Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Length 790 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 FO393401.1-201ENST00000453914 600 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 AC090833.1-202ENST00000511073 781 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 HMGB1P47-201ENST00000511281 589 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 AC073429.1-201ENST00000511749 503 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 AC034244.2-201ENST00000514668 858 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 RNA5SP249-201ENST00000516127 99 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 RNU6-889P-201ENST00000517189 103 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 AP001775.2-201ENST00000531710 334 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 RN7SL652P-201ENST00000577769 300 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 AC068790.7-201ENST00000602347 528 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 AL133247.2-201ENST00000603236 482 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 IGKV2OR2-2-201ENST00000605025 300 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 BNIP3P41-202ENST00000616656 861 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 AP000346.3-201ENST00000622821 210 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 AC021106.3-201ENST00000623925 531 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 AP003499.2-201ENST00000624100 483 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 LINC01002-236ENST00000634022 378 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 AC073869.10-201ENST00000642016 354 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 AC104260.2-201ENST00000623551 3497 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 TCEANC-201ENST00000380600 2988 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 PLS1-211ENST00000497002 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 AC010300.1-201ENST00000600671 5134 ntBASIC4.84□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 AL121950.1-201ENST00000624993 2077 ntBASIC4.84□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 TRIM69-201ENST00000329464 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 AC019197.1-201ENST00000638199 3611 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 ARHGAP42-203ENST00000524892 5685 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 CUL2-209ENST00000537177 4271 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 SCGB2A2-202ENST00000525380 1305 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 RAP1B-201ENST00000250559 13438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 PRR4-201ENST00000228811 563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 RNA5SP443-201ENST00000363083 132 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 XAGE1A-202ENST00000375600 474 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 XAGE1B-202ENST00000375613 474 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 TRPM3-206ENST00000377097 554 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 MT-TP-201ENST00000387461 68 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 NRG4-201ENST00000394907 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 AL590762.2-201ENST00000395798 571 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 U3.35-201ENST00000408405 208 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 E2F6P2-201ENST00000420708 748 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 DPYD-AS2-201ENST00000422259 788 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 AL627224.1-201ENST00000448334 444 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 TPT1P13-201ENST00000449760 499 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 AP001596.1-202ENST00000452460 644 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 ZFRP1-201ENST00000457579 2970 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 TPT1P1-201ENST00000458495 518 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 AC026347.1-201ENST00000463255 474 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 ARHGEF3-AS1-201ENST00000477246 489 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 CREM-238ENST00000488741 651 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 AC025164.1-201ENST00000496249 478 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 KRTAP5-14P-201ENST00000502328 121 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 LINC02215-201ENST00000503320 543 ntTSL 4 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 AC104036.1-201ENST00000523550 611 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 AC109635.6-201ENST00000525487 1113 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 AP000859.1-201ENST00000525536 307 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 MS4A7-208ENST00000530234 730 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 PRR4-206ENST00000540107 388 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 SNHG1-218ENST00000541615 748 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 DAB1-AS1-208ENST00000586465 748 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 AC006272.2-201ENST00000594725 163 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 AC007423.1-201ENST00000605009 627 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 AC005014.3-201ENST00000605985 190 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 MIR7703-201ENST00000620784 77 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 SYT14-206ENST00000537238 5208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 ZNF442-205ENST00000545749 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 VCAM1-203ENST00000370115 2475 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 STAP1-201ENST00000265404 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 MTCO1P15-201ENST00000529569 1526 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 TC2N-203ENST00000435962 5146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 SLC13A1-201ENST00000194130 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 R3HDM1-203ENST00000409606 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 PPP1R9A-201ENST00000289495 3983 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 HIST1H2BD-201ENST00000289316 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 Y_RNA.110-201ENST00000363220 99 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 SNORA56-201ENST00000383966 129 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 CCNB2P1-201ENST00000399411 1150 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 RPS3AP23-201ENST00000401762 784 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 GSTA12P-201ENST00000402398 508 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 AL121885.1-201ENST00000417957 451 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 AC092570.3-201ENST00000420113 693 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 ARHGAP26-IT1-201ENST00000433186 388 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 AC093716.1-201ENST00000435923 377 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 AL512625.3-204ENST00000438699 1031 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 AC245517.2-201ENST00000442890 346 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 CEACAMP6-201ENST00000452007 574 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 HNRNPDLP3-201ENST00000456745 380 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 AC090142.1-201ENST00000465776 462 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 AC104831.1-201ENST00000470024 444 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 LINC02438-201ENST00000505347 641 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 AC093720.1-201ENST00000505681 714 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 LINC02383-201ENST00000508563 582 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 SETP12-201ENST00000514068 805 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 CASP1-206ENST00000526568 1061 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 LINC02553-201ENST00000529088 734 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 AC087888.1-201ENST00000550884 1254 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 AC025035.1-201ENST00000551571 894 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 AL358913.1-201ENST00000554342 121 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 AC087477.6-201ENST00000559595 843 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 LINC00557-201ENST00000563184 1279 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 MIR3936-201ENST00000584304 110 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 AC135803.1-201ENST00000608748 565 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
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