Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 PARPBP-212ENST00000543784 992 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CUL4AQ13619 LINC02416-201ENST00000550019 540 ntTSL 4 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CUL4AQ13619 LINC01619-209ENST00000552277 571 ntTSL 4 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CUL4AQ13619 LINC00871-202ENST00000556071 554 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CUL4AQ13619 AC016987.1-201ENST00000558587 499 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CUL4AQ13619 AC036103.1-201ENST00000563846 823 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CUL4AQ13619 AC027455.1-201ENST00000574104 594 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CUL4AQ13619 DPRXP4-201ENST00000578053 568 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CUL4AQ13619 MIR4489-201ENST00000578869 62 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CUL4AQ13619 HMGB2P1-201ENST00000591146 634 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CUL4AQ13619 AC023762.1-201ENST00000603280 584 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CUL4AQ13619 EAF1-AS1-211ENST00000610011 316 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CUL4AQ13619 LINC02340-201ENST00000610335 626 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CUL4AQ13619 AP004607.9-201ENST00000618202 316 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CUL4AQ13619 AP001005.3-201ENST00000622049 129 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CUL4AQ13619 METTL8-218ENST00000638989 876 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CUL4AQ13619 KCNRG-202ENST00000360473 1623 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
CUL4AQ13619 ZNF90P1-201ENST00000480493 1951 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CUL4AQ13619 AL590763.1-201ENST00000398297 1545 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CUL4AQ13619 ADAM29-203ENST00000445694 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
CUL4AQ13619 CXADR-205ENST00000400169 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CUL4AQ13619 LINC01630-206ENST00000635103 4292 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CUL4AQ13619 SON-204ENST00000381692 2463 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
CUL4AQ13619 CTAGE5-208ENST00000553352 3441 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
CUL4AQ13619 INTU-201ENST00000335251 13233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
CUL4AQ13619 DNAH6-202ENST00000389394 12795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.53
CUL4AQ13619 BNIP3L-202ENST00000518611 1352 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CUL4AQ13619 KCTD16-201ENST00000507359 13950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
CUL4AQ13619 CSMD3-203ENST00000343508 13018 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
CUL4AQ13619 GKN2-201ENST00000328895 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
CUL4AQ13619 CXorf66-201ENST00000370540 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
CUL4AQ13619 RNU6ATAC7P-201ENST00000408111 127 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CUL4AQ13619 AL603962.1-201ENST00000413148 436 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CUL4AQ13619 AC105402.1-201ENST00000413336 545 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CUL4AQ13619 RPL21P108-201ENST00000413857 481 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CUL4AQ13619 AC093158.1-201ENST00000415549 791 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CUL4AQ13619 AC079355.1-201ENST00000421770 223 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CUL4AQ13619 AC004415.1-201ENST00000422697 449 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CUL4AQ13619 AL109761.1-201ENST00000428689 422 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CUL4AQ13619 AL133268.3-201ENST00000428903 577 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CUL4AQ13619 OR2B7P-201ENST00000429302 934 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CUL4AQ13619 RPL17P35-201ENST00000432217 549 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CUL4AQ13619 AL590762.3-201ENST00000436372 640 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CUL4AQ13619 AC012442.1-201ENST00000436885 529 ntTSL 4 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CUL4AQ13619 AC112498.1-201ENST00000444401 332 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CUL4AQ13619 EEF1B2P5-201ENST00000444820 548 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CUL4AQ13619 LINC00189-203ENST00000447125 783 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CUL4AQ13619 TRY2P-201ENST00000448860 689 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CUL4AQ13619 AL591363.1-201ENST00000450091 483 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
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CUL4AQ13619 AC004692.2-202ENST00000458680 478 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CUL4AQ13619 AC022795.1-201ENST00000473808 480 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CUL4AQ13619 AC090013.1-201ENST00000485147 480 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CUL4AQ13619 AC093890.1-201ENST00000502554 540 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CUL4AQ13619 F11-AS1-201ENST00000505103 1178 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
CUL4AQ13619 AC025741.1-201ENST00000506100 544 ntTSL 4 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CUL4AQ13619 AC106872.4-201ENST00000510050 523 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CUL4AQ13619 COMMD10-206ENST00000515539 869 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CUL4AQ13619 RNA5SP92-201ENST00000516437 110 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CUL4AQ13619 RN7SKP66-201ENST00000516681 231 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CUL4AQ13619 AC004801.3-201ENST00000547602 962 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
CUL4AQ13619 AL137129.1-201ENST00000555937 720 ntTSL 4 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CUL4AQ13619 AC124856.1-201ENST00000600819 896 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CUL4AQ13619 MIR99AHG-211ENST00000602323 475 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CUL4AQ13619 AP002360.3-201ENST00000607673 710 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CUL4AQ13619 AC007342.8-201ENST00000623278 678 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CUL4AQ13619 OR8B2-202ENST00000641451 1056 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CUL4AQ13619 AL596275.2-204ENST00000641628 552 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CUL4AQ13619 AL596275.2-206ENST00000641957 626 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CUL4AQ13619 PDCD1LG2-201ENST00000397747 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
CUL4AQ13619 ESRRG-202ENST00000360012 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
CUL4AQ13619 MAPK10-236ENST00000638313 3971 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CUL4AQ13619 CLHC1-203ENST00000406076 1777 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
CUL4AQ13619 DCN-201ENST00000052754 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
CUL4AQ13619 SLCO1C1-201ENST00000266509 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
CUL4AQ13619 PGM3-211ENST00000512866 2013 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
CUL4AQ13619 STARD4-201ENST00000296632 4606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CUL4AQ13619 AC004982.1-201ENST00000608770 1655 ntTSL 4 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CUL4AQ13619 DLG1-216ENST00000450955 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CUL4AQ13619 VEZT-201ENST00000261219 3435 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CUL4AQ13619 AL031320.2-201ENST00000591892 2079 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CUL4AQ13619 TPRG1-201ENST00000345063 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
CUL4AQ13619 NABP1-205ENST00000425611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CUL4AQ13619 AL353784.1-201ENST00000422842 2300 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CUL4AQ13619 RNU4-4P-201ENST00000364588 130 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CUL4AQ13619 CFHR4-203ENST00000367418 1066 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CUL4AQ13619 OR51F1-201ENST00000380383 960 ntAPPRIS P5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CUL4AQ13619 HDGFP1-201ENST00000405943 252 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CUL4AQ13619 ERI3-IT1-201ENST00000414156 619 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CUL4AQ13619 AC096711.3-201ENST00000420721 582 ntTSL 4 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CUL4AQ13619 MORF4L1P7-201ENST00000426038 703 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CUL4AQ13619 LARS2-AS1-201ENST00000442534 575 ntTSL 4 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CUL4AQ13619 RPS26P39-201ENST00000469206 341 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CUL4AQ13619 LINC01206-203ENST00000476815 482 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CUL4AQ13619 AC092691.3-201ENST00000482766 510 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CUL4AQ13619 AC108022.1-201ENST00000493466 478 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CUL4AQ13619 AC025459.1-201ENST00000504072 156 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CUL4AQ13619 ADGRL3-AS1-202ENST00000504135 542 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CUL4AQ13619 AC010468.3-201ENST00000508225 458 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
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