Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 OR1E1-201ENST00000322608 1307 ntAPPRIS P1 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 ERVFRD-3-201ENST00000578561 1617 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 AC073136.1-201ENST00000449426 2884 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 RNU4-75P-201ENST00000364621 146 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 R3HCC1L-204ENST00000370586 941 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 MIR513B-201ENST00000385136 84 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 TRAJ58-201ENST00000390481 63 ntAPPRIS P1 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 SLC9B1P2-201ENST00000398120 1184 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 AF130351.1-202ENST00000400562 808 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 AL133264.1-201ENST00000407157 562 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 AL590609.3-201ENST00000411815 210 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 AC073071.1-201ENST00000412410 388 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 P2RY10P2-201ENST00000416730 913 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 DIAPH3-AS1-201ENST00000422052 428 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 AC007064.3-201ENST00000422608 359 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 MTCYBP5-201ENST00000423752 1135 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 AL390774.2-201ENST00000423942 788 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 AC066595.1-201ENST00000426697 399 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 AC068481.1-202ENST00000428379 555 ntTSL 4 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 MTND4LP14-201ENST00000429447 288 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 AC007422.1-201ENST00000433065 1008 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 GAPDHP58-201ENST00000438477 1006 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 AC118469.1-201ENST00000442943 488 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 NAP1L1P3-201ENST00000462291 880 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 AC021660.1-201ENST00000465006 554 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 LINC01192-206ENST00000489012 818 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 LINC02513-201ENST00000503465 500 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 ENPP7P11-201ENST00000505915 627 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 MEF2C-AS1-212ENST00000514158 713 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 SNORA19.3-201ENST00000516165 130 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 AC100802.1-201ENST00000519197 1026 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 CPSF7-220ENST00000541963 549 ntTSL 4 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 PCED1B-AS1-210ENST00000552975 378 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 AC024909.2-201ENST00000553035 286 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 DUXAP6-201ENST00000553858 601 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 AC114546.1-201ENST00000560140 473 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 PDCD6IPP2-207ENST00000566321 1069 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 AC010761.5-201ENST00000579468 287 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 MIR4443-201ENST00000585052 53 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 AC121247.2-201ENST00000604776 136 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 AL451049.1-201ENST00000608672 497 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 AP003499.2-201ENST00000624100 483 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 LAMTOR5-AS1-233ENST00000625451 470 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 FRG1EP-201ENST00000634469 770 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 GHR-207ENST00000537449 4419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 PROX1-205ENST00000498508 8498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 DPP8-203ENST00000341861 8699 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 GPALPP1-201ENST00000357537 5368 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 TEX26-201ENST00000380473 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 SLC10A7-203ENST00000432059 3747 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 OR2T7-202ENST00000641557 3409 ntAPPRIS P1 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 ZNF573-208ENST00000536220 2257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 MTND4P29-201ENST00000503122 1372 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 IL7R-201ENST00000303115 4626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 TEK-205ENST00000615002 4666 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 DYNC1I2-201ENST00000340296 2589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 NRXN1-242ENST00000635519 3553 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 EAF2-201ENST00000273668 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 SPATA42-201ENST00000369989 535 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 BMS1P3-201ENST00000372011 932 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 OR1L6-202ENST00000373684 1044 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 AL645927.1-201ENST00000396783 406 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 C2orf73-203ENST00000405749 576 ntTSL 4 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 AL358178.1-201ENST00000407698 397 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 U3.36-201ENST00000408418 213 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 Z93403.1-201ENST00000411879 895 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 LINC00342-201ENST00000412393 654 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 GNG12-AS1-202ENST00000414904 796 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 AC013472.2-201ENST00000416226 306 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 TEX41-203ENST00000420472 765 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 AC013262.1-201ENST00000426710 252 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 OR5K2-201ENST00000427338 1060 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 FSIP2-AS1-201ENST00000429929 440 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 FAM53B-AS1-201ENST00000432699 558 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 LINC01052-201ENST00000437777 496 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 AC018467.1-203ENST00000440785 506 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 LARS2-AS1-201ENST00000442534 575 ntTSL 4 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 AL035701.1-201ENST00000444038 462 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 AL929288.2-201ENST00000446368 407 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 AC091212.1-201ENST00000474798 395 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 CBX1P5-201ENST00000475330 559 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 RPL7AP6-201ENST00000477943 801 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 AC004453.1-201ENST00000487895 408 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 SNRPCP2-201ENST00000504370 475 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 AC104803.1-201ENST00000506917 529 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 AC019133.1-201ENST00000508292 420 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 AC079921.1-201ENST00000509449 946 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 AC108467.1-201ENST00000515623 672 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 RNU4-18P-201ENST00000516751 149 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 AC087855.1-201ENST00000518178 430 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 NECAB1-205ENST00000522820 811 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 AC007876.1-201ENST00000527562 983 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 AP003066.2-201ENST00000529375 555 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 AC022880.1-201ENST00000534017 973 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 AC007527.1-201ENST00000535528 313 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 AC024940.3-201ENST00000538551 316 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 AL358913.1-201ENST00000554342 121 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 AC011825.2-201ENST00000583138 553 ntTSL 4 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 AC008543.4-201ENST00000585694 442 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 AC083760.1-201ENST00000589621 670 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
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