Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 MYBPC1-204ENST00000452455 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
NEDD8-MDP1E9PL57 SMAD5-212ENST00000545620 6937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
NEDD8-MDP1E9PL57 ZFAND6-223ENST00000616533 1653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
NEDD8-MDP1E9PL57 POU2F1-212ENST00000541643 13937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
NEDD8-MDP1E9PL57 ERGIC2-212ENST00000611644 4961 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
NEDD8-MDP1E9PL57 EYA1-203ENST00000388740 3788 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
NEDD8-MDP1E9PL57 GABRG2-214ENST00000639111 11735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
NEDD8-MDP1E9PL57 RAD17P1-201ENST00000418130 2042 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
NEDD8-MDP1E9PL57 PIGN-242ENST00000640145 4505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
NEDD8-MDP1E9PL57 PRG4-202ENST00000367483 4921 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
NEDD8-MDP1E9PL57 CNTRL-205ENST00000373850 5824 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
NEDD8-MDP1E9PL57 OTC-201ENST00000039007 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
NEDD8-MDP1E9PL57 AL445487.1-201ENST00000415694 1580 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
NEDD8-MDP1E9PL57 AC021146.4-201ENST00000309229 279 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
NEDD8-MDP1E9PL57 BMS1P3-201ENST00000372011 932 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
NEDD8-MDP1E9PL57 AL672167.2-201ENST00000377164 879 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
NEDD8-MDP1E9PL57 KRTAP3-2-201ENST00000391587 702 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
NEDD8-MDP1E9PL57 FABP12P1-201ENST00000401911 322 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
NEDD8-MDP1E9PL57 OR1F12-201ENST00000402365 945 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
NEDD8-MDP1E9PL57 AP000580.1-201ENST00000404439 358 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
NEDD8-MDP1E9PL57 RNU2-22P-201ENST00000411266 212 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
NEDD8-MDP1E9PL57 AC079630.1-201ENST00000412812 585 ntTSL 4 BASIC4.75□□□□□ -1.65
NEDD8-MDP1E9PL57 RPL12P34-201ENST00000424532 479 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
NEDD8-MDP1E9PL57 AL732292.1-201ENST00000426692 226 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
NEDD8-MDP1E9PL57 AC092017.2-201ENST00000427600 362 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
NEDD8-MDP1E9PL57 AL590623.1-201ENST00000427864 105 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
NEDD8-MDP1E9PL57 MTCO1P45-201ENST00000431457 267 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
NEDD8-MDP1E9PL57 MRPS33P4-201ENST00000434892 317 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
NEDD8-MDP1E9PL57 YWHAZP2-201ENST00000440317 728 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
NEDD8-MDP1E9PL57 RPL31P20-201ENST00000449593 360 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01768-201ENST00000453347 476 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
NEDD8-MDP1E9PL57 AC090686.1-201ENST00000481577 749 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
NEDD8-MDP1E9PL57 NPM1P29-201ENST00000483112 803 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
NEDD8-MDP1E9PL57 AC095056.1-201ENST00000503918 425 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
NEDD8-MDP1E9PL57 AK4P6-201ENST00000505168 528 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
NEDD8-MDP1E9PL57 PRELID3BP5-201ENST00000508612 460 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
NEDD8-MDP1E9PL57 AP002981.1-201ENST00000517692 975 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
NEDD8-MDP1E9PL57 AC090371.2-205ENST00000580366 490 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF540-204ENST00000586792 564 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
NEDD8-MDP1E9PL57 TTN-AS1-232ENST00000589487 1077 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR99AHG-211ENST00000602323 475 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
NEDD8-MDP1E9PL57 AL445423.1-201ENST00000609941 536 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
NEDD8-MDP1E9PL57 AC074140.1-201ENST00000621617 208 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
NEDD8-MDP1E9PL57 AC119674.1-220ENST00000641502 1048 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
NEDD8-MDP1E9PL57 MTND5P23-201ENST00000430812 1655 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
NEDD8-MDP1E9PL57 AC245100.2-201ENST00000454544 1679 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
NEDD8-MDP1E9PL57 AC004982.1-201ENST00000608770 1655 ntTSL 4 BASIC4.75□□□□□ -1.65
NEDD8-MDP1E9PL57 GABRG2-202ENST00000361925 3767 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
NEDD8-MDP1E9PL57 CNTN5-212ENST00000619298 5734 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
NEDD8-MDP1E9PL57 ABCA12-201ENST00000272895 9100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
