Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D0

PHACTR1, Phosphatase and actin regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR1Q9C0D0 AC008551.1-201ENST00000575612 405 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
PHACTR1Q9C0D0 MIR544B-201ENST00000582372 78 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
PHACTR1Q9C0D0 AC009303.2-206ENST00000588042 786 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
PHACTR1Q9C0D0 LINC01905-202ENST00000588139 459 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
PHACTR1Q9C0D0 VN1R80P-201ENST00000597126 338 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
PHACTR1Q9C0D0 AL360085.1-201ENST00000604713 532 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
PHACTR1Q9C0D0 AL136363.1-201ENST00000605349 337 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
PHACTR1Q9C0D0 COX6CP4-201ENST00000605798 228 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
PHACTR1Q9C0D0 AC093788.1-201ENST00000609356 927 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
PHACTR1Q9C0D0 AL365204.3-201ENST00000612448 685 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
PHACTR1Q9C0D0 AL352984.2-202ENST00000613699 155 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
PHACTR1Q9C0D0 AL158801.5-201ENST00000623123 465 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
PHACTR1Q9C0D0 SNORA16A-202ENST00000628458 135 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
PHACTR1Q9C0D0 HBG1-202ENST00000632727 369 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
PHACTR1Q9C0D0 AL356585.10-201ENST00000641883 123 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
PHACTR1Q9C0D0 ASTN2-AS1-201ENST00000418250 1756 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
PHACTR1Q9C0D0 CACNB4-223ENST00000636380 1756 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
PHACTR1Q9C0D0 AC100810.3-201ENST00000633189 2240 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
PHACTR1Q9C0D0 GLRA2-204ENST00000443437 3182 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
PHACTR1Q9C0D0 DNM1L-201ENST00000266481 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
PHACTR1Q9C0D0 CACNA1E-210ENST00000621791 16171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
PHACTR1Q9C0D0 OR8B8-202ENST00000642064 3914 ntAPPRIS P1 BASIC6.86□□□□□ -1.31
PHACTR1Q9C0D0 ZNF735-201ENST00000429565 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
PHACTR1Q9C0D0 SBNO1-202ENST00000420886 10981 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
PHACTR1Q9C0D0 LINC01527-201ENST00000419578 1997 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
PHACTR1Q9C0D0 TMCC1P1-201ENST00000518897 1980 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
PHACTR1Q9C0D0 LINC00284-201ENST00000423211 3208 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
PHACTR1Q9C0D0 AC007255.1-201ENST00000450540 1376 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
PHACTR1Q9C0D0 SCAMP1-206ENST00000618166 1358 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
PHACTR1Q9C0D0 CACNB4-203ENST00000397327 2112 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
PHACTR1Q9C0D0 NCOA4-206ENST00000585056 2124 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
PHACTR1Q9C0D0 AIG1-209ENST00000629020 3636 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
PHACTR1Q9C0D0 ZRANB3-211ENST00000619650 2494 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
PHACTR1Q9C0D0 AQR-201ENST00000156471 9694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
PHACTR1Q9C0D0 TUBBP10-201ENST00000427668 1301 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
PHACTR1Q9C0D0 EEF1A1P42-201ENST00000613436 1331 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
PHACTR1Q9C0D0 AC245100.2-201ENST00000454544 1679 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
PHACTR1Q9C0D0 RNA5SP114-201ENST00000363780 113 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
PHACTR1Q9C0D0 SNORA51.2-201ENST00000364595 132 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
PHACTR1Q9C0D0 MIR301B-201ENST00000390813 78 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
PHACTR1Q9C0D0 ATP5J-206ENST00000400099 492 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
PHACTR1Q9C0D0 RPSAP44-201ENST00000406712 884 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
PHACTR1Q9C0D0 MAST4-207ENST00000407621 559 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
PHACTR1Q9C0D0 AC073264.1-201ENST00000411508 416 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
PHACTR1Q9C0D0 SNX18P13-201ENST00000412442 529 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
PHACTR1Q9C0D0 AL078645.1-201ENST00000414377 423 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
PHACTR1Q9C0D0 MTND3P17-201ENST00000416968 344 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
PHACTR1Q9C0D0 TAB2-AS1-201ENST00000424421 730 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
PHACTR1Q9C0D0 MTCO2P12-201ENST00000427426 682 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
