Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 ZNF138-207ENST00000494380 842 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 AC074124.1-201ENST00000502368 375 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 AC005674.1-201ENST00000503493 459 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 BMPR1B-AS1-201ENST00000510795 511 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 AF279873.1-201ENST00000523393 313 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 AP003122.3-201ENST00000526316 255 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 AF235103.1-201ENST00000530223 439 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 AC117373.1-201ENST00000544036 392 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 AC123904.2-201ENST00000548059 300 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 SNRPGP18-201ENST00000553000 214 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 AL845552.1-201ENST00000556820 323 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 AC015908.3-202ENST00000579367 457 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 LINC01894-201ENST00000580984 487 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 AC005180.2-201ENST00000585620 562 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 LINC01897-203ENST00000591503 369 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 AC004542.2-201ENST00000602847 546 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 AL359094.1-211ENST00000608350 335 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 AL136097.3-201ENST00000611097 505 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 MIR6806-201ENST00000622141 64 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 DARS-AS1-227ENST00000627442 633 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 TRIQK-212ENST00000520686 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 SYNE1-213ENST00000448038 6001 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 TMEM200A-203ENST00000545622 2918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 CCDC178-209ENST00000579947 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 TOX3-202ENST00000407228 3124 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 GON4L-204ENST00000437809 7713 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 PNPLA4-204ENST00000537427 2559 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 YES1-201ENST00000314574 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 CD209-203ENST00000315599 4283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 AL591379.1-201ENST00000315293 3739 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 ATR-201ENST00000350721 8249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 FOXP2-201ENST00000350908 2638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 ARHGAP32-202ENST00000392657 6556 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 STOM-201ENST00000286713 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 SLC24A1-209ENST00000537259 3983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 AL162726.3-201ENST00000637606 1301 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 TNFRSF19-203ENST00000382263 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 TMEM170B-201ENST00000379426 8362 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 AC116366.3-205ENST00000640655 8032 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 ARMCX5-201ENST00000246174 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 LINC02493-201ENST00000509964 1704 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 AC114546.3-201ENST00000623582 1734 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 AFP-201ENST00000226359 1914 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 PIAS1-201ENST00000249636 8115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 SPRY1-201ENST00000339241 2348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 ATP2B4-204ENST00000367218 8918 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 MS4A2-204ENST00000617306 3512 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 XRCC4-202ENST00000338635 1579 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 GABRA2-205ENST00000507069 1562 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 KRBOX1-202ENST00000418176 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 CLNK-204ENST00000515667 4180 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 KLHL8-203ENST00000498875 5175 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 AC016831.1-201ENST00000432045 6411 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 NFATC3-202ENST00000346183 6040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 SLC8A3-208ENST00000533541 3409 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 APOL4-212ENST00000616056 3423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 IL31RA-207ENST00000490985 2414 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 NPSR1-AS1-205ENST00000436945 1406 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 CD101-202ENST00000369470 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 RBBP4-202ENST00000373493 7943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 AC006600.2-201ENST00000624834 2506 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 MAPK14-203ENST00000310795 1066 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 RNU1-5P-201ENST00000362684 144 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 Y_RNA.193-201ENST00000363979 102 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 RNU6-169P-201ENST00000365336 107 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 SNORA7A-201ENST00000384765 139 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 RNU6-952P-201ENST00000391164 108 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 EEF1E1-BLOC1S5-201ENST00000397456 768 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 AL583835.1-201ENST00000399570 407 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 LRRTM4-205ENST00000409911 2976 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 RN7SKP222-201ENST00000410651 315 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 AC003092.1-201ENST00000415536 639 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 AC127526.1-201ENST00000417526 366 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
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CLN3Q13286 AHCYP8-201ENST00000425108 209 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 AC024619.1-202ENST00000426489 495 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 CBX3P6-201ENST00000430257 527 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 AL591501.1-201ENST00000439992 495 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 FAM103A2P-201ENST00000444122 354 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 AC022498.1-201ENST00000449845 696 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 AL583843.1-201ENST00000456070 346 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 RNU6-1208P-201ENST00000459588 107 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 RPL23AP71-201ENST00000470966 469 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 AC040975.1-201ENST00000472104 316 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 AL135752.1-201ENST00000479477 471 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 AL161747.1-201ENST00000480068 358 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 AL163973.1-201ENST00000484753 577 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 RN7SL170P-201ENST00000487098 295 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 NREP-AS1-201ENST00000503242 411 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 TTC39CP1-201ENST00000512513 755 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 LINC00535-202ENST00000517785 264 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 AC022616.3-201ENST00000523940 148 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 AP003072.2-201ENST00000527756 676 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 AC022884.3-201ENST00000579571 248 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 AC008109.1-201ENST00000583163 826 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 LINC02210-208ENST00000585118 546 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 AC011447.2-201ENST00000592921 283 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 RPL7AP69-201ENST00000595306 806 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 ACTR3BP1-201ENST00000605584 1247 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 RFPL4AP6-201ENST00000616792 846 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
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