NEDD8-MDP1E9PL57 ANO3-202ENST00000525139 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01520-201ENST00000441457 1487 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
NEDD8-MDP1E9PL57 EMSY-204ENST00000524490 4015 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
NEDD8-MDP1E9PL57 AL731532.2-201ENST00000623542 1953 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
NEDD8-MDP1E9PL57 IPO5-201ENST00000261574 6003 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
NEDD8-MDP1E9PL57 EXOC1-202ENST00000349598 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
NEDD8-MDP1E9PL57 STX3-208ENST00000641815 3236 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
NEDD8-MDP1E9PL57 AC097461.1-201ENST00000568928 2821 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
NEDD8-MDP1E9PL57 OSBPL11-201ENST00000296220 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
NEDD8-MDP1E9PL57 AC027228.2-201ENST00000567141 2154 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
NEDD8-MDP1E9PL57 TLR3-201ENST00000296795 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
NEDD8-MDP1E9PL57 RAP1B-201ENST00000250559 13438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM3C2-201ENST00000312214 681 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
NEDD8-MDP1E9PL57 OR14A16-201ENST00000357627 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.74□□□□□ -1.65
NEDD8-MDP1E9PL57 LIX1L-AS1-201ENST00000366105 377 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01198-201ENST00000416521 500 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
NEDD8-MDP1E9PL57 AL139240.1-201ENST00000422963 505 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
NEDD8-MDP1E9PL57 RPL7P57-201ENST00000423238 740 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
NEDD8-MDP1E9PL57 SETP10-201ENST00000424368 814 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
NEDD8-MDP1E9PL57 AL445528.1-201ENST00000426330 420 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
NEDD8-MDP1E9PL57 AL354896.1-201ENST00000430214 561 ntTSL 4 BASIC4.74□□□□□ -1.65
NEDD8-MDP1E9PL57 GYPE-202ENST00000437468 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
NEDD8-MDP1E9PL57 AL592494.1-201ENST00000437523 309 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
NEDD8-MDP1E9PL57 NPM1P33-201ENST00000438918 872 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
NEDD8-MDP1E9PL57 AC008080.4-202ENST00000440034 1005 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
NEDD8-MDP1E9PL57 GTF3AP5-201ENST00000442645 697 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
NEDD8-MDP1E9PL57 AL356421.2-201ENST00000446733 197 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
NEDD8-MDP1E9PL57 EIF2S2P2-201ENST00000447161 982 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
NEDD8-MDP1E9PL57 ZIC4-AS1-201ENST00000462168 268 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
NEDD8-MDP1E9PL57 RPL21P126-201ENST00000470049 478 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
NEDD8-MDP1E9PL57 AC093840.1-201ENST00000511599 336 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
NEDD8-MDP1E9PL57 ZCCHC10-209ENST00000513541 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
NEDD8-MDP1E9PL57 RNA5SP249-201ENST00000516127 99 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
NEDD8-MDP1E9PL57 OR7E10P-201ENST00000526420 991 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
NEDD8-MDP1E9PL57 AC013549.2-201ENST00000526953 489 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
NEDD8-MDP1E9PL57 PTH-202ENST00000529816 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
NEDD8-MDP1E9PL57 TEX12-202ENST00000530752 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
NEDD8-MDP1E9PL57 AP005436.3-201ENST00000532849 572 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
NEDD8-MDP1E9PL57 AC005906.2-204ENST00000541095 481 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
NEDD8-MDP1E9PL57 AC109630.1-202ENST00000560552 579 ntTSL 4 BASIC4.74□□□□□ -1.65
NEDD8-MDP1E9PL57 AC021351.1-201ENST00000560886 652 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
NEDD8-MDP1E9PL57 SP2-AS1-204ENST00000585280 405 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
NEDD8-MDP1E9PL57 AC012213.4-201ENST00000606457 354 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
NEDD8-MDP1E9PL57 AC015804.1-201ENST00000622935 435 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
NEDD8-MDP1E9PL57 RUVBL2-213ENST00000639391 120 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
NEDD8-MDP1E9PL57 TLR8-201ENST00000218032 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
NEDD8-MDP1E9PL57 PPP1R9A-201ENST00000289495 3983 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
NEDD8-MDP1E9PL57 RASA1-203ENST00000506290 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
NEDD8-MDP1E9PL57 TIPARP-205ENST00000486483 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
NEDD8-MDP1E9PL57 RPS6KA5-207ENST00000614987 26795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 139.8 ms