PHACTR1Q9C0D0 AL139042.1-201ENST00000429137 305 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
PHACTR1Q9C0D0 AL357314.1-201ENST00000433521 806 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
PHACTR1Q9C0D0 AC073062.1-201ENST00000434509 455 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
PHACTR1Q9C0D0 AC132807.1-201ENST00000449613 458 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
PHACTR1Q9C0D0 AC073486.1-201ENST00000453278 531 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
PHACTR1Q9C0D0 TBL1XR1-AS1-201ENST00000454723 414 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
PHACTR1Q9C0D0 AC097493.1-201ENST00000463958 372 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
PHACTR1Q9C0D0 L3HYPDH-206ENST00000487285 700 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
PHACTR1Q9C0D0 AC092673.1-201ENST00000510203 428 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
PHACTR1Q9C0D0 EGFLAM-AS2-201ENST00000512603 466 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
PHACTR1Q9C0D0 GYPA-209ENST00000512789 258 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
PHACTR1Q9C0D0 AC093305.1-201ENST00000514105 522 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
PHACTR1Q9C0D0 AC010280.3-201ENST00000515504 587 ntTSL 4 BASIC6.85□□□□□ -1.31
PHACTR1Q9C0D0 AC103718.1-201ENST00000522667 683 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
PHACTR1Q9C0D0 AC090539.1-201ENST00000523907 434 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
PHACTR1Q9C0D0 LINC01495-202ENST00000534135 343 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
PHACTR1Q9C0D0 ASB8-207ENST00000536953 923 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
PHACTR1Q9C0D0 ATP5G2-205ENST00000549748 728 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
PHACTR1Q9C0D0 AC084879.2-201ENST00000551656 369 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
PHACTR1Q9C0D0 AC090515.3-201ENST00000560431 315 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
PHACTR1Q9C0D0 NQO1-205ENST00000561500 891 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
PHACTR1Q9C0D0 PDE6G-203ENST00000571224 526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
PHACTR1Q9C0D0 AL133338.2-201ENST00000604292 736 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
PHACTR1Q9C0D0 AL359999.1-201ENST00000604513 294 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
PHACTR1Q9C0D0 GMDS-AS1-215ENST00000606884 580 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
PHACTR1Q9C0D0 Z98200.1-201ENST00000607298 470 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
PHACTR1Q9C0D0 AC092902.3-201ENST00000610060 373 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
PHACTR1Q9C0D0 BX005040.2-201ENST00000620504 370 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
PHACTR1Q9C0D0 AC024475.3-203ENST00000634971 854 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
PHACTR1Q9C0D0 AL022323.4-201ENST00000623980 13120 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
PHACTR1Q9C0D0 PEX3-201ENST00000367591 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
PHACTR1Q9C0D0 AC073130.1-201ENST00000457033 1958 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
PHACTR1Q9C0D0 SELE-203ENST00000367775 3389 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
PHACTR1Q9C0D0 MDN1-205ENST00000629399 17400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
PHACTR1Q9C0D0 CDC7-203ENST00000428239 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
PHACTR1Q9C0D0 MTRNR2L10-201ENST00000545075 1530 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
PHACTR1Q9C0D0 MIR3681HG-201ENST00000412294 2183 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
PHACTR1Q9C0D0 SERPINA9-204ENST00000424550 1462 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
PHACTR1Q9C0D0 PLD1-202ENST00000351298 5604 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
PHACTR1Q9C0D0 ZNF528-201ENST00000360465 3978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
PHACTR1Q9C0D0 CUL4B-204ENST00000404115 3264 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
PHACTR1Q9C0D0 KLHL2-210ENST00000538127 2907 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
PHACTR1Q9C0D0 MTND5P23-201ENST00000430812 1655 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
PHACTR1Q9C0D0 ADAMTS9-AS1-203ENST00000471990 1606 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
PHACTR1Q9C0D0 AC004014.2-201ENST00000623718 5122 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
PHACTR1Q9C0D0 HSP90AA2P-201ENST00000530115 2196 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
PHACTR1Q9C0D0 LINC01619-203ENST00000549802 2169 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
PHACTR1Q9C0D0 SYT14-207ENST00000629778 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
PHACTR1Q9C0D0 OR5A1-201ENST00000302030 1051 ntAPPRIS P1 BASIC6.84□□□□□ -1.31
PHACTR1Q9C0D0 RNY3P3-201ENST00000363816 102 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
PHACTR1Q9C0D0 SNORD81.2-201ENST00000365153 76 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 180 ms