Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

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Length 436 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 MED28-201ENST00000237380 10868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
SPOCK3Q9BQ16 SLCO1B7-201ENST00000421593 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
SPOCK3Q9BQ16 TMEM135-201ENST00000305494 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
SPOCK3Q9BQ16 AC005332.5-201ENST00000591222 2919 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SPOCK3Q9BQ16 GCNA-201ENST00000373695 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
SPOCK3Q9BQ16 ATF7IP-214ENST00000540793 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
SPOCK3Q9BQ16 SHC4-202ENST00000396535 2799 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
SPOCK3Q9BQ16 LINC02197-201ENST00000502659 2767 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SPOCK3Q9BQ16 NUP214-202ENST00000411637 7538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
SPOCK3Q9BQ16 FANCL-201ENST00000233741 1683 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
SPOCK3Q9BQ16 FANCL-202ENST00000402135 1698 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SPOCK3Q9BQ16 AC092447.10-201ENST00000620607 1652 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SPOCK3Q9BQ16 MDM2-203ENST00000299252 966 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
SPOCK3Q9BQ16 DEFB107A-201ENST00000335021 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
SPOCK3Q9BQ16 DEFB107B-201ENST00000355602 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
SPOCK3Q9BQ16 MDM2-207ENST00000360430 891 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
SPOCK3Q9BQ16 ARSFP1-201ENST00000398758 477 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SPOCK3Q9BQ16 RN7SKP261-201ENST00000410948 278 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SPOCK3Q9BQ16 RNU6-1148P-201ENST00000410992 104 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SPOCK3Q9BQ16 ZNRF3-IT1-201ENST00000412798 674 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SPOCK3Q9BQ16 SPRY4-AS1-201ENST00000414314 521 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SPOCK3Q9BQ16 AL162582.1-201ENST00000419196 467 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SPOCK3Q9BQ16 AC134879.1-201ENST00000426062 394 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SPOCK3Q9BQ16 PUDPP2-201ENST00000431423 643 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SPOCK3Q9BQ16 AC092013.1-201ENST00000438795 332 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SPOCK3Q9BQ16 AC097463.1-201ENST00000447288 481 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SPOCK3Q9BQ16 AL157896.1-201ENST00000451617 790 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
SPOCK3Q9BQ16 AC096543.1-201ENST00000455038 823 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SPOCK3Q9BQ16 LINC00533-201ENST00000456103 537 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SPOCK3Q9BQ16 RN7SL332P-201ENST00000482163 254 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SPOCK3Q9BQ16 RAB7A-205ENST00000485280 507 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SPOCK3Q9BQ16 AC009153.1-201ENST00000485799 496 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SPOCK3Q9BQ16 AC107398.1-201ENST00000486904 505 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SPOCK3Q9BQ16 AC078785.1-205ENST00000491578 482 ntTSL 4 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SPOCK3Q9BQ16 AC114912.1-201ENST00000503394 546 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SPOCK3Q9BQ16 AC097460.1-204ENST00000515026 764 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SPOCK3Q9BQ16 LINC02155-201ENST00000519215 407 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SPOCK3Q9BQ16 AC009902.1-201ENST00000519351 183 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SPOCK3Q9BQ16 BTF3P12-201ENST00000519620 469 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SPOCK3Q9BQ16 AC084855.1-201ENST00000528696 572 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SPOCK3Q9BQ16 ATPAF1-210ENST00000532925 998 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SPOCK3Q9BQ16 AC055720.1-201ENST00000539552 475 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SPOCK3Q9BQ16 AC079907.2-202ENST00000547004 423 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SPOCK3Q9BQ16 AC079598.1-201ENST00000548691 554 ntTSL 4 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SPOCK3Q9BQ16 AL132780.1-201ENST00000548819 556 ntTSL 4 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SPOCK3Q9BQ16 ZNF790-AS1-201ENST00000587278 653 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SPOCK3Q9BQ16 CYP2C61P-201ENST00000604072 290 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SPOCK3Q9BQ16 AC247036.1-201ENST00000605005 389 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SPOCK3Q9BQ16 ATP1B3P1-201ENST00000605365 821 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SPOCK3Q9BQ16 