENST00000604619 1360 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ITGB3BPQ13352 ABCB5-201ENST00000258738 2906 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
ITGB3BPQ13352 AC139769.1-204ENST00000472297 1931 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
ITGB3BPQ13352 AC079062.1-203ENST00000581862 3610 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
ITGB3BPQ13352 ABI3BP-215ENST00000495063 3714 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.7 ms