Protein–RNA interactions for Protein: Q13214

SEMA3B, Semaphorin-3B, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3BQ13214 AL121989.1-201ENST00000585888 746 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
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SEMA3BQ13214 AL161896.1-201ENST00000597248 508 ntTSL 4 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SEMA3BQ13214 AC087783.2-201ENST00000605070 562 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SEMA3BQ13214 AC005377.1-201ENST00000605126 456 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SEMA3BQ13214 AC108359.1-201ENST00000616451 1211 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SEMA3BQ13214 OR8H2-202ENST00000618136 1038 ntAPPRIS ALT1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SEMA3BQ13214 AC087632.1-216ENST00000625619 487 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SEMA3BQ13214 AC093495.1-217ENST00000627385 428 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SEMA3BQ13214 AJ009632.2-203ENST00000634708 1205 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SEMA3BQ13214 AC135068.12-201ENST00000637370 931 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SEMA3BQ13214 AC092376.2-201ENST00000622621 4116 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SEMA3BQ13214 TCN1-201ENST00000257264 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
SEMA3BQ13214 MUC17-201ENST00000306151 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
SEMA3BQ13214 DBT-202ENST00000370132 10799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
SEMA3BQ13214 AC087257.1-201ENST00000506925 2639 ntTSL 4 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SEMA3BQ13214 OR2AT4-203ENST00000641541 8795 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SEMA3BQ13214 SRSF11-201ENST00000370949 3034 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
SEMA3BQ13214 OR2T7-202ENST00000641557 3409 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SEMA3BQ13214 DSC3-201ENST00000360428 6939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
SEMA3BQ13214 KMT5B-215ENST00000615954 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
SEMA3BQ13214 RCOR3-201ENST00000367005 4246 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
SEMA3BQ13214 PPEF1-201ENST00000349874 2687 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SEMA3BQ13214 AL121950.1-201ENST00000624993 2077 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SEMA3BQ13214 LINC02060-201ENST00000506041 1626 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
SEMA3BQ13214 HGF-202ENST00000354224 1425 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
SEMA3BQ13214 PHLDB2-214ENST00000495180 4159 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SEMA3BQ13214 RNU6-236P-201ENST00000363886 106 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SEMA3BQ13214 HTN3-201ENST00000381057 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
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SEMA3BQ13214 TRAV16-201ENST00000390444 329 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
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SEMA3BQ13214 LINC00342-201ENST00000412393 654 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
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SEMA3BQ13214 CASC19-203ENST00000523510 575 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SEMA3BQ13214 AC130462.1-201ENST00000548144 549 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SEMA3BQ13214 AL929601.2-201ENST00000549951 381 ntTSL 4 BASIC5.35□□□□□ -1.55
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SEMA3BQ13214 AC096586.1-201ENST00000610267 561 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SEMA3BQ13214 AL355493.4-201ENST00000618530 292 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
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SEMA3BQ13214 DLG2-AS1_1.1-201ENST00000622319 213 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SEMA3BQ13214 RNU6-538P-201ENST00000622329 107 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SEMA3BQ13214 AC024337.2-201ENST00000616608 2797 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SEMA3BQ13214 RAPGEF2-201ENST00000264431 6949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
SEMA3BQ13214 SRPK2-201ENST00000357311 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
SEMA3BQ13214 DST-205ENST00000370765 8999 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
SEMA3BQ13214 IL1RAP-205ENST00000412504 4875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
SEMA3BQ13214 PAPOLA-202ENST00000392990 2588 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
SEMA3BQ13214 PHACTR2P1-201ENST00000605639 1414 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SEMA3BQ13214 C2orf73-208ENST00000615983 1376 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
SEMA3BQ13214 OR1L8-201ENST00000304865 1061 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.55
SEMA3BQ13214 RN7SKP104-201ENST00000362605 328 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SEMA3BQ13214 RNU6-666P-201ENST00000363499 107 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SEMA3BQ13214 RNU6-452P-201ENST00000384406 107 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SEMA3BQ13214 PDC-201ENST00000391997 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
SEMA3BQ13214 POLR1D-202ENST00000399696 668 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
SEMA3BQ13214 RN7SKP97-201ENST00000410966 333 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SEMA3BQ13214 MTND2P16-201ENST00000419987 799 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SEMA3BQ13214 AL031429.1-201ENST00000426775 749 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
SEMA3BQ13214 USP9YP9-201ENST00000429406 715 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SEMA3BQ13214 AL162726.1-201ENST00000436084 455 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
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