AC021646.1-201ENST00000605469 484 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SPOCK3Q9BQ16 AL096855.2-201ENST00000605785 369 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SPOCK3Q9BQ16 EAF1-AS1-211ENST00000610011 316 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SPOCK3Q9BQ16 AL031777.2-201ENST00000611953 196 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SPOCK3Q9BQ16 MALAT1-209ENST00000616691 587 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SPOCK3Q9BQ16 OR1N1-202ENST00000619659 939 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SPOCK3Q9BQ16 AC099494.2-201ENST00000623371 978 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SPOCK3Q9BQ16 AC092070.2-203ENST00000598377 3644 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SPOCK3Q9BQ16 DYRK1A-201ENST00000338785 5498 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
SPOCK3Q9BQ16 NT5DC1-201ENST00000319550 6923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
SPOCK3Q9BQ16 KIAA0391-203ENST00000534898 2611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
SPOCK3Q9BQ16 GABRA2-202ENST00000381620 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
SPOCK3Q9BQ16 EIF3H-209ENST00000521861 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
SPOCK3Q9BQ16 CDY1-201ENST00000306609 2321 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
SPOCK3Q9BQ16 CDY1B-201ENST00000306882 2321 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
SPOCK3Q9BQ16 ZNF3-203ENST00000303915 3473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SPOCK3Q9BQ16 MGAT4A-203ENST00000409391 2018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SPOCK3Q9BQ16 PLEKHA5-215ENST00000539256 3357 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SPOCK3Q9BQ16 DLEU7-AS1-201ENST00000413510 1806 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
SPOCK3Q9BQ16 PSG1-203ENST00000403380 1722 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SPOCK3Q9BQ16 KIF11-201ENST00000260731 4860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
SPOCK3Q9BQ16 CDH2-202ENST00000399380 3737 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SPOCK3Q9BQ16 SNTN-203ENST00000496807 3746 ntTSL 4 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SPOCK3Q9BQ16 AL357055.3-201ENST00000421157 2459 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
SPOCK3Q9BQ16 TTTY4B-201ENST00000420149 1346 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
SPOCK3Q9BQ16 TTTY4-201ENST00000436568 1346 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
SPOCK3Q9BQ16 TTTY4C-201ENST00000456123 1346 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
SPOCK3Q9BQ16 AP003486.1-201ENST00000525716 3994 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SPOCK3Q9BQ16 RAB3IP-215ENST00000551641 2840 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
SPOCK3Q9BQ16 RAD17P2-201ENST00000451754 1977 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
SPOCK3Q9BQ16 C9orf72-202ENST00000379997 1873 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
SPOCK3Q9BQ16 AC107419.1-201ENST00000422048 1879 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
SPOCK3Q9BQ16 AC006484.1-201ENST00000435086 1884 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
SPOCK3Q9BQ16 PIK3CB-208ENST00000477593 4658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
SPOCK3Q9BQ16 B3GNT5-206ENST00000465010 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
SPOCK3Q9BQ16 TMED3-202ENST00000424155 16555 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
SPOCK3Q9BQ16 LMO7-207ENST00000465261 5580 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
SPOCK3Q9BQ16 FRMPD2-213ENST00000636244 4194 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
SPOCK3Q9BQ16 MEIOC-202ENST00000409464 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
SPOCK3Q9BQ16 ENPP3-203ENST00000414305 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
SPOCK3Q9BQ16 FHL1-204ENST00000370683 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
SPOCK3Q9BQ16 ARF4-206ENST00000489843 1360 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
SPOCK3Q9BQ16 AGXT2-201ENST00000231420 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
SPOCK3Q9BQ16 ZNF430-201ENST00000261560 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
SPOCK3Q9BQ16 SELE-203ENST00000367775 3389 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
SPOCK3Q9BQ16 Y_RNA.81-201ENST00000362997 102 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
SPOCK3Q9BQ16 RNA5SP238-201ENST00000365464 120 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
SPOCK3Q9BQ16 RNA5SP88-201ENST00000365560 109 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
SPOCK3Q9BQ16 SNORA32.2-201ENST00000384049 122 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
SPOCK3Q9BQ16 RNU6-187P-201ENST00000384139 106 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
SPOCK3Q9BQ16 Y_RNA.447-201ENST00000384184 113 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
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