Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 AC091953.3-201ENST00000623220 236 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 AC091905.4-201ENST00000623432 202 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 AC138965.3-201ENST00000623875 498 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 AL121594.5-201ENST00000631724 573 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 OR1E1-201ENST00000322608 1307 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 FAM26D-202ENST00000368597 1311 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 Z95331.1-201ENST00000623075 23112 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 HHLA2-210ENST00000491820 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 RGS6-204ENST00000404301 1497 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 RGS6-206ENST00000407322 1497 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 VWC2L-202ENST00000427124 4480 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 PSG1-201ENST00000244296 2276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 AC139769.2-201ENST00000599944 2291 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 HEMGN-202ENST00000616898 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 GRID2-208ENST00000611049 4844 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 AC245100.2-201ENST00000454544 1679 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
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ZNF548Q8NEK5 LMNTD1-201ENST00000282881 1718 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 NRXN1-242ENST00000635519 3553 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 PCDH15-217ENST00000414778 9234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 PCDH15-227ENST00000614895 9249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 DAZ1-206ENST00000620725 1891 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 UACA-211ENST00000560441 4723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 FAT3-201ENST00000409404 19030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 OR8J2-201ENST00000641465 2883 ntAPPRIS P1 BASIC5.11□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 RAB18-209ENST00000621805 4894 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 WDR63-201ENST00000294664 2995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 RPGRIP1-201ENST00000382933 2004 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 RCOR3-201ENST00000367005 4246 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 MGP-201ENST00000228938 694 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 C11orf74-201ENST00000334307 863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
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ZNF548Q8NEK5 AL603962.1-201ENST00000413148 436 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
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ZNF548Q8NEK5 AC010099.3-201ENST00000423896 409 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
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ZNF548Q8NEK5 GYPE-202ENST00000437468 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
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ZNF548Q8NEK5 MAMDC2-AS1-201ENST00000377178 1504 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 AC120338.1-201ENST00000625074 1541 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
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ZNF548Q8NEK5 TMLHE-AS1-201ENST00000433624 1702 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 MYBPC1-201ENST00000361466 3899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
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ZNF548Q8NEK5 ZFX-211ENST00000539115 6801 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 SELL-201ENST00000236147 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
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ZNF548Q8NEK5 CKAP5-210ENST00000529230 7121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 SLCO1A2-201ENST00000307378 7682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 MTERF1-203ENST00000419292 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 PHLDB2-214ENST00000495180 4159 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 RIMS2-205ENST00000436393 4384 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 FGF13-202ENST00000315930 19519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 OR5AS1-201ENST00000313555 975 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 ZNF534-202ENST00000332323 2086 